炎症性腸疾患における新規粘膜関連細菌叢検出法を用いた腸粘膜炎症プロファイルの作成
使用新型粘膜相关微生物群检测方法创建炎症性肠病的肠粘膜炎症谱
基本信息
- 批准号:20K07801
- 负责人:
- 金额:$ 2.66万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:2020
- 资助国家:日本
- 起止时间:2020-04-01 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
20名の潰瘍性大腸炎患者において大腸内視鏡時に回腸末端、盲腸、直腸の生検組織、腸粘液を採取した検体について、腸炎の活動性と各炎症マーカー、神経ー免疫系にかかわる測定項目について既報を基に研究分担者と選定中である。追加で潰瘍性大腸炎患者3名の大腸内視鏡時における腸粘液をサンプルとし発症、再燃増悪に関連する因子の同定を目的とした。適切な検体採取の整合性を評価後、採取サンプル(炎症有無部位での比較)の網羅的解析を行った。独自の方法を用いて粘液層採取及びRNA抽出を行い、粘液層でのbulkのRNA seqを行った。ネットカテーテルによる粘液採取ではRNA抽出初期にネット自体が試薬内に溶け出し順調に進まなかったため、この実験は全てブラシ鉗子を用いて行った。腸粘液のRNAシークエンス実現性につき採取、抽出されたRNAの濃度、純度を測定しRNAシークエンスが可能と判断した。RNAシークエンスについてはraw dataから解析(QC, mapping, quantification, clustering, DE analysis, functional enrichment)を施行した際に神経伝達に関わる因子が複数指摘された。また我々の粘液層でのdata解析結果と、public dataの腸管上皮のRNA seqの解析結果を比較した。粘液層と腸管粘膜の網羅的解析結果を比較すると神経伝達に関連する因子が同定され、これらの因子が炎症に関与する可能性を考慮した。候補となった神経伝達因子については粘液内、粘膜内における存在をリアルタイムPCRで確認し、その各々が潰瘍性大腸炎の寛解期、活動期のいずれかで影響が大きいか調べた。
20 の ulcerative colitis patients に お い て in colon endoscopy に terminal ileum, caecum and rectum の 検 organization, intestinal mucous を take し た 検 body に つ い て, enteritis の active と inflammation マ ー カ ー, god 経 ー immune system に か か わ る measurement project に つ い て newspaper を base に research both sharers と selected in で あ る. Three additional で ulcerative colitis patients when の colon endoscopy に お け る intestinal mucous を サ ン プ ル と し 発 disease, reburning rights 悪 に masato even す る factor の be を purpose と し た. The appropriate な検 body adopts the <s:1> integration を evaluation 価, and then takes the サ <s:1> プ プ プ を (comparison of the location of inflammation で <s:1>) and the analysis of the を net を line った. The independent <s:1> method を uses <s:1> て mucous layer extraction and びRNA extraction を rows った and mucous layer で <s:1> bulk <s:1> RNA seqを rows った. ネ ッ ト カ テ ー テ ル に よ る mucus take で は RNA extraction early に ネ ッ ト autologous が try 薬 し に dissolved け in suitable adjustable に into ま な か っ た た め, こ の be 験 は full て ブ ラ を シ forceps with い て line っ た. Intestinal mucous の RNA シ ー ク エ ン ス be sex now に つ き take, take さ れ の た RNA concentration, determination of purity を し RNA シ ー ク エ ン ス が may と judgment し た. RNAシ シ エ エ スに スに スに て て て raw data ら ら analysis (QC, mapping, quantification, clustering, DE analysis) The functional enrichment (を) implements the た of the に of the に of the 伝 of the に of the わる factor が multiple criticism された. Youdaoplaceholder0 the comparison of the data analysis results of my 々 <s:1> mucus layer で <s:1> と and the data analysis results of the <s:1> RNA seq <s:1> of the intestinal mucosa epithelium を た た. Mucous layer と bowel mucosa の snare analytical results を す る と god 経 伝 da に masato even す る factor が be さ れ, こ れ ら の factor が inflammation に masato and す る possibility を consider し た. Alternate と な っ た god 経 伝 of factor に つ い て は mucus inside, mucosal に お け る exist を リ ア ル タ イ ム PCR で confirm し, そ の each 々 が ulcerative colitis の understanding in active period, の い ず れ か で が affected き い か adjustable べ た.
