乳がんのネオアンチゲンにおけるHLA Class II拘束性ペプチドの網羅的探索

乳腺癌新抗原中HLA II类限制性肽的全面搜索

基本信息

批准号：
21K08614
负责人：
坂東裕子
金额：
$ 2.75万
依托单位：
University of Tsukuba
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K08614/
关键词：
neoantigen HLA class II 抗腫瘍免疫乳癌 public neoantigen HLA class II拘束性ペプチド HLA Class II拘束性ペプチド MHC-density assay

项目摘要

本研究の目的は、ホルモン感受性（HR+）難治性乳癌のpublic neoantigenからHLA class IIに提示されうるペプチド配列を見出すことである。抗腫瘍免疫には細胞傷害性T細胞だけでなくHLA class IIとヘルパーT細胞による免疫応答も中心的な役割を担うことがよく知られているが、HR+難治性乳癌が免疫療法の標的となるかは明らかにされていない。患者間共通のpublic neoantigenの中からT細胞に認識されるHLA class II拘束性ペプチドが同定されれば、汎用性の高い治療標的となりうる。そこで、HLA class IIとHR+乳癌で共有されるpublic neoantigenとの相互作用を測定し標的可能性を探索した。これまでにHLA class II拘束性ペプチドを計算機上で予測するアルゴリズムの開発が行われているが、予測精度が低いことが長年の課題であった。本研究ではHLA class II-ペプチド複合体の安定性を細胞表面発現量で評価する新規測定系を用いて、HLA class IIが提示しうるpublic neoantigenを探索する。令和3年度は、HR+難治性乳癌で共有されるpublic neoantigenから設計した変異ペプチドとHLA class IIとの結合性を新規測定系を用いて評価した。令和４年度は、結合性が高いと予測された領域に関して野生型配列との結合性を比較し、低い領域はHLA class IIアレルを変更して結合性を再評価した。また、T細胞による認識の有無（免疫原性）を確認するため、変異ペプチドと強い結合を示すHLA class IIアレルを有する健常ドナーの末梢血単核細胞(PBMC)を用いてEnzyme-Linked ImmunoSpot (ELISpot)アッセイを行うための予備検討を開始した。

这项研究的目的是找到可以在激素敏感（HR+）难治性乳腺癌中的HLA II类中呈现的肽序列。众所周知，HLA II类和辅助助手T细胞的免疫反应不仅在抗肿瘤免疫中起着核心作用，而且还没有确定HR+难治性乳腺癌是免疫疗法的目标。如果从患者常见的公共新抗原中鉴定出T细胞识别出的HLA II类限制性肽，则它们可能成为高度用途的治疗靶标。因此，我们测量了HLA II类与HR+乳腺癌之间共享的公共新抗原之间的相互作用，并探讨了潜在的靶标。到目前为止，已经开发了用于预测计算机上HLA II类约束肽的算法，但是低预测准确性一直是长期以来的挑战。在这项研究中，我们使用了一种新的测定系统，该系统通过细胞表面表达水平评估HLA II类肽复合物的稳定性来探索HLA II类可以呈现的公共新抗原。在2021年，使用新型测定系统评估了HLA II类与由HR+难治性乳腺癌共享的公共新抗原设计的突变肽的结合特性。在2022年，将结合特性与预测为高度结合的区域的野生型序列进行了比较，并通过修改较低区域的HLA II类等位基因来重新评估结合特性。此外，为了确认是否识别出T细胞（免疫原性），我们开始了一项初步研究，使用外周血单核细胞（PBMC）从健康供体中进行酶联免疫疗法（ELISPOT）测定法，其HLA II类别II类等位基因具有与突变型甲壳虫结合强的HLA II类等位基因。