IgG4関連疾患におけるRNA-Seqを用いた遺伝子発現解析と新規治療標的の開発

使用 RNA-Seq 进行基因表达分析并开发 IgG4 相关疾病的新治疗靶点

• 批准号: 21K08471
• 负责人: 坪井 洋人
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: University of Tsukuba
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K08471/
• 关键词: IgG4関連疾患; 顎下腺; RNA-Seq; 主成分分析; パスウェイ解析

RNA-Seqを用いて、IgG4関連疾患（IgG4-RD）の病変局所と末梢血間でT/B細胞特異的発現変動遺伝子（DEG）を明らかにするため、以下の解析を行った。無治療のIgG4-RD確診例（2011年包括診断基準による）（N=3）から、組織学的基準を満たす顎下腺、末梢血単核球（PBMC）を採取し、Magnetic-Activated Cell Separation（MACS）でCD3+T細胞、CD19+B細胞を分離した。顎下腺とPBMCの間で、T/B細胞の遺伝子発現をRNA-Seqで比較し、1）主成分分析（PCA）によるクラスタリングとDEGの抽出、2）Ingenuity Pathway Analysis（IPA）を用いたパスウェイ解析、3）抽出したDEGに関して定量PCRによるvalidationを行った。1）PCAでは顎下腺T/B細胞と末梢血T/B細胞の遺伝子発現パターンはそれぞれ異なっていた。末梢血と比較し、顎下腺T細胞で発現増加したDEGは214個、減少したDEGは50個、顎下腺B細胞で発現増加したDEGは630個、減少したDEGは109個であった。顎下腺で発現増加したDEGには、複数のサイトカイン、ケモカイン、転写因子が含まれていた。2）顎下腺T細胞ではTh1、Th2、IL-17、全身性エリテマトーデス（SLE）、Toll like receptor（TLR）、wound healingシグナルの亢進が認められた。顎下腺B細胞ではSLE、補体経路、線維化、IL-8、IL-15シグナルの亢進が認められた。3）顎下腺T細胞では、末梢血と比較して、IL-21、EGR2のmRNA発現は有意に増加していた。以上の結果より、RNA-Seqを用いてIgG4-RD病変局所のT/B細胞で発現変動した遺伝子が同定され、病態への関与が示唆されるパスウェイが抽出された。

进行了以下分析，以阐明IgG4相关疾病（IgG4-RD）以及外周血之间的局部病变和外周血之间的T/B特异性表达变异基因（DEG）。从未处理的IgG4-RD病例（根据2011年的全面诊断标准）（n = 3），使用磁性细胞分离（使用磁性细胞分离）分离出，使用磁性细胞和CD19+ B细胞（使用磁性细胞分离），使用未经处理的IgG4-RD病例（根据2011年全面的诊断标准）从未处理的IgG4-RD病例中收集了满足组织学标准的下颌下腺（PBMC）。使用RNA-SEQ，1）通过主成分分析（PCA），2）使用Ingenuity途径分析（IPA）（IPA）和3）通过定量PCR比较了T/B细胞的基因表达，使用RNA-SEQ，1）聚类和DEG提取。 1）下颌下腺T/B细胞和外周血T/B细胞的基因表达模式在PCA中有所不同。与外周血液相比，在下颌T细胞中表达了214摄氏度，在下颌下B细胞中表达50个降解，630摄氏度和109降低的DEG。下颌下腺表达增加的DEG包含多种细胞因子，趋化因子和转录因子。 2）在下颌T细胞中观察到TH1，TH2，IL-17，全身性红斑狼疮（SLE），Toll样受体（TLR）和伤口愈合信号。在下颌B细胞中观察到SLE，补体途径，纤维化以及IL-8和IL-15信号。 3）在下颌下T细胞中，与外周血相比，IL-21和EGR2的mRNA表达显着增加。从上述结果中，使用RNA-seq鉴定出在局部IgG4-RD损伤下在T/B细胞中表达的基因，并提取了提取病理学参与的途径。

项目成果

RNA-Seqを用いたIgG4関連疾患病変局所のT/B細胞特異的発現変動遺伝子の同定

使用 RNA-Seq 鉴定 IgG4 相关疾病病变中 T/B 细胞特异性表达可变基因

• 发表时间: 2021
• 作者: 坪井洋人;本田文香;安部沙織;高橋広行;近藤裕也;松本功;住田孝之
• 通讯作者: 住田孝之

RNA-Seqを用いたIgG4関連唾液腺炎病変局所のT/B細胞特異的発現変動遺伝子の同定とパスウェイ解析

利用RNA-Seq鉴定IgG4相关唾液腺炎病变中T/B细胞特异性差异表达基因并进行通路分析

• 发表时间: 2022
• 作者: 坪井洋人;浅島弘充;東光裕史;本田文香;安部沙織;高橋広行;近藤裕也;松本功;住田孝之
• 通讯作者: 住田孝之

IgG4関連疾患におけるステロイド治療後の再燃例の検討

IgG4相关疾病类固醇治疗后复发病例的检查

• 发表时间: 2021
• 作者: 田渕大貴;坪井洋人;杉田稔貴;西山泰平;寺崎真由;岡本翔太;寺崎俊彦;清水優;本田文香;栁下瑞希;藏田泉;大山綾子;安部沙織;長田侑;髙橋広行;萩原晋也;近藤裕也;住田孝之;松本功
• 通讯作者: 松本功

New era of molecular targeted therapy for IgG4-related disease

IgG4相关疾病分子靶向治疗新时代

• 发表时间: 2022
• 作者: Hiroto Tsuboi;Fumika Honda;Hirofumi Toko;Ayako Kitada;Yuya Kondo;Takayuki Sumida;and Isao Matsumoto
• 通讯作者: and Isao Matsumoto