项目成果
期刊论文数量(14)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
大腸カプセル内視鏡を用いたクローン病全消化管観察の有用性
使用结肠胶囊内窥镜观察克罗恩病整个胃肠道的效用
- DOI:
- 发表时间:2023
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:山村健史;中村正直;澤田つな騎;川嶋啓揮
- 通讯作者:川嶋啓揮
Microbiome, fibrosis and tumor networks in a non-alcoholic steatohepatitis model of a choline-deficient high-fat diet using diethylnitrosamine
使用二乙基亚硝胺的缺乏胆碱的高脂肪饮食的非酒精性脂肪性肝炎模型中的微生物组、纤维化和肿瘤网络
- DOI:10.1016/j.dld.2021.02.013
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:4.5
- 作者:Yamamoto K;Honda T;Yokoyama Y;Ma L;Kato A;Ito T;Ishizu Y;Kuzuya T;Nakamura M;Kawashima H;Ishigami M;Tsuji M N;Fujishiro M.
- 通讯作者:Fujishiro M.
IBD診療におけるカプセル内視鏡「クローン病の予後予測因子とカプセル内視鏡Lewis scoreの臨床的意義の検討」
胶囊内镜检查在IBD治疗中“克罗恩病预后因素的检查及胶囊内镜Lewis评分的临床意义”
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Horigome Mari;Kobayashi Ryu;Hanaoka Masaaki;Kinguchi Sho;Kanaoka Tomohiko;Toya Yoshiyuki;Wakui Hiromichi;Tamura Kouichi;梶川豪,中村正直,山村健史,前田啓子,澤田つな騎,水谷泰之,石川恵里,橋口裕樹,村手健太郎,喜田裕一,濵崎元伸,江﨑正哉,山田健太朗,長谷川一成.鳥山和浩,池上脩二,藤城光弘
- 通讯作者:梶川豪,中村正直,山村健史,前田啓子,澤田つな騎,水谷泰之,石川恵里,橋口裕樹,村手健太郎,喜田裕一,濵崎元伸,江﨑正哉,山田健太朗,長谷川一成.鳥山和浩,池上脩二,藤城光弘
大腸カプセル内視鏡の普及に向けた工夫「大腸カプセル内視鏡によるクローン病診断への応用に向けて」
普及结肠胶囊内镜的构想《结肠胶囊内镜在克罗恩病诊断中的应用》
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Yamada Takayuki;Wakabayashi Mako;Bhalla Abhinav;Chopra Nitin;Miyashita Hirotaka;Mikami Takahisa;Ueyama Hiroki;Fujisaki Tomohiro;Saigusa Yusuke;Yamaji Takahiro;Azushima Kengo;Urate Shingo;Suzuki Toru;Abe Eriko;Wakui Hiromichi;Tamura Kouichi;中村正直,山村健史,前田啓子,澤田つな騎,水谷泰之,石川恵里,角嶋直美,古川和宏,藤城光弘
- 通讯作者:中村正直,山村健史,前田啓子,澤田つな騎,水谷泰之,石川恵里,角嶋直美,古川和宏,藤城光弘
高齢者潰瘍性大腸炎治療指針の検証「当院における高齢発症潰瘍性大腸炎の臨床的特徴」
老年溃疡性结肠炎治疗指南验证《我院老年发病溃疡性结肠炎临床特点》
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Nakano M;Nakamura Y;Urano T;Miyazaki A;Suzuki T;Watanabe K;Takahashi J;Shiraki M;澤田つな騎,中村正直,山村健史,前田啓子,水谷泰之,石川恵里,藤城光弘
- 通讯作者:澤田つな騎,中村正直,山村健史,前田啓子,水谷泰之,石川恵里,藤城光弘
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潰瘍性大腸炎の粘膜炎症制御における神経伝達物質としてのソマトスタチンの役割
生长抑素作为神经递质在控制溃疡性结肠炎粘膜炎症中的作用
- 批准号:
24K11149 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.66万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
相似海外基金
シングルセルRNAシークエンスを用いた冠動脈石灰化病変の病態解明と治療法の開発
利用单细胞 RNA 测序阐明冠状动脉钙化病变的病理学并开发治疗方法
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虚血性心疾患法医剖検例におけるシングルセルRNAシークエンス解析
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$ 2.66万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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通过浆细胞单细胞 RNA 测序对 AL 淀粉样变性进行全面遗传分析
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- 资助金额:
$ 2.66万 - 项目类别:
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单细胞RNA测序分析人主动脉夹层发病机制
- 批准号:
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眼感染症病巣のRNAシークエンス網羅解析による病態解明
通过眼部感染病变的综合 RNA 测序分析阐明病理学
- 批准号:
21K09720 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 2.66万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)