癌進展に関わる乳癌患者腸内細菌叢と宿主微小環境構築の交互作用解明

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腸管免疫は腸内細菌叢と量的・質的にバランスを保っており、dysbiosisと呼ばれる腸内細菌叢の恒常性の変容は、炎症性腸疾患などの消化管疾患のみならず、消化管外が標的となる関節リウマチや多発性硬化症などの全身性自己免疫疾患の発症に影響を及ぼすと考えられている。更に、近年、メタゲノム解析が可能となり、健常人由来の糞便のマイクロバイオームプロフィールや、疾患発症・進展並びにそれに関する宿主の免疫環境との関連性が徐々に明らかになっている。現在の所、腸内細菌叢が実際の癌患者、特に乳癌などの非消化器癌の発癌・進展、腫瘍内微小環境並びに宿主の癌免疫応答へ及ぼす影響はほとんど明らかとなっていない。本研究では、健常人との比較によって、乳癌患者特徴的な腸内細菌叢のプロフィールを同定し、それらの菌群の乳癌進展に及ぼす影響を検討する。また、TCGAデーターベースをリファレンスとして利用し、Nanostring技術によって同定された免疫サブタイプ(腫瘍内微小環境)と同定された腸内細菌叢との関連性を解析し、腫瘍免疫療法の奏効性に強く関わる免疫関連サブタイプ(腫瘍内微小環境)並びに乳癌患者の宿主免疫環境に与える影響を明らかにし、その分子機序を標的とする革新的がん治療薬開発の契機を得る。現在、当該施設のMiSeqシステムを用いた複数サンプル解析用のIndexが付与されたライブラリーの作製し、細菌叢解析を施行している。糞便より、いくつかのキットを使用し、ボルテックス時間等の抽出条件を変えて、DNAを抽出した。DNAの収量と品質に基づき抽出条件を決定した。 Preliminaryの実験により、16S rRNA領域をPCRによって増幅し、得られたサンプルを利用し、シーケンスを施行した。 現在、追加症例のリクルート中で、研究協力施設の症例も解析する予定としている。