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環状ナフタレンジイミド-DNAによるカテナン構造を利用したDNAの固定化法開発

利用环萘二酰亚胺-DNA链烷结构开发DNA固定化方法

基本信息

批准号：
21H01967
负责人：
佐藤しのぶ
金额：
$ 11.15万
依托单位：
Kyushu Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究の目的は、cNDI固定化電極によるPCR産物検出チップの創成である。アミノ化cNDIは金表面に修飾したジチオプロピオン酸と縮合することでcNDI固定化チップを作成する。DNAとcNDIとの結合速度は、他のcNDI誘導体の速度論解析結果から数秒だと思われるため、cNDI固定化チップにPCR産物を振りかけると、わずか1分後にはDNAがチップ上に捕捉される。DNAとcNDIはカテナン構造で結合していると予想している。DNAの「呼吸」は、25°Cでは1.4 sに1回起こるが、cNDIが結合するとこの呼吸は抑制される。cNDIは数塩基置きにDNAに結合するため、電極には複数のcNDIでDNAを固定化していると考えている。このため、一部のcNDI-DNAカテナン構造が解離しても、ほかの部分でDNAは固定化されていると考えているが、これらのダイナミクスを解析できれば、薬剤等への応用が期待できる。また、DNAの「呼吸」を利用したDNA検出システムの例はなく、独創性が高い研究概念である。令和4年度は以下の研究を遂行した。1) cNDI-gluとして、cNDI-pip-gluを合成した。2) 電気化学測定において、cNDI-pip-gluがDNAを固定化すること、2本鎖および1本鎖オリゴヌクレオチドを用いて、その定量性を明らかにした。3) 120塩基対のPCR産物を用いて、濃度依存性を確認したところ、 0.1-20 ng/μLで定量的に変化した。4) コロナウイルス検出キットによりRNAより逆転写したサンプルを調整した。PCR10サイクルの産物で、100RNAコピー以上で電流増加が観察された。

The purpose of this study is to use cNDI immobilized electrodes to test the performance of PCR. To modify the gold surface of cNDI, to modify the gold surface, to modify the gold surface. The results of the analysis of the combination speed of DNA cNDI, the body speed of other cNDI, the number of seconds, the immobilization of cNDI, the vibration of PCR, and the capture of DNA after 1 minute. The DNA cNDI information system is designed to combine with the information you want to make. DNA "breathing", 25 °C "1.4 s" and cNDI combined with respiratory inhibition test. CNDI is based on the combination of DNA and electron microscopy, and the immobilization of cNDI and DNA is necessary. This is the first time that a cNDI-DNA has been created, and that some of the DNA immobilization devices have been immobilized, and that they are expected to be used in some cases. The concept of "breathing" in the study of the concept of "DNA" and "breathing" is studied by using the method of "breathing", "breathing" and "breathing". Ling and the following studies have been carried out in 2004. 1) cNDI-glu synthesis, cNDI-pip-glu synthesis. 2) Electrochemical determination, cNDI-pip-glu

项目成果

期刊论文数量（11）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Substituent effects of cyclic naphthalene diimide on G-quadruplex binding and the inhibition of cancer cell growth.

环萘二酰亚胺对 G-四链体结合和抑制癌细胞生长的取代作用。

DOI：
10.1016/j.bmcl.2021.128323
发表时间：
2021
期刊：
Bioorg. Med. Chem. Lett.
影响因子：
0
作者：
Fukuda;H.;Sato;S.;Zou;T.;Higashi;S.;Takahashi;O.;Habu;M.;Sasaguri;M.;Tominaga;K.;Takenaka;S.;Takeuchi;H.
通讯作者：
H.

九州工業大学竹中研究室

九州工业大学竹中研究室