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IgG4関連疾患におけるRNA-Seqを用いた遺伝子発現解析と新規治療標的の開発

使用 RNA-Seq 进行基因表达分析并开发 IgG4 相关疾病的新治疗靶点

基本信息

批准号：
21K08471
负责人：
坪井洋人
金额：
$ 2.66万
依托单位：
University of Tsukuba
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K08471/
关键词：
IgG4関連疾患顎下腺 RNA-Seq 主成分分析パスウェイ解析

项目摘要

RNA-Seqを用いて、IgG4関連疾患（IgG4-RD）の病変局所と末梢血間でT/B細胞特異的発現変動遺伝子（DEG）を明らかにするため、以下の解析を行った。無治療のIgG4-RD確診例（2011年包括診断基準による）（N=3）から、組織学的基準を満たす顎下腺、末梢血単核球（PBMC）を採取し、Magnetic-Activated Cell Separation（MACS）でCD3+T細胞、CD19+B細胞を分離した。顎下腺とPBMCの間で、T/B細胞の遺伝子発現をRNA-Seqで比較し、1）主成分分析（PCA）によるクラスタリングとDEGの抽出、2）Ingenuity Pathway Analysis（IPA）を用いたパスウェイ解析、3）抽出したDEGに関して定量PCRによるvalidationを行った。1）PCAでは顎下腺T/B細胞と末梢血T/B細胞の遺伝子発現パターンはそれぞれ異なっていた。末梢血と比較し、顎下腺T細胞で発現増加したDEGは214個、減少したDEGは50個、顎下腺B細胞で発現増加したDEGは630個、減少したDEGは109個であった。顎下腺で発現増加したDEGには、複数のサイトカイン、ケモカイン、転写因子が含まれていた。2）顎下腺T細胞ではTh1、Th2、IL-17、全身性エリテマトーデス（SLE）、Toll like receptor（TLR）、wound healingシグナルの亢進が認められた。顎下腺B細胞ではSLE、補体経路、線維化、IL-8、IL-15シグナルの亢進が認められた。3）顎下腺T細胞では、末梢血と比較して、IL-21、EGR2のmRNA発現は有意に増加していた。以上の結果より、RNA-Seqを用いてIgG4-RD病変局所のT/B細胞で発現変動した遺伝子が同定され、病態への関与が示唆されるパスウェイが抽出された。

With the use of RNA-Seq, T/B cell-specific expression of motor genes (DEG) in the pathogenesis of IgG4-related diseases (IgG4-RD) and peripheral blood will be clarified. The following analysis will be carried out. For confirmed cases of IgG4-RD without treatment (including diagnostic benchmarks in 2011)(N=3), histological benchmarks were taken from the submandibular gland and peripheral blood mononuclear cells (PBMC), and CD3 +T cells and CD19 +B cells were isolated through Magnetic-Activated Cell Separation (MACS). RNA-Seq comparison of submandibular gland and PBMC, T/B cell gene expression, 1) principal component analysis (PCA), 2) Ingenuity Pathway Analysis (IPA), and 3) validation of DEG. 1) PCA is the expression of T/B cells in mandibular gland and T/B cells in peripheral blood. The number of DEG T cells in peripheral blood increased by 214, while the number of DEG B cells decreased by 50. The number of DEG B cells increased by 630, while the number of DEG B cells decreased by 109. Submandibular gland development increases DEG, multiple submandibular gland development increases DEG, submandibular gland 2) Submandibular T cells Th1, Th2, IL-17, systemic SLE, Toll like receptor (TLR), wound healing, hyperactivity Submandibular B cells are hyperactive in SLE, complement pathway, angiogenesis, IL-8 and IL-15. 3) The expression of IL-21 and EGR-2 mRNA in T cells of mandibular gland increased significantly in comparison with that in peripheral blood. The results showed that RNA-Seq was used to detect T/B cells in IgG4-RD, and the expression of T/B cells in IgG4-RD was stable.

项目成果

期刊论文数量（4）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

使用 RNA-Seq 鉴定 IgG4 相关疾病病变中 T/B 细胞特异性表达可变基因

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
坪井洋人;本田文香;安部沙織;高橋広行;近藤裕也;松本功;住田孝之
通讯作者：
住田孝之

利用RNA-Seq鉴定IgG4相关唾液腺炎病变中T/B细胞特异性差异表达基因并进行通路分析

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
坪井洋人;浅島弘充;東光裕史;本田文香;安部沙織;高橋広行;近藤裕也;松本功;住田孝之
通讯作者：
住田孝之

New era of molecular targeted therapy for IgG4-related disease

IgG4相关疾病分子靶向治疗新时代

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Hiroto Tsuboi;Fumika Honda;Hirofumi Toko;Ayako Kitada;Yuya Kondo;Takayuki Sumida;and Isao Matsumoto
通讯作者：
and Isao Matsumoto

IgG4関連疾患におけるステロイド治療後の再燃例の検討

IgG4相关疾病类固醇治疗后复发病例的检查