Ab initio法を活用した造血系腫瘍におけるlncRNAの統合的機能解析

使用从头算法对造血肿瘤中lncRNA进行整合功能分析

• 批准号: 20K08716
• 负责人: 森 努
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Fukushima Medical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2023-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K08716/
• 关键词: 造血器腫瘍; システム生物学; ab initio遺伝子軌道法; long non-coding RNA; ゲノム編集

白血病の病態で重要な役割を持つlncRNAを同定する目的で，informaticな解析を実行してきた。TCGAに登録された18種の癌種で公開されている全てのmRNAとncRNAの情報をダウンロードし，そこからRNAの発現レベルと，DNAメチル化情報を抽出した。本年度までに，DNAメチル化情報の利用法の開発に成功し，最終的に合計19,198遺伝子についての計算が終了した。私たちは得られた計算結果と，合山の行った実験結果との照らし合わせを進めてきた。その結果，エピジェネティック制御遺伝子の機能計算に成功したことが判明した。またこの過程で，他の疾患関連遺伝子の同定にも成功したことから，薬剤標的性に関する特許を申請するために準備を開始した段階である。

Leukemia の pathological で cut を hold important な service つ lncRNA を with fixed す で る purpose, informatic な parsing を line be し て き た. TCGA に login さ れ た 18 species の carcinoma で public さ れ て い る full て の mRNA と ncRNA の intelligence を ダ ウ ン ロ ー ド し, そ こ か ら RNA の 発 now レ ベ ル と, DNA メ チ ル change intelligence を spare し た. This year ま で に, DNA メ チ ル intelligence の use method の open 発 に し success, the final に amounted to 19198 legacy 伝 son に つ い て の computing が end し た. Private た ち は have ら れ と た calculation results, and mountain line の っ た be 験 results と の according ら し close わ せ を into め て き た. As a result, the 伝 function calculation of the 伝 sub-system of the エピジェネティッ <s:1> system of the imperial relics is に successful, <s:1> た とが とが とが is determined, and た is made. ま た こ で の process, his masato の disease even survived 伝 の with fixed に も successful し た こ と か ら, 薬 tonic of mark sex に masato す る charter を application す る た め に preparations begin を し た Duan Jie で あ る.