Does the obesity affect the relationship between serum haptoglobin and cholesterol levels?

ハプトグロビン（HP）HPに加え、隣接するHPR（HP関連遺伝子）の遺伝子多型は血中HP濃度のみならず血中コレステロール濃度と関連しており、この関連に肥満あるいは過体重が影響すること他集団の解析により示唆されたことから、日本人集団を対象とした本研究によりコレステロール代謝におけるHPの役割、肥満や過体重の影響を明らかにしたい。今年度は、多数検体（384プレートに配置されたDNA）に適し、かつ微量検体を対象とした研究に有効な方法の開発をすすめた。なお、昨年度デザインしたprobe-based fluorescence-melting-curve-analysis（プローブを利用した蛍光融解曲線解析）によるHPRに存在するrs2000999の遺伝子型判定法の有効性は遺伝子型が分かっている検体を用いた検討により確認している。この方法をベースに、rs2000999と同様血中HP濃度とコレステロール濃度の両方に強く影響し、東アジアと東南アジア諸国に分布するHP完全欠失アレル（HPdel）の接合性とrs2000999の遺伝子型判定を1度の反応で判定する方法を設計し妥当性を検証した。既に他の方法でHPdelとrs2000999の遺伝子型を決定している日本人サンプルの遺伝子型は、以前決定したものと完全に一致した。また2度実施した解析の結果が同一で、方法の再現性も確認された。1回の反応で融解曲線解析とエンドポイント法の両法を利用した遺伝子型判定の報告は現在までにないが、今回の実験系では可能であり、大規模な関連解析に有効な方法を開発することが出来た。

ハプトグロビン（HP）HPに加え、隣接するHPR（HP関連遺伝子）の遺伝子多型は血中HP濃度のみならず血中コレステロール濃度と関連しており、この関連に肥満あるいは過体重が影響すること他集団の解析により示唆されたことから、日本人集団を対象とした本研究によりコレステロール代謝におけるHPの役割、肥満や過体重の影響を明らかにしたい。今年度は、多数検体（384プレートに配置されたDNA）に適し、かつ微量検体を対象とした研究に有効な方法の開発をすすめた。なお、昨年度デザインしたprobe-based fluorescence-melting-curve-analysis（プローブを利用した蛍光融解曲線解析）によるHPRに存在するrs2000999の遺伝子型判定法の有効性は遺伝子型が分かっている検体を用いた検討により確認している。この方法をベースに、rs2000999と同様血中HP濃度とコレステロール濃度の両方に強く影響し、東アジアと東南アジア諸国に分布するHP完全欠失アレル（HPdel）の接合性とrs2000999の遺伝子型判定を1度の反応で判定する方法を設計し妥当性を検証した。既に他の方法でHPdelとrs2000999の遺伝子型を決定している日本人サンプルの遺伝子型は、以前決定したものと完全に一致した。また2度実施した解析の結果が同一で、方法の再現性も確認された。1回の反応で融解曲線解析とエンドポイント法の両法を利用した遺伝子型判定の報告は現在までにないが、今回の実験系では可能であり、大規模な関連解析に有効な方法を開発することが出来た。