サンゴが雲を作り気候を変化させているのか？遺伝子解析技術を用いた検証

珊瑚会产生云并改变气候吗？

• 批准号: 20K21860
• 负责人: 新里 宙也
• 金额: $ 4.08万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-07-30 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K21860/
• 关键词: サンゴ; DMSP; DMS; 遺伝子

海岸で感じる「磯の香り」の原因である硫化ジメチル（DMS）は、さまざまな植物プランクトンが浸透圧調節物質として生成するジメチルスルホニオプロピオン酸（DMSP）から、主に細菌や植物プランクトン自身が持つDMSPリアーゼという酵素により、DMSへと転換される。DMSは大気中で水蒸気の凝結核となり雲を形成するので、太陽光を遮ることによる地球冷却効果の役割を果たすと考えられている。我々は造礁サンゴのゲノム情報の比較解析から、特定のサンゴ（ミドリイシ属）でDMSPリアーゼに似たアミノ酸配列を持つ遺伝子（DMSPリアーゼ様遺伝子）の数が、ゲノム上で大きく増加していることを発見した。ミドリイシ属サンゴに多く存在するDMSPリアーゼ様遺伝子は、一体どのような役割を果たしているのかを明らかにすることを目的とする。真核生物におけるDMSPリアーゼ様遺伝子の進化を明らかにするため、これまでに解読されているサンゴや褐虫藻のゲノム情報や、様々な生物のトランスクリプトームデータベース(NCBI TSA）から相同遺伝子を収集し、分子系統解析を行った。その結果、動物のDMSPリアーゼ様遺伝子は同一起源を持つ、刺胞動物以外の動物からは確認されない、褐虫藻・円石藻など他の真核生物のDMSPリアーゼ様遺伝子や原核生物のDMSPリアーゼとは起源が異なる、ことを明らかにし、これら成果を国際誌で報告した。ゲノム情報を向上させたミドリイシ科複数種とミドリイシ属サンゴとの比較ゲノム解析を行った結果、ミドリイシ属のDMSPリアーゼ様遺伝子の遺伝子数の増加は、コモンサンゴ属との分岐後に起こったことも明らかになった。さらに、DMSPリアーゼ様遺伝子はミドリイシの幼生段階において高発現していることが判明したので、幼生段階の遺伝子発現パターンについても解析を開始した。

The reason why the coastal environment is sensitive to "phosphorus" is that sulfur compounds (DMS) are produced by plants and osmotic pressure regulating substances, mainly bacteria and plants themselves, and DMSP is produced by enzymes. DMS is the result of water vapor condensation and cloud formation. We will compare and analyze the information of the system, the specific system, the DMSP, and the DMSP. The purpose of the DMSP is to create a system that allows the user to access and use the information in a timely manner. Eukaryotic DNA sequencing and molecular systematics analysis of DNA sequencing and DNA sequencing. The results show that DMSP from animals has the same origin, animals other than cnidaria have been confirmed, brown algae, pelagic algae and other eukaryotic DMSP from eukaryotes have different origins, and the results have been reported in international journals. In addition, the number of the transmitted elements of the DMSP of the DMSP is increased. In addition, the DMSP has not been able to detect the high level of transmission in the juvenile stage, and the analysis of transmission in the juvenile stage has begun.

项目成果

Can Acropora tenuis larvae attract native Symbiodiniaceae cells by green fluorescence at the initial establishment of symbiosis?

• DOI: 10.1371/journal.pone.0252514
• 发表时间: 2021
• 期刊: PloS one
• 影响因子: 3.7
• 作者: Yamashita H;Koike K;Shinzato C;Jimbo M;Suzuki G
• 通讯作者: Suzuki G

サツマハオリムシのゲノム解析と組織別トランスクリプトーム解析による共生関連遺伝子の探索

通过萨摩金龟子的基因组分析和组织特异性转录组分析寻找共生相关基因

• 发表时间: 2022
• 作者: 内田大賀;善岡祐輝;新里宙也
• 通讯作者: 新里宙也

Genomic analysis of a reef‐building coral, <i>Acropora digitifera</i> , reveals complex population structure and a migration network in the Nansei Islands, Japan

对造礁珊瑚<i>Acropora digitalifera</i>的基因组分析揭示了日本南西群岛复杂的种群结构和迁徙网络

• DOI: 10.1111/mec.16665
• 发表时间: 2022
• 期刊: Molecular Ecology
• 影响因子: 4.9
• 作者: Tsuchiya Kojin;Zayasu Yuna;Nakajima Yuichi;Arakaki Nana;Suzuki Go;Satoh Noriyuki;Shinzato Chuya
• 通讯作者: Shinzato Chuya

18種のミドリイシ科サンゴの全ゲノム解読が明らかにする、ミドリイシ属の環境適応戦略

18种鹿角珊瑚的全基因组测序揭示了鹿角珊瑚的环境适应策略

• 发表时间: 2020
• 作者: 新里 宙也;鈴木 豪;山下 洋;佐藤 矩行
• 通讯作者: 佐藤 矩行

ナガレハナサンゴにおける蛍光タンパク質遺伝子の独自進化

Nagarehana 珊瑚荧光蛋白基因的独特进化

• 发表时间: 2022
• 作者: 右田 かよ;長濱 峻介;菅野 重樹;内田 大賀，識名 信也，新里 宙也
• 通讯作者: 内田 大賀，識名 信也，新里 宙也