多くの癌での予後不良因子PLK1の過剰発現とPARP阻害剤とDNA損傷修復の関係
PLK1的过度表达是许多癌症预后不良的因素,以及PARP抑制剂与DNA损伤修复的关系
基本信息
- 批准号:20K16316
- 负责人:
- 金额:$ 2.66万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
- 财政年份:2020
- 资助国家:日本
- 起止时间:2020-04-01 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
本研究は、多くの癌でみられ予後不良と関連があるPLK1過剰発現が、1) 相同組替え修復に与える影響、2) PARP阻害剤感受性への影響、3) 相同組替え修復を抑制する機序の解明、を検討するものである。1) PLK1過剰発現が相同組替え修復に与える影響は、TCGA (The Cancer Genome Atlas) データベースを用いbioinformaticsで検討した。TCGA datasetに組替え修復不全を示すHRD scoreを算出し元データにintegrateした上で検討した。これにより多くの癌種で検討することが可能になった。この検討で、予想通りPLK1過剰発現が相同組替え修復を抑制することを確認した。約700種類の癌細胞株における遺伝子発現データと抗癌剤感受性データを含むCancer Cell line Encyclopedia (CCE)データセットでも同様にPLK1過剰発現が相同組替え修復を抑制することを確認した。現在癌細胞株を用いた研究で再現性を検討している。2) PLK1過剰発現がPARP阻害剤感受性に与える影響は、CCEデータセットを用いbioinformaticsで検討した。この結果、PLK1過剰発現がPARP阻害剤に高い感受性を示すことを確認した。癌細胞株、だけでなく臨床検体を用いた検討でこれらの結果の再現性を得た。3) PLK1過剰発現が相同組替え修復を抑制する機序の解明は、TCGAデータベースを用いたbioinformaticsによる解析で、PLK1過剰発現がCyclin B1 (CCNB1)とCDK1の発現上昇を伴うことを明らかにした。細胞株を用い、再現性および相同組替え修復を抑制する機序を検討する。
这项研究检查了PLK1过表达的影响,这与许多癌症的预后不良有关,1)其对同源重组修复的影响,2)其对PARP抑制剂敏感性的影响; 3)其机制抑制同源重组修复。 1)PLK1过表达对使用TCGA(癌症基因组地图集)数据库的生物信息学检查了同源重组修复的影响。 HRD分数表明在TCGA数据集中计算了未重组,并在考虑之前将其集成到了原始数据中。这使得调查多种类型的癌症成为可能。这项研究证实,PLK1的过表达抑制了预期的同源重组修复。我们同样证实,PLK1的过表达抑制了癌细胞系百科全书(CCE)数据集中的同源重组修复,其中包括基因表达数据和大约700个癌细胞系中的抗癌药物敏感性数据。目前,正在使用癌细胞系的研究中研究可重复性。 2)使用CCE数据集在生物信息学中检查了PLK1过表达对PARP抑制剂易感性的影响。这证实了PLK1的过表达极易受到PARP抑制剂的影响。这些结果不仅可以检查癌细胞系,而且还可以检查临床标本。 3)为了阐明PLK1过表达抑制使用TCGA数据库的生物信息学分析同源重组修复的机制,揭示了PLK1过表达伴随着细胞周期蛋白B1(CCNB1)和CDK1的表达增加。细胞系用于研究抑制可重复性和同源重组修复的机制。
项目成果
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科研奖励数量(0)
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