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新奇酵素反応による細菌のプロテオスタシス制御：我々とは異質な酸化ストレス適応戦略

通过新型酶反应控制细菌蛋白质稳态：一种与我们不同的氧化应激适应策略

基本信息

批准号：
20K15446
负责人：
今井岳志
金额：
$ 2.75万
依托单位：
Hyogo Prefectural Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では各種の酸化ストレスに対して当該の酵素がどのような役割を果たすかを多角的に評価し、細菌の多様化に繋がった、我々とは異質な酸化ストレスへの適応戦略を明らかにすることを目指している．本研究計画は①酵素反応における当該酵素の諸性質解明、②オーソログの活性確認と破壊株作製、③破壊株においてタンパク質のアグリゲーションを定量、④進化生物学的な位置づけの解明、の４つの実施項目に分かれている．今年度は特に①において当該酵素YjbIが活性中心に持つヘムがどのように持続的に抗酸化の役割を果たしているかという点に注目した．ヘムは大気中の酸素と結びつき、容易に周囲の分子を酸化するため、既知のヘムタンパク質を還元性の分子中に添加すると自動酸化が緩やかに進行する．そのため、同じくヘムタンパク質であるYjbIが自動酸化の性質を持っているならば、これまでに明らかにしてきた菌体表面の大気下で果たす抗酸化の役割と矛盾することになる．そこで、実際にいくつかの還元剤存在下でYjbIによる自動酸化を定量化してみた．その結果、他のヘムと比較して、YjbIが著しく自動酸化しづらいことが明らかとなった．これは、YjbIがこれまでに知られている典型的なヘムタンパク質に当てはまらない、特殊な仕組みを持つことやYjbIが生理機能として抗酸化反応を担っていることを裏付けるものとなった．機序の詳細は不明ではあるが、昨年度実施したポイントミューテーションの結果からその重要性が明らかとなった、活性中心付近のチロシン残基などの電子リッチな残基が、ヘム周辺に近づいた還元性の分子が酸化されることを防いでいる可能性がある．

In this study, we investigated the effects of different enzymes on the growth of bacteria and their biological diversity. This research project includes: (1) the characterization of enzyme reaction;(2) the identification of enzyme activity and plant culture;(3) the quantification of enzyme reaction;(4) the characterization of evolutionary biology; and (5) the implementation of enzyme reaction. This year, the enzyme YjbI was found to be active in the active center and resistant to acidification. For example, the acid in the large molecule is easy to acidify, and the known acid in the large molecule is easy to acidify. YjbI is the property of automatic acidification. In the presence of YjbI, automatic acidification is quantified. The result is that the acid is automatically acidified. YjbI is a physiological function of anti-acidification and anti-acidification. The details of the mechanism are unclear. The results of the previous year's implementation of the program are important. The active center is close to the program residue. The electronic residue is close to the program residue. The molecular acidification is possible.