好気性微生物を用いたハイスループット解析によるアーキア工学ツールの作製

使用需氧微生物通过高通量分析创建古菌工程工具

• 批准号: 20K15442
• 负责人: 古林 真衣子
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K15442/
• 关键词: アーキア; カロテノイド; ハロアーキア; 好熱性細菌; 合成生物学

アーキアが細菌・真核生物に並んで生命の第3のドメインだと発見されてから40年余、生命起源への進化的興味から多様な生物機能の工学応用まで、アーキアを対象とした研究はますます注目を浴びている。しかしアーキアの生物工学ツールの開発は他の生物と比較して遅れているとも言える：真核生物と細菌は、合成生物学や蛋白質工学技術が急速に進んでいるのに対し、アーキアで使える合成生物学ツールは報告が少ないのが現状である。本研究では、好気性ハロアーキアおよび好気性好熱性細菌を利用して、アーキアで広く使えうる合成生物学ツールをハイスループットに作製・整備することを目指す。本研究で着目するHalobacterium, Thermus は共にカロテノイドを生合成して環境耐性を獲得しているが、これらの生物がもともと持っているカロテノイド経路遺伝子を応用することにより工学ツールの開発を目指す。本年度は、昨年度に引き続き、好熱菌、好塩菌の生育条件の検討、およびツール整備を行った。ここでは、プロモータ等の遺伝子パーツのラインナップを増やし、広域ベクターに組み込んだ。ここで使用するベクターについて、生育条件の検討が必要であった。今後は当該ベクターだけでなく、他の生物由来のプラスミドベクターについても検討したい。また、複数の好熱菌を入手し、それらの細菌の生産するカロテノイドを分析した。さらに、ゲノム配列を解析し、生合成遺伝子の候補を同定した。

アーキアがBacteria・Eukaryotesに和んで生の三のドメインだと発见されてからMore than 40 years ago, the origin of life へのjin The interest of chemical engineering is the research and development of biological functions, and the research and development of biological functions.しかしアーキアのbioengineering ツールの开発はhisのbioticsとComparison して遅れているとも语える: eukaryotes and bacteria, synthetic biologyやProtein Engineering Technology が Rapid Advance んでいるのに対し, アーキアで使えるSynthetic Biology ツールは Report が小ないのが Current Activities である. In this study, the use of highly decomposable and heat-resistant bacteria was carried out. It is made and maintained by Synthetic Biology Synthetic Biology System. The purpose of this study is Halobacterium, ThermusはKOにカロテノイドを生综合してEnvironmental resistanceをGetしているが、これらのbioticsがもともとHold the っているカロテノイド経路伝子を応用することにより工学ツールの开発を目之す. This year's results, last year's results, the growth conditions of heat-loving bacteria, and the growth conditions of good bacteria, and the maintenance of good bacteria.ここでは, プロモータ, etc. の伝子パーツのラインナップを嗗やし, 広区ベクターに组み込んだ. It is necessary to use the するベクターについて and the reproductive conditions. From now on, we should discuss the origins of other biological origins.また、Plural Thermophilic Bacteria をProcessing それらのBacteria のProduction するカロテノイドをAnalysis した.さらに, ゲノムmatching をanalytic し, biosynthetic legacy 伝子の candidate を同定した.