Genetic and molecular epidemiology study of GWAS-identified pancreatic cancer-associated GP2 gene

GWAS鉴定的胰腺癌相关GP2基因的遗传和分子流行病学研究

• 批准号: 21H03186
• 负责人: 林 櫻松
• 金额: $ 10.48万
• 依托单位: Aichi Medical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H03186/
• 关键词: 膵がん; GP2; GWAS; SNP; ゲノムワイド関連解析; 遺伝子多型; ファインマッピング

アメリカ国立がん研究所(NCI)との共同研究で、欧米人を対象とした膵がん全ゲノム関連解析(GWAS)のサマリーデータを用いて、GP2遺伝子領域のバリアントと膵がんリスクの関連を検討した。その結果、ヨーロッ人集団ではrs78193826のマイナーアレルTの頻度が0.01％よりも低いため、本遺伝子型に関する情報が得られなかった。さらに、rs78193826と連鎖不平衡関係にあるほかのバリアント（rs117267808, rs73541251など）について検討したところ、いずれも膵がんリスクと有意な関連が認められなかった(P>0.05)。これらの結果より、GP2領域のバリアントは、日本人を含むアジア人に特異的なバリアントであることが示唆された。東北メディカル・メガバンク機構(ToMMo)とのGWAS共同研究で、膵がん症例500人、がん以外の健常人コントロール17551人について、SNPジェノタイピングとインピュテーション（遺伝子型情報の補完）が完了した。SAIGEを用いて、性別や主成分を補正した上でSNPと膵がんリスクの関連を評価した。その結果、膵がんリスクと有意（ゲノムワイド有意水準：P<0.00000005)に関連するSNPは同定されなかったものの、これまでのGWASで報告されている1番、9番、16番染色体のバリアントと膵がんリスクの関連は確認できた。来年度は、より詳細な解析や考察を行う予定である。

National Research Institute (NCI) and European Research Institute (GWAS) jointly study and analyze the relationship between the two sub-fields. The results of this study were as follows: 1. The frequency of the study was 0.01% in rs78193826, and the information related to the study was obtained. The linkage disequilibrium (rs117267808, rs73541251) was found in the linkage analysis (P>0.05). The result is that the GP2 domain is free of charge, and the Japanese are free of charge. Tohoku (ToMMo) and GWAS joint research, SAIGE uses the middle, sex and principal components to correct the SNP and its association. The results showed that there was no significant correlation between SNP identity and GWAS identity (P<0.000005), and there was no significant correlation between SNP identity and GWAS identity. The next year, the detailed analysis of the investigation, the predetermined line

项目成果

Glycoprotein 2 in health and disease: lifting the veil.

• DOI: 10.1186/s41021-021-00229-8
• 发表时间: 2021-12-03
• 期刊: Genes and environment : the official journal of the Japanese Environmental Mutagen Society
• 作者: Lin Y;Nakatochi M;Sasahira N;Ueno M;Egawa N;Adachi Y;Kikuchi S
• 通讯作者: Kikuchi S

Serum Soluble Fas Levels and Incidence of Liver Cancer in Nested Case-Control Study

• DOI: 10.1158/1055-9965.epi-22-0902
• 发表时间: 2023-02-01
• 期刊: CANCER EPIDEMIOLOGY BIOMARKERS & PREVENTION
• 影响因子: 3.8
• 作者: Adachi，Yasush;Nojima，Masanori;Tamakoshi，Akiko
• 通讯作者: Tamakoshi，Akiko

Prevalence estimates of Helicobacter species infection in pancreatic and biliary tract cancers.

胰腺和胆道癌中的螺旋细菌感染的患病率估计值。

• DOI: 10.1111/hel.12866
• 发表时间: 2022-03
• 期刊: Helicobacter
• 影响因子: 4.4