血中腫瘍細胞由来DNAを用いた網羅的遺伝子解析に基づく卵巣癌の新規治療戦略の確立

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（１）卵巣癌患者の血中循環腫瘍DNA（ctDNA）の個別遺伝子プロファイル結果と臨床病理学的因子や予後との相関卵巣癌の治療前後の患者血漿からctDNAを抽出し，CAPP-seq(197遺伝子を99.99%以上の感度・特異度で検出)を用いて網羅的遺伝子プロファイリングを行い, 臨床病理学因子・予後との相関を検討した．腫瘍組織から抽出したDNAのターゲットシークエンスを行い，リキッドバイプシー結果と比較した. 卵巣癌51例のctDNA解析から, 48例（94%）で1つ以上のnon-synonymousな体細胞変異を認め, 高異型度漿液性癌の67%でTP53の，明細胞癌の31%でAPCの，類内膜癌の40%でPIK3CAの，粘液性癌の67%でKRASの変異を認めた．またctDNA濃度はStage IVで有意に高値であり, 濃度が高いほど無再発生存期間（PFS）が短く，1つ以上のpathogenic変異を有する患者は有意にPFSが不良であった.（２）ctDNA解析を用いた化学療法前後におけるモニタリングと“癌クローン進化”の証明術前化学療法(NAC)施行例でNAC前後のctDNAプロファイル変化を解析した. NAC感受性群ではctDNAのTP53変異アレル頻度が低下した一方，NAC抵抗性群ではTP53変異アレル頻度が上昇し，NAC後に新たなpathogenicTP53変異が出現し,クローン選択/進化を時系列モニタリングすることができた．