網羅的変異タンパク質定量解析に基づく再発大腸癌の診断、治療法開発

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本研究は新鮮大腸癌組織内、およびその培養分泌エクソソーム内に発現している変異タンパク質を独自のプロテオゲノミクス解析により定量的に一斉同定し、ここから術後早期再発例で特異的に発現が認められる細胞内、エクソソーム内変異タンパク質を特定、再発リスク関連変異タンパク質が持つ分子生物学的機能を明らかにすることで新しい機序の再発リスク診断、再発大腸癌治療法の開発に繋げることを目標とする。2022年度は、2021年度に引き続き大腸がん組織、および組織由来エクソソームにおける変異タンパク質の包括的な定量発現プロファイルを取得するため、同一患者由来大腸がん組織、正常組織の全エクソーム解析、その情報をもとにした大腸がん組織、および同組織由来エクソソーム中の網羅的変異タンパク質定量解析を実施した。計50例のがん部、正常部組織の全エクソンシークエンス解析、個別化タンパク質配列データベース作成、網羅的変異プロテオーム解析からは8000種以上のタンパク質が検出され、体細胞変異を含むペプチド配列も多数検出された。さらに、質量分析データの検索エンジンによる配列同定の正確性を検証するため安定同位体標識合成ペプチドを用いたMS/MSスペクトルマッチングも実施し、SkylineソフトウェアにおけるDotP scoreから確実な同定が行われていることも確認を行った。その上でMSクロマトグラムのピークエリア値による相対定量試験を実施し、大腸がん早期再発群、長期無再発群の二群解析から早期再発群でのみ発現が確認される、または有意に発現量が高い（低い）変異タンパク質を大腸癌術後再発リスク関連因子候補として抽出した。