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Heterogeneity and hierarchy of biomacromolecular dynamics revealed by new methods of fluorescence correlation measurement

Heterogeneity and hierarchy of biomacromolecular dynamics revealed by new methods of fluorescence correlation measurement
荧光相关测量新方法揭示生物大分子动力学的异质性和层次结构
批准号:
21H01897
负责人:
石井 邦彦
金额:
$10.48万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2021-04-01 至 2025-03-31

项目摘要

项目成果

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1.走査型2D-FLCSによる生体高分子の広ダイナミックレンジ計測:本研究テーマについては前年度までに、走査型2D-FLCSの開発とDNAホリデイジャンクションへの応用に関する論文発表を完了している。本年度は関連する研究テーマとして、基板に固定したDNAホリデイジャンクションの一分子FRET信号計測を行った。その結果をデータ解析の専門家に提供する形で共同研究を行い、ノンパラメトリックベイズ推定を用いた一分子FRET信号の新たな解析法に関する成果を論文発表した。この解析法は従来法とは異なるアプローチで信号に含まれる情報を最大限に引き出すものであり、我々が提供した実験データによりこの新たな解析法の実用性を検証することが可能となった。2.多点相関計測によるダイナミクスの不均一性・階層性の検出:本研究テーマについては、当初の計画を若干変更して、多点相関解析により二点相関関数から得られなかった情報を引き出すという発想はそのままに、多次元の光子相関マップを活用したより広い意味での不均一性・ダイナミクスの計測手法の開発を行うこととした。本年度は、マイクロ流路を用いたラピッドミキシング法と2D-FLCSを組み合わせる手法の開発を行った。本手法では、マイクロ流路上で遅延時間を変えながら多数の2次元マップを作成することで3次元の光子相関マップを構築し、これに対して独立成分分析を適用する。この手法を用いて、ダイナミクスを示す不均一系について信号のモデルフリー分離が可能であることを明らかにし、その原理および応用について学会発表を行った。本手法により、これまで特殊な工夫が必要であったラピッドミキシング法への一分子計測法の適用が簡便に行えるようになり、非平衡条件での生体高分子ダイナミクスを詳しく検討することが可能になると期待される。
期刊论文(10)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Conformational dynamics study of DNA Holliday junction with a time window from 10^-6 to 10^-1 sec by scanning 2D FLCS
通过扫描 2D FLCS 的 DNA Holliday junction 构象动力学研究,时间窗为 10^-6 至 10^-1 秒
DOI: --
发表时间: 2021
期刊:
影响因子: --
作者: [Heo Wooseok, 長谷川一途, 岡本憲二, 佐甲靖志, 石井邦彦, 田原太平]
通讯作者: 田原太平
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [Heo Wooseok, Ishii Kunihiko, Tahara Tahei]
通讯作者: Tahara Tahei
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [Sarkar Bidyut, Ishii Kunihiko, Tahara Tahei]
通讯作者: Tahara Tahei
アリゾナ州立大学(米国)
亚利桑那州立大学(美国)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
8
    新しい蛍光相関計測法による生体高分子ダイナミクスの不均一性と階層性の解明
    海外基金