細胞内シグナル伝達機構における時間情報コードのシステム生物学
細胞内シグナル伝達機構における時間情報コードのシステム生物学
批准号:
24241067
负责人:
黒田 真也
金额:
$17.8万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
财政年份:
2012
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2012-04-01 至 2014-03-31
中文摘要
シグナル伝達機構の本質は、多彩な入力の情報を限られた種類の分子にコードすることにある。申請者らはERK経路やAkt経路の研究において、分子活性の時間パターンに入力情報がコードされる時間情報コードを世界に先駆け見出している。本研究では、以上の研究を発展させ、細胞内シグナリングの時間情報コードを解明してその生理学的な意義を明らかにするとともに、時間情報コードが様々なシグナル伝達に見られる一般的な特性であることを明らかにすることを目的とした。申請者らはラットの肝臓がん由来のFao細胞において、インスリンの3つの異なる時間パターンがpAktに多重にコードされ、下流の3つのシグナル分子(pS6K,pGSK3β, G6Pase)がそれぞれ選択的にデコードすることを見出した。本年度は、シグナル分子の下流にある糖代謝やタンパク質合成などの代謝制御に時間情報コードが使われているかどうかを検討した。そこで、インスリンのさまざまな時間パターンを細胞に与えて、時間情報コードにより最終的な生理機能であるタンパク質合成やグリコーゲン合成、糖新生抑制といった代謝物質を計測した。同時にこれらの代謝を制御する数理モデルを作成して、インスリンによる代謝制御調節ネットワーク制御においても時間情報コードが用いられていることを明らかにした。
英文摘要
シグナル伝達機構の本質は、多彩な入力の情報を限られた種類の分子にコードすることにある。申請者らはERK経路やAkt経路の研究において、分子活性の時間パターンに入力情報がコードされる時間情報コードを世界に先駆け見出している。本研究では、以上の研究を発展させ、細胞内シグナリングの時間情報コードを解明してその生理学的な意義を明らかにするとともに、時間情報コードが様々なシグナル伝達に見られる一般的な特性であることを明らかにすることを目的とした。申請者らはラットの肝臓がん由来のFao細胞において、インスリンの3つの異なる時間パターンがpAktに多重にコードされ、下流の3つのシグナル分子(pS6K,pGSK3β, G6Pase)がそれぞれ選択的にデコードすることを見出した。本年度は、シグナル分子の下流にある糖代謝やタンパク質合成などの代謝制御に時間情報コードが使われているかどうかを検討した。そこで、インスリンのさまざまな時間パターンを細胞に与えて、時間情報コードにより最終的な生理機能であるタンパク質合成やグリコーゲン合成、糖新生抑制といった代謝物質を計測した。同時にこれらの代謝を制御する数理モデルを作成して、インスリンによる代謝制御調節ネットワーク制御においても時間情報コードが用いられていることを明らかにした。
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DOI:
10.1016/j.bpj.2014.01.026
发表时间:
2014-03
期刊:
Biophysical journal
影响因子:
3.4
作者:
[H. Urakubo;Miharu Sato;Shin Ishii;Shinya Kuroda]
通讯作者:
H. Urakubo;Miharu Sato;Shin Ishii;Shinya Kuroda
Information coding of ERK signaling networks
ERK信号网络的信息编码
DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Shinya Kuroda]
通讯作者:
Shinya Kuroda
PLS regression analysis of Signal transduction network and phenotypes in PC12 cell
PC12细胞信号转导网络和表型的PLS回归分析
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yu-ki Akimoto, Katsuyuki Yugi, Shinsuke Uda, Kanako Watanabe, Takeshi H Saito and Shinya Kuroda]
通讯作者:
Takeshi H Saito and Shinya Kuroda
Unbiased identification of global network for signaling and metabolism from trans-omic data
从跨组学数据中公正地识别全球信号传导和代谢网络
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[黒田真也, 柚木克之, 久保田浩行, 曽我朋義, 中山敬一]
通讯作者:
中山敬一
トランスオミクスへ向けた定量生物学
面向转组学的定量生物学
DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Shinya Kuroda]
通讯作者:
Shinya Kuroda
共 6 条
Information coding based in cell-to-cell variability
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批准号:21H04759
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$27.54万
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财政年份:2021
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负责人:黒田 真也
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依托单位:
低分子量G蛋白質とその標的蛋白質による血管構築の分子機構
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批准号:10177221
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1998
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负责人:黒田 真也
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依托单位:
低分子量G蛋白質の標的蛋白質とその病態
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批准号:09770098
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1998
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负责人:黒田 真也
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依托单位:
低分子量G蛋白質とその標的蛋白質による細胞内情報ネットワークの解折
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批准号:09273242
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1997
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负责人:黒田 真也
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依托单位:
低分子量G蛋白質とその標的蛋白質の相互作用の構造解析
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批准号:09249214
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1997
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负责人:黒田 真也
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依托单位:
低分子量G蛋白質とその標的蛋白質による血管構築の分子機構
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批准号:09281224
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1997
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负责人:黒田 真也
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依托单位:
低分子量G蛋白質とその標的蛋白質の相互作用の構造解析
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批准号:08260215
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1996
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负责人:黒田 真也
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依托单位:
低分子量G蛋白質の標的蛋白質の機能とその病態
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批准号:08770102
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1996
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负责人:黒田 真也
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依托单位:
低分子量G蛋白質とその標的蛋白質の相互作用の構造解析
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批准号:08260215
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1996
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负责人:黒田 真也
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依托单位:
海外基金