サンゴが雲を作り気候を変化させているのか?遺伝子解析技術を用いた検証
サンゴが雲を作り気候を変化させているのか?遺伝子解析技術を用いた検証
批准号:
20K21860
负责人:
新里 宙也
金额:
$4.08万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-07-30 至 2024-03-31
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海岸で感じる「磯の香り」の原因である硫化ジメチル(DMS)は、さまざまな植物プランクトンが浸透圧調節物質として生成するジメチルスルホニオプロピオン酸(DMSP)から、主に細菌や植物プランクトン自身が持つDMSPリアーゼという酵素により、DMSへと転換される。DMSは大気中で水蒸気の凝結核となり雲を形成するので、太陽光を遮ることによる地球冷却効果の役割を果たすと考えられている。我々は造礁サンゴのゲノム情報の比較解析から、特定のサンゴ(ミドリイシ属)でDMSPリアーゼに似たアミノ酸配列を持つ遺伝子(DMSPリアーゼ様遺伝子)の数が、ゲノム上で大きく増加していることを発見した。ミドリイシ属サンゴに多く存在するDMSPリアーゼ様遺伝子は、一体どのような役割を果たしているのかを明らかにすることを目的とする。真核生物におけるDMSPリアーゼ様遺伝子の進化を明らかにするため、これまでに解読されているサンゴや褐虫藻のゲノム情報や、様々な生物のトランスクリプトームデータベース(NCBI TSA)から相同遺伝子を収集し、分子系統解析を行った。その結果、動物のDMSPリアーゼ様遺伝子は同一起源を持つ、刺胞動物以外の動物からは確認されない、褐虫藻・円石藻など他の真核生物のDMSPリアーゼ様遺伝子や原核生物のDMSPリアーゼとは起源が異なる、ことを明らかにし、これら成果を国際誌で報告した。ゲノム情報を向上させたミドリイシ科複数種とミドリイシ属サンゴとの比較ゲノム解析を行った結果、ミドリイシ属のDMSPリアーゼ様遺伝子の遺伝子数の増加は、コモンサンゴ属との分岐後に起こったことも明らかになった。さらに、DMSPリアーゼ様遺伝子はミドリイシの幼生段階において高発現していることが判明したので、幼生段階の遺伝子発現パターンについても解析を開始した。
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DOI:
10.1371/journal.pone.0252514
发表时间:
2021
期刊:
PloS one
影响因子:
3.7
作者:
[Yamashita H, Koike K, Shinzato C, Jimbo M, Suzuki G]
通讯作者:
Suzuki G
サツマハオリムシのゲノム解析と組織別トランスクリプトーム解析による共生関連遺伝子の探索
通过萨摩金龟子的基因组分析和组织特异性转录组分析寻找共生相关基因
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[内田大賀, 善岡祐輝, 新里宙也]
通讯作者:
新里宙也
Genomic analysis of a reef‐building coral, <i>Acropora digitifera</i> , reveals complex population structure and a migration network in the Nansei Islands, Japan
对造礁珊瑚<i>Acropora digitalifera</i>的基因组分析揭示了日本南西群岛复杂的种群结构和迁徙网络
DOI:
10.1111/mec.16665
发表时间:
2022
期刊:
Molecular Ecology
影响因子:
4.9
作者:
[Tsuchiya Kojin, Zayasu Yuna, Nakajima Yuichi, Arakaki Nana, Suzuki Go, Satoh Noriyuki, Shinzato Chuya]
通讯作者:
Shinzato Chuya
18種のミドリイシ科サンゴの全ゲノム解読が明らかにする、ミドリイシ属の環境適応戦略
18种鹿角珊瑚的全基因组测序揭示了鹿角珊瑚的环境适应策略
DOI:
--
发表时间:
2020
期刊:
影响因子:
--
作者:
[新里 宙也, 鈴木 豪, 山下 洋, 佐藤 矩行]
通讯作者:
佐藤 矩行
サンゴ-褐虫藻共生系の分子機構:異なる褐虫藻に対する宿主の遺伝子応答から探る
珊瑚-虫黄藻共生系统的分子机制:探索宿主对不同虫黄藻的遗传反应
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[善岡祐輝, 新里宙也]
通讯作者:
新里宙也
共 13 条
個体差に注目したサンゴの高水温耐性と白化現象のメカニズムの解明
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批准号:24K01847
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.65万
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财政年份:2024
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负责人:新里 宙也
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依托单位:
Understanding genomic bases of coral-algae symbioses occurring in nature
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批准号:20H03235
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.23万
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财政年份:2020
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负责人:新里 宙也
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依托单位:
国内基金
海外基金
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海洋微生物驱动有机硫DMSP循环的新类群、新机制与代谢调控
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批准号:32330001
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项目类别:重点项目
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资助金额:229万元
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批准年份:2023
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负责人:张玉忠
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依托单位:
深海放线菌新型DMSP裂解酶的鉴定及其生理生态功能研究
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批准号:32370118
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项目类别:面上项目
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资助金额:50万元
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批准年份:2023
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负责人:张晓华
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依托单位:
新型双功能DMS/DMSP产生基因的作用机制与生态贡献研究
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批准号:42306115
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:20万元
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批准年份:2023
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负责人:郭瑞红
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依托单位:
北极海域微单胞藻合成DMSP关键酶的催化机制及生态意义研究
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批准号:42306258
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:30.00万元
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批准年份:2023
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负责人:张楠
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依托单位:
海洋细菌Halomonas sp. D47裂解二甲基巯基丙酸内盐(DMSP)释放环境效应气体二甲基硫(DMS)的代谢调控过程与机制
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批准号:32370136
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项目类别:面上项目
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资助金额:50万元
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批准年份:2023
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负责人:王鹏
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依托单位:
极地海洋细菌中一类新型海洋有机硫二甲基巯基丙酸内盐(DMSP)裂解酶的鉴定及催化新机制
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批准号:--
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:30万元
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批准年份:2022
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负责人:滕兆洁
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依托单位:
洋底深部真菌合成DMSP的途径、机理及生理生态学功能研究
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批准号:42273077
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项目类别:面上项目
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资助金额:58万元
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批准年份:2022
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负责人:刘常宏
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依托单位:
南极海洋嗜冷单胞菌Psychrobacter sp.D2二甲基巯基丙酸内盐(DMSP)转运载体的鉴定及其转运DMSP的机制
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批准号:32170127
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项目类别:面上项目
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资助金额:58.00万元
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批准年份:2021
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负责人:王鹏
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依托单位:
南极海洋嗜冷单胞菌Psychrobacter sp. D2二甲基巯基丙酸内盐(DMSP)转运载体的鉴定及其转运DMSP的机制
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批准号:--
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项目类别:--
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资助金额:58万元
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批准年份:2021
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负责人:王鹏
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依托单位:
南极海洋真菌(Tilletiopsis sp. ICE-01)DMSP降解新机制及其极端环境降解特性
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批准号:32000074
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:24.0万元
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批准年份:2020
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负责人:曲长凤
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依托单位: