Association between free-living amoebae and amoeba-resistant bacteria in tap water and elucidation of potential infection risk

自来水中自由生活的阿米巴原虫和阿米巴抗性细菌之间的关联以及潜在感染风险的阐明

• 批准号: 21H03626
• 负责人: 枝川 亜希子
• 金额: $ 10.82万
• 依托单位: Osaka Institute of Public Health
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H03626/
• 关键词: 自由生活性アメーバ; 寄生細菌; アメーバ共培養法; 水系感染; アメーバ; 水道水

本研究では、水道水中のアメーバ及び寄生細菌の生息状況を明らかにしてこれらの関連性を解明する。今年度は、浄水場4カ所（夏期冬期の年2回）の水道水試料について、微生物検出を行った。アメーバは、フィルター貼付法を用いた培養法により検出を行った。冬期は不検出であったが、夏期の1試料から検出された。この検出されたアメーバをプレート上から回収し、アメーバ内に寄生する細菌の検出を試みた。ゲンタマイシン処理をした後、培地に接種し、30℃、37℃でそれぞれ培養した。検出されたコロニー20株について、MALDI-TOFMSで菌種同定を行ったところ、Micrococcus luteus 4株、Eschericha coli 16株と同定された。E.coliについては、16srRNA遺伝子を標的としたPCRとシーケンスを用いた塩基配列を解読した結果、アメーバ分離培地に使用している大腸菌株の遺伝子配列と類似していたことから、培地由来である可能性が高かった。また並行して、水道水試料をフィルター法により濃縮を行い、その一部はアメーバ共培養法に用いた。アメーバ共培養法には、純培養のAcanthamoeba castellaniiおよびA. polyphagaを用いた。濃縮試料およびアメーバ共培養法後の試料については、細菌叢解析を行うために、DNA抽出後に凍結保存した。昨年度に保存した水道水濃縮試料およびアメーバ共培養法後の試料について、次世代シーケンサーを用いた16srRNA遺伝子を標的としたゲノム配列の解読を行い、解析を進めているところである。

This study aims to clarify the relationship between the occurrence of parasitic bacteria and their biological status in waterways. This year, the water field 4 days (summer winter 2 years) of the waterway water sample test, microbial detection and operation. The method of culture is used to detect and detect the virus. In winter, there is no test, in summer, there is no test. The bacteria in the virus are detected on the surface of the virus. After the treatment, the culture was incubated at 30℃ and 37℃. 20 strains were isolated, MALDI-TOFMS strains were identified, 4 strains were Micrococcus luteus, 16 strains were Escherichia coli. E.coli DNA sequencing is highly likely to result in DNA sequencing of E. coli strains using PCR and DNA sequencing. In addition, the water sample of the waterway is concentrated in the middle of the water sample, and some of the water samples are used in the co-culture method. Acanthamoeba castellanii A. polyphaga After the concentrated sample is concentrated and co-cultured, the sample is frozen and stored after DNA is extracted. In the past year, the sample concentration of water in the waterway was too high to be stored. After the co-culture method, the sample was stored in the middle of the next generation. The sample was stored in the middle of the 16srRNA gene. The sample was analyzed and analyzed.