陸上植物において側生葉状器官の獲得を可能にした根幹原理の探索と解析
陸上植物において側生葉状器官の獲得を可能にした根幹原理の探索と解析
批准号:
20K06682
负责人:
中山 北斗
金额:
$2.66万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-01 至 2024-03-31
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本研究計画は、陸上植物において葉の獲得を可能にした分子機構を世界に先駆けて明らかにしようとするものである。応募者は、これまでその詳細が全くの謎であった葉の獲得を可能にした分子機構を、進化学的観点から複数の植物群を選択し、分子生物学的手法、インフォマティクスなどを駆使して、この課題の理解を進める計画である。これまでの解析で、現存する被子植物の系統樹上で最基部に位置し、単葉を形成するアンボレラ(Amborella trichopoda)とシロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)の葉原基からのRNA-seqデータをを比較し、これら2種の葉原基の遺伝子発現プロファイルは、系統的に離れた2種であっても、その基本的な部分に関しては類似していることが示唆された。そこで2022年度は、その発生プログラムが陸上植物の系統樹上でどこまで遡ることができるかを検討した。具体的には、Phylostratigraphic analysisという方法で、葉の発生に関わる遺伝子群の獲得時期を推定した。これにより、アンボレラやシロイヌナズナが含まれる被子植物の葉の発生に関わる遺伝子群は、陸上植物の基部系統の時点でその多くが獲得されていることが示唆された。また、被子植物以外にも、コケ植物や、小葉類、裸子植物などに見られる側生葉状器官についても同様の解析を行ない、それぞれの系統における葉の獲得とその進化過程についても新たな知見を得るべく解析を進めた。
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現生被子植物の最基部で分岐した系統であるAmborella trichopodaを用いたトランスクリプトーム解析
使用现代被子植物最基本的分支谱系 Amborella trichopoda 进行转录组分析
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[中山北斗, 塚谷裕一]
通讯作者:
塚谷裕一
被子植物の葉の獲得とその形態の多様化に関する進化発生生物学研究
被子植物叶片获取和形态多样化的进化和发育生物学研究
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[山田真弓, 中山北斗]
通讯作者:
中山北斗
Leaf shape is a predictor of fruit quality and cultivar performance in tomato
叶子形状是番茄果实品质和品种性能的预测因子
DOI:
10.1111/nph.16403
发表时间:
2020
期刊:
New Phytologist
影响因子:
9.4
作者:
[Rowland Steven D., Zumstein Kristina, Nakayama Hokuto, Cheng Zizhang, Flores Amber M., Chitwood Daniel H., Maloof Julin N., Sinha Neelima R.]
通讯作者:
Sinha Neelima R.
現生被子植物の系統樹上で最基部に位置するAmborella trichopodaを用いた葉の獲得に関わる進化発生学的研究
使用位于现代被子植物系统发育树基础的毛足安博氏菌 (Amborella trichopoda) 进行叶子获取的进化和胚胎学研究。
DOI:
--
发表时间:
2020
期刊:
影响因子:
--
作者:
[中山北斗, 塚谷裕一]
通讯作者:
塚谷裕一
DOI:
10.1093/plcell/koac118
发表时间:
2022-07-04
期刊:
The Plant cell
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 7 条
被子植物において葉の獲得を可能にした分子機構とその進化過程の解明
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批准号:24K09483
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.91万
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财政年份:2024
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负责人:中山 北斗
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依托单位:
被子植物において葉の獲得を可能にした分子基盤の解明
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批准号:20KK0340
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项目类别:Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (A))
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资助金额:$8.07万
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财政年份:2021
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负责人:中山 北斗
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依托单位:
環境により葉形が変化する植物ニューベキアを用いた葉の表現型可塑性メカニズムの解明
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批准号:13J00161
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$6.1万
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财政年份:2013
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负责人:中山 北斗
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依托单位:
アスパラガス属植物における擬葉の発生および多様化機構の解明による擬葉進化の考察
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批准号:09J09716
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.9万
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财政年份:2009
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负责人:中山 北斗
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依托单位:
海外基金