Comprehensive genome analysis of norovirus and comparative analysis of the pathogenesis by the difference of genotypes

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2012年11月から2014年06月に、国内で検出され、公共のデータベース（NCBI）に登録した48配列、および、参考配列として、2配列、合計50配列のGroup II Type 4（GII.4）Sydney 2012株を対象とした。ウイルスRNAを出発材料とし、塩基配列を解析後、ウイルスの進化系統の解析のため、Beauti and Beastソフトウェアを用いて、ベイズ法による起源推定系統樹解析を行った。また、感染者数の動態を推測するために、population dynamics解析を実施した。GII.4 Sydney 2012株は、（i）2011年7月ごろ出現し、その後、国内には2012年7月～9月ごろ持ち込まれた可能性が示唆された。（ii）2013年2～4月ごろ、2つのグループ（Aグループ、Bグループ）に分岐し、Aグループが主要なグループとなり、存在していることが示唆された。2014年2～4月ごろ、更に、Aグループが2つのグループ（Cグループ、Dグループ）に分岐し、国内では、二つのグループが並存していた。（iii）population dynamics解析では、2015年、さらに、2017年初め、感染者数が減少している可能性が示された。GII.4 Sydney 2012株は、変異を蓄積し、分岐を繰り返しながら、ヒト集団で存続していることが示唆された。GII.4 Sydney 2012株の4種類のグループのうち、なぜ、Bグループが消失したのか不明である。今後、全長ゲノムの比較をすることで、ヒト集団に存続できる配列上の特徴を抽出できる可能性がある。population dynamics解析では、2015年、2017年と感染者数が減少が推測される時期があったが、2015年は食中毒事例を中心にGII.17、2016年末～2017年初めにかけ、小児を中心にGII.2が流行していたため、GII.4 Sydney 2012株による感染者が減少していた可能性が示された。