Molecular mechanisms for resistance to kinase inhibitors in soft tisuue sarcomas

软组织肉瘤对激酶抑制剂耐药的分子机制

• 批准号: 20K07415
• 负责人: 齋藤 剛
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Juntendo University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K07415/
• 关键词: 軟部肉腫; 融合遺伝子; チロシンキナーゼ受容体; 免疫染色; 遺伝子発現; 肉腫; 治療抵抗性; 遺伝子異常; 遺伝子発現解析; チロシンキナーゼ阻害剤; tissue microarray

染色体非転座型の肉腫検体から得られたRNAシークエンスデータを解析し、従来は融合遺伝子陰性腫瘍とされてきた肉腫の中に相当数（15%程度）のチロシンキナーゼ受容体を含む融合遺伝子を有するものが存在することを見出した。多くはout-of-frameであったが、一部はin-frame fusionであったことから、融合遺伝子形成に繋がる染色体転座という現象は実際のところかなり多くの肉腫で起こっていることが推察された。一方、in-frame fusionについては、RT-PCRによる融合遺伝子の確認とともに融合遺伝子に含まれるチロシンキナーゼ受容体のタンパク質発現を免疫染色でも確認することが出来た。これらのチロシンキナーゼ受容体を含む融合遺伝子については、一部について機能解析も行い、腫瘍形成能やチロシンキナーゼ阻害剤による抗腫瘍効果についても確認した。研究成果の一部は学術論文として投稿中である。また一方で、チロシンキナーゼ受容体に対する有用な免疫染色抗体がないため見過ごされていたが、前年度までの研究により肉腫にもチロシンキナーゼ受容体を含む融合遺伝子腫瘍が潜んでいる可能性が示唆された。今年度はチロシンキナーゼ受容体を含む融合遺伝子の効率的な検出方法について探索し、その１つにNanoStringを用いたRNAレベルでの遺伝子発現不均衡解析を試みた。これはチロシンキナーゼ受容体遺伝子の5'-サイドと3'-サイドに各々プローブ設定を行い、その発現量の違いを調べることから融合遺伝子形成の可能性を探索するものであるが、融合遺伝子形成の多様性からこの解析方法では検出出来ないような例や偽陽性となってくる症例もかなりあることもわかり、融合遺伝子形成の最終産物としての免疫染色による検出方法に加え、遺伝子発現不均衡解析にもプローブ設定の位置や数について次年度に向けて修正を加えていく必要性を感じている。

The chromosome non-locus type of sarcoid was analyzed by RNA sequence analysis, and the fusion gene was detected by RNA sequence analysis. The fusion gene was detected by RNA sequence analysis. Multi-frame fusion, multi-frame fusion The fusion gene was confirmed by RT-PCR and immunostaining for the fusion gene. The receptor contains a fusion gene, a part of which is used to analyze the function of the tumor, and the tumor formation can be confirmed by the anti-tumor effect. The research results of one academic paper were submitted. The study conducted in the previous year showed the possibility of a tumor containing a fusion gene. This year, the detection method of the efficiency of fusion gene in the receptor is explored, and the analysis of the imbalance of gene expression in the NanoString is tried. 5'-position, 3'-position, 3'-position, 5'-position, 5 '-position, The final product of fusion gene formation and immunostaining detection method are added, and the gene development imbalance analysis is performed. The position and number of fusion gene settings are determined. The necessity of fusion gene correction is also determined.

项目成果

Identification of a Novel MAN1A1-ROS1 Fusion Gene Through mRNA-based Screening for Tyrosine Kinase Gene Aberrations in a Patient with Leiomyosarcoma

• DOI: 10.1097/corr.0000000000001548
• 发表时间: 2021-04-01
• 期刊: CLINICAL ORTHOPAEDICS AND RELATED RESEARCH
• 影响因子: 4.2
• 作者: Suehara, Yoshiyuki;Kohsaka, Shinji;Saito, Tsuyoshi
• 通讯作者: Saito, Tsuyoshi

A case of primary distal-type epithelioid sarcoma of the lumbar vertebra with a review of literature

原发性腰椎远端型上皮样肉瘤一例并文献复习

• DOI: 10.1007/s00428-020-02955-w
• 发表时间: 2020
• 期刊: Virchows Archiv
• 影响因子: 3.5
• 作者: Ura Ayako;Saito Tsuyoshi;Motoi Toru;Takagi Tatsuya;Suehara Yoshiyuki;Kurihara Taisei;Sano Kei;Sasa Keita;Hayashi Takuo;Yao Takashi
• 通讯作者: Yao Takashi