Structural basis of activation of a novel tumor progression signaling involving Wnt signaling proteins and supression by antibodies.
Structural basis of activation of a novel tumor progression signaling involving Wnt signaling proteins and supression by antibodies.
批准号:
21H02420
负责人:
柴田 直樹
金额:
$8.32万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
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英文摘要
R4年度は,研究計画調書に記した4項目のうち主に以下の3項目,① CKAP4-DKK複合体の構造解析,② CKAP4細胞外領域全体の構造解析,③ CKAP4-抗体フラグメント複合体の構造解析について研究を遂行した。以下にこれまでの結果について概要を示す。① CKAP4とDKK cysteine rich domain (DKK_CRD1)試料をそれぞれ別々に調製したものを混合し結晶化スクリーニングキットを用いて結晶化条件の検討を行ったところ,1条件において結晶が得られた。② CKAP4細胞外領域(128-602)のうち,431-602の領域について新たに発現系を構築し,結晶を得ることができた。放射光施設において回折実験を行ったところ,約 4オングストローム分解能のデータを得ることに成功した。③ 4種類の抗CKAP4モノクローナル抗体のFabフラグメントとCKAP4細胞外領域との複合体を調製した。結晶化スクリーニングを行うために十分な量の複合体試料を得ることが困難であったため,結晶構造解析法よりも少量での構造解析が可能なクライオ電子顕微鏡による単粒子解析を目指して測定を行った。その結果,ほとんどの粒子がグリッド上で気液界面に集合していることが判明した。得られた画像データから単粒子解析を行ったが,明瞭な三次元再構成像を得ることが困難であった。二次元でのクラスタリングではCKAP4-Fab複合体と思われる像が得られたため,グリッド作成法の検討により明瞭な三次元再構成像を得ることは可能であると思われる。
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会议论文
Structural insights into the very low activity of the homocoenzyme B12 adenosylmethylcobalamin in coenzyme B12-dependent diol dehydratase and ethanolamine ammonia-lyase
对辅酶 B12 依赖性二醇脱水酶和乙醇胺氨裂解酶中同型辅酶 B12 腺苷甲基钴胺素极低活性的结构见解
DOI:
10.1002/chem.202202196
发表时间:
2022
期刊:
Chem. Eur. J.
影响因子:
--
作者:
[Shibata, N., Higuchi, Y., Krautler, B., Toraya, T.]
通讯作者:
T.
Structural basis for activation of cobalt-carbon bond and control of adenosyl radical in coenzyme B12 catalysis
辅酶B12催化中钴碳键活化和腺苷自由基控制的结构基础
DOI:
10.1002/cbic.202300021
发表时间:
2023
期刊:
ChemBioChem
影响因子:
3.2
作者:
[Shibata, N., Toraya, T.]
通讯作者:
T.
DOI:
10.1111/febs.16755
发表时间:
2023-03-01
期刊:
FEBS JOURNAL
影响因子:
5.4
作者:
[Negoro,Seiji, Shibata,Naoki, Higuchi,Yoshiki]
通讯作者:
Higuchi,Yoshiki
新規がん増殖シグナル軸DKK/CKAP4経路の構造基盤と抗体による阻害機構解明
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批准号:24K09357
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2024
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负责人:柴田 直樹
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依托单位:
AIを応用した根尖性歯周疾患のエックス線検査に対する画像診断支援システムの構築
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批准号:23K09207
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.08万
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财政年份:2023
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负责人:柴田 直樹
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依托单位:
DMPsを用いた象牙質/歯髄複合体の再生に関する基礎的研究
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批准号:17K11726
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.5万
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财政年份:2017
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负责人:柴田 直樹
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依托单位:
MANETにおける需要を考慮した情報の登録と検索
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批准号:18700055
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.11万
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财政年份:2006
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负责人:柴田 直樹
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依托单位:
β-カテニンの分解制御を行うAxin-Dvl複合体の構造解析
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批准号:17770093
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2005
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负责人:柴田 直樹
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依托单位:
タンパク質複合体形成を利用したカルモジュリン依存性キナーゼの結晶化と構造研究
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批准号:15770071
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2003
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负责人:柴田 直樹
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依托单位:
ラットの実験的根尖病変の形成における神経ペプチドの作用について
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批准号:12771161
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:2000
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负责人:柴田 直樹
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依托单位:
超高分解能X線結晶構造解析によるFMN結合タンパク質のサブユニット認識機構解明
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批准号:11780474
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:2000
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负责人:柴田 直樹
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依托单位:
メダカ生殖巣の性分化過程における生殖細胞一体細胞相互作用に関する研究
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批准号:08740638
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1996
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负责人:柴田 直樹
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依托单位:
海外基金