新興感染症パンデミック予防に向けたタイ国における未知病原体の潜在的蔓延状況調査

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本研究の目的は、タイ山間部において蔓延している病原体をヒト、野生動物、媒介節足動物から網羅的に同定することで、今後流行を起こす可能性がある未知病原体を検出することである。国際研究グループ(タイ)との連携により実施する。新型コロナウイルスの影響で予定していた渡航ができなくなったため国内での活動を余儀なくされた。そのため本年度はタイの病原体の検出に先立ち、前年度までに改良を続けてきた病原体検出技術を用いて、国内で採取した節足動物を用いた解析を行うこととした。京都府下で採取した野外マダニより核酸抽出し、16S rRNA遺伝子をPCR にて増幅し、次世代シーケンサーにて、マダニの保有する細菌叢について解析を行った。その結果、今回捕獲した野外マダニの細菌叢として、腸内細菌科細菌の他、リケッチア属、コクシエラ属、ミクロコッカス属、エーリキア属、スフィンゴモナス属などの細菌が検出された。中でもリケッチア属、コクシエラ属といった病原細菌も比較的高率に検出され、更なる解析の必要性が示唆された。一方で、同様に京都府下で採取した野外蚊より核酸抽出し、これまでに改良してきたフラビウイルス属をターゲットとしたユニバーサルプライマーを用いたPCR法にてフラビウイルス遺伝子を複数検出した。現在、塩基配列解析を含めさらなる解析を進めている一方で、ウイルス分離を試みている。また上記のような実際の実験を推し進める一方で、共同研究者どうしでリモート会議を行い(国内)、今後の研究の進め方などについて協議を行った。タイ側共同研究者とも同様にリモート会議を行った。