Comprehensive genome analysis of norovirus and comparative analysis of the pathogenesis by the difference of genotypes

诺如病毒全基因组分析及基因型差异致病机制比较分析

• 批准号: 20K10443
• 负责人: 本村 和嗣
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Osaka Institute of Public Health
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K10443/
• 关键词: ノロウイルス; 起源推定解析; 全長ゲノム解析; ゲノム解析

2012年11月から2014年06月に、国内で検出され、公共のデータベース（NCBI）に登録した48配列、および、参考配列として、2配列、合計50配列のGroup II Type 4（GII.4）Sydney 2012株を対象とした。ウイルスRNAを出発材料とし、塩基配列を解析後、ウイルスの進化系統の解析のため、Beauti and Beastソフトウェアを用いて、ベイズ法による起源推定系統樹解析を行った。また、感染者数の動態を推測するために、population dynamics解析を実施した。GII.4 Sydney 2012株は、（i）2011年7月ごろ出現し、その後、国内には2012年7月～9月ごろ持ち込まれた可能性が示唆された。（ii）2013年2～4月ごろ、2つのグループ（Aグループ、Bグループ）に分岐し、Aグループが主要なグループとなり、存在していることが示唆された。2014年2～4月ごろ、更に、Aグループが2つのグループ（Cグループ、Dグループ）に分岐し、国内では、二つのグループが並存していた。（iii）population dynamics解析では、2015年、さらに、2017年初め、感染者数が減少している可能性が示された。GII.4 Sydney 2012株は、変異を蓄積し、分岐を繰り返しながら、ヒト集団で存続していることが示唆された。GII.4 Sydney 2012株の4種類のグループのうち、なぜ、Bグループが消失したのか不明である。今後、全長ゲノムの比較をすることで、ヒト集団に存続できる配列上の特徴を抽出できる可能性がある。population dynamics解析では、2015年、2017年と感染者数が減少が推測される時期があったが、2015年は食中毒事例を中心にGII.17、2016年末～2017年初めにかけ、小児を中心にGII.2が流行していたため、GII.4 Sydney 2012株による感染者が減少していた可能性が示された。

November 2012 to June 2014, the domestic detection, public data entry (NCBI) registration, 48 alignment, reference alignment, 2 alignment, total 50 alignment of Group II Type 4 (GII.4) Sydney 2012 strain The analysis of the phylogenetic tree of the origin of the species is carried out after the analysis of the species and its base alignment, the analysis of the evolutionary system of the species, and the application of the method. The analysis of population dynamics is carried out. GII.4 Sydney 2012 strain,(i) July 2011, after the emergence of, domestic July to September 2012, the possibility of holding (ii) From February to April 2013, there was no difference between A group and B group. February to April, 2014: A, B, C, D, D, D (iii) Population dynamics analysis shows the possibility of a decrease in the number of infected persons in 2015, early 2017 and early 2017. GII.4 Sydney 2012 Plant diversity accumulates, diverges, and returns to its original state. GII.4 Sydney 2012 strain of 4 kinds of In the future, there is a possibility that the characteristics of the group will be extracted from the comparison of the total length and the group. Analysis of population dynamics: 2015, 2017, decrease in the number of infected persons, estimated period: 2015, food poisoning case center: GII.17, end of 2016~beginning of 2017, epidemic center: GII.2, GII.4 Sydney 2012, decrease in the number of infected persons, estimated period: 2015, food poisoning case center: GII.17, end of 2016~beginning of 2017

项目成果

Increasing seroprevalence but waning herd immunity against measles after elimination: Longitudinal seroepidemiology of measles in Osaka Prefecture, Japan, 2003?2020

消除麻疹后血清阳性率增加，但群体免疫力减弱：2003 年至 2020 年日本大阪府麻疹纵向血清流行病学

• DOI: 10.1016/j.vaccine.2022.07.025
• 发表时间: 2022
• 期刊: Vaccine
• 影响因子: 5.5
• 作者: Kurata Takako;Miyama Takeshi;Kanbayashi Daiki;Kaida Yuko;Aoyama Ikuko;Ikemori Ryo;Banno Fumiya;Kawahata Takuya;Mori Haruyo;Motomura Kazushi
• 通讯作者: Motomura Kazushi

Full genome-based characterization of G4P[6] rotavirus strains from diarrheic patients in Thailand: Evidence for independent porcine-to-human interspecies transmission events

• DOI: 10.1007/s11262-021-01851-y
• 发表时间: 2021-06-09
• 期刊: VIRUS GENES
• 影响因子: 1.6
• 作者: Tacharoenmuang，Ratana;Guntapong，Ratigorn;Komoto，Satoshi
• 通讯作者: Komoto，Satoshi

Vaccine-induced neutralizing antibodies against SARS-CoV-2 Omicron variant isolated in Osaka, Japan

日本大阪分离出针对 SARS-CoV-2 Omicron 变体的疫苗诱导中和抗体

• DOI: 10.1099/acmi.0.000465.v3
• 发表时间: 2023
• 期刊: Access Microbiology
• 作者: Hiroi Satoshi;Morikawa Saeko;Motomura Kazushi;Mori Haruyo
• 通讯作者: Mori Haruyo

Novel human reovirus isolated from children and its long-term circulation with reassortments

• DOI: 10.1038/s41598-020-58003-9
• 发表时间: 2020-01-22
• 期刊: SCIENTIFIC REPORTS
• 影响因子: 4.6
• 作者: Yamamoto, Seiji P.;Motooka, Daisuke;Iritani, Nobuhiro
• 通讯作者: Iritani, Nobuhiro

High prevalence of equine‐like G3P[8] rotavirus in children and adults with acute gastroenteritis in Thailand

• DOI: 10.1002/jmv.25591
• 发表时间: 2020-02
• 期刊: Journal of Medical Virology
• 影响因子: 12.7
• 作者: R. Tacharoenmuang;S. Komoto;R. Guntapong;Sompong Upachai;Phakapun Singchai;Tomihiko Ide;Saori Fukuda;Kriangsak Ruchusatsawast;Busarawan Sriwantana;M. Tatsumi;K. Motomura;N. Takeda;T. Murata;S. Sangkitporn;K. Taniguchi;T. Yoshikawa