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A study of a novel trans-regulator FIONA1 and the roles in evolutionary process in Arabidopsis thaliana

拟南芥新型反式调节因子FIONA1及其在进化过程中的作用研究

基本信息

批准号：
21H02538
负责人：
佐々木江理子
金额：
$ 10.57万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

近年、地球温暖化が顕在化しつつある中、生態系保全や環境適応的な農業育種の重要性が高まっている。そのような問題の対処に必要不可欠な植物の環境適応能力は表現型の可塑性と遺伝的な変化（進化）によって担保されている。しかし、一体どのような遺伝的な変化が環境適応を推進するのかという問いに明確な回答は出されていない。本研究では新規RNAメチルトランスフェラーゼFIONA1に注目し、 (1)分子メカニズム、(2) 環境適応における機能性を解明を目指して研究を実施した。FIONA1は哺乳類におけるRNAアデノシンメチル化酵素であるMETTL16のホモログであり、2022年以降、FIONA1の主要な機能性に関する複数の論文が報告されているが、(1) スプライスソームユニットU6 snRNAメチル化修飾を介したスプライシング制御 (Parker et al. eLife, 2022)、(2) メッセンジャーRNAの修飾を介したRNA代謝の調節機能 (Wang et al. Genome Biol, 2022; Sun et al., PLoS Genet, 2022, Xu et al., 2022, Adv. Science) のいずれが主要機能であるかという点に関して研究グループ間で見解が分かれる。私たちは既報の公開データおよびRNAメチル化変異体に加え、取得済みのFIONA1欠損変異体のRNAシークエンスデータを用いてデータ解析パイプラインの評価を行い、スプライシングパターン、RNAメチル化修飾領域ともに、解析パイプライン依存的な大きなバイアスが存在し、各論文の結論に影響を及ぼしていることを明らかにした。

In recent years, the importance of agricultural breeding for the preservation of ecosystems and environmental protection has become high in the midst of global warming. The environmental adaptability of plants, phenotypic plasticity and genetic evolution are essential for solving these problems. The answer to the question is clear. This study is aimed at clarifying the functional properties of new RNA molecules,(1) molecular molecules, and (2) environmental adaptation. FIONA1: Mammalian RNA Disorder and Mutagenesis of METTL16 by 2022; A Number of Papers Related to FIONA1's Main Functionality;(1) The RNA Disorder and Mutagenesis of U6 snRNA (Parker et al. eLife, 2022),(2) RNA modification mediates regulatory function of RNA metabolism (Wang et al. Genome Biol, 2022; Sun et al., PLoS Genet, 2022, Xu et al., 2022, Adv. Science) is the main function of this website. In addition, the FIONA1 loss variant RNA profile is used to analyze and evaluate the RNA profile, the RNA profile modification domain is used to analyze the RNA profile, and the RNA profile modification domain is used to analyze the RNA profile dependent on the RNA profile.