ゲノムワイド関連解析を用いたマツノザイセンチュウの病原性因子の探索

利用全基因组关联分析寻找松线虫的毒力因子

• 批准号: 21H02249
• 负责人: 秋庭 満輝
• 金额: $ 11.23万
• 依托单位: Forest Research and Management Organization
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H02249/
• 关键词: マツノザイセンチュウ; マツ材線虫病; 病原力; GWAS

マツ材線虫病はマツノザイセンチュウを病原体とするマツの伝染病である。世界的に極めて重要な病害であるが、未だにマツノザイセンチュウがマツを枯死させる仕組みについては完全には明らかにされていない。本課題では、日本国内から収集された約200系統の野生型マツノザイセンチュウのゲノム配列情報と病原性に関連する表現型形質のデーターを基にゲノムワイド関連解析（GWAS）を実施し、マツノザイセンチュウの病原性に関与する遺伝子群を探索する。本年度は、前年度に引続き森林総合研究所で保管されているマツノザイセンチュウの保存株からDNA抽出を行い、次世代シークエンサーを用いた全ゲノムシークエンス解析に供した。マイクロサテライトによるgenotypingの結果や分離場所を考慮して供試する株を選択した結果、最終的に約180株の全ゲノムデーターを取得した。これらの株の大部分についてクロマツ苗木に対する接種試験により病原力の評価を実施した結果、病原力が極めて弱いものから強いものまでと幅広い範囲の病原力を示すことが明らかになった。

The pathogen was infected with the disease of wood. The world's most important diseases, diseases and diseases in the world. In this project, there are about 200 system wild-type antigens in Japan. The etiology of pathogens is tabulated. The etiology of pathogens is analyzed (GWAS), and the pathogenicity and subgroups of pathogens are explored. In the current year and the previous year, the forest research institute is responsible for the preservation of the plant, the DNA extraction line, and the next generation of the plant. The results of the genotyping results were selected by the quarantine site, and the most successful results were obtained from about 180 plants. Most of the plants and seedlings were inoculated with different pathogens. The results of pathogenicity test and pathogenicity test showed that the pathogenicity test showed that the pathogenicity was strong and strong.

项目成果

マツノザイセンチュウの増殖力と性比の多様性

松树线虫的多样性和性比多样性

• 发表时间: 2021
• 作者: 高村美月;桐野巴瑠;秋庭満輝;菊地泰生;新屋良治
• 通讯作者: 新屋良治