癌進展に関わる乳癌患者腸内細菌叢と宿主微小環境構築の交互作用解明

阐明乳腺癌患者肠道微生物群与癌症进展相关的宿主微环境结构之间的相互作用

• 批准号: 19K24057
• 负责人: 和田 寛也
• 金额: $ 1.83万
• 依托单位: Fukuoka Dental College
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-08-30 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19K24057/
• 关键词: メタゲノム解析; 乳癌; 腸内細菌; 次世代シーケンサー; 腸内細菌叢

腸管免疫は腸内細菌叢と量的・質的にバランスを保っており、dysbiosisと呼ばれる腸内細菌叢の恒常性の変容は、炎症性腸疾患などの消化管疾患のみならず、消化管外が標的となる関節リウマチや多発性硬化症などの全身性自己免疫疾患の発症に影響を及ぼすと考えられている。更に、近年、メタゲノム解析が可能となり、健常人由来の糞便のマイクロバイオームプロフィールや、疾患発症・進展並びにそれに関する宿主の免疫環境との関連性が徐々に明らかになっている。現在の所、腸内細菌叢が実際の癌患者、特に乳癌などの非消化器癌の発癌・進展、腫瘍内微小環境並びに宿主の癌免疫応答へ及ぼす影響はほとんど明らかとなっていない。本研究では、健常人との比較によって、乳癌患者特徴的な腸内細菌叢のプロフィールを同定し、それらの菌群の乳癌進展に及ぼす影響を検討する。また、TCGAデーターベースをリファレンスとして利用し、Nanostring技術によって同定された免疫サブタイプ(腫瘍内微小環境)と同定された腸内細菌叢との関連性を解析し、腫瘍免疫療法の奏効性に強く関わる免疫関連サブタイプ(腫瘍内微小環境)並びに乳癌患者の宿主免疫環境に与える影響を明らかにし、その分子機序を標的とする革新的がん治療薬開発の契機を得る。現在、当該施設のMiSeqシステムを用いた複数サンプル解析用のIndexが付与されたライブラリーの作製し、細菌叢解析を施行している。糞便より、いくつかのキットを使用し、ボルテックス時間等の抽出条件を変えて、DNAを抽出した。DNAの収量と品質に基づき抽出条件を決定した。 Preliminaryの実験により、16S rRNA領域をPCRによって増幅し、得られたサンプルを利用し、シーケンスを施行した。 現在、追加症例のリクルート中で、研究協力施設の症例も解析する予定としている。

Bowel immune は intestinal bacterial flora, the amount of と qualitative に バ ラ ン ス を bartender っ て お り, dysbiosis と shout ば れ る intestinal bacterial flora の constancy の - let は, inflammatory bowel disease な ど の alimentary canal diseases の み な ら ず, digestive tube が mark と な る masato section リ ウ マ チ や multiple 発 sclerosis な ど の systemic himself immune disorders の 発 に influence を and ぼ Youdaoplaceholder0 test えられて る る. More に, in recent years, メ タ ゲ ノ ム resolution が may と な り の of the origins, the healthy human feces の マ イ ク ロ バ イ オ ー ム プ ロ フ ィ ー ル や, disease 発 disease progress and び に そ れ に masato す る の host immune environment と の masato even sex が xu 々 に Ming ら か に な っ て い る. Now, intestinal bacterial flora by の が be interstate の, special に breast carcinoma patients な ど の the digesters carcinoma の 発 cancer progress, tiny environment and inside the swollen sores び に の carcinoma immune 応 answer へ and host ぼ す influence は ほ と ん ど Ming ら か と な っ て い な い. This study で は, the healthy normal と の is に よ っ て, breast cancer patients of 徴 な intestinal bacterial flora の プ ロ フ ィ ー ル を with し, そ れ ら の breast cancer progression に の flora and ぼ す influence を beg す 検 る. ま た, TCGA デ ー タ ー ベ ー ス を リ フ ァ レ ン ス と し て using し, Nanostring technologies に よ っ て with fixed さ れ た immune サ ブ タ イ プ (tiny environment inside the swollen sores) with fixed と さ れ た intestinal bacterial flora と の masato even sex を analytical し, swollen sores immunotherapy の played sharper sex strong に く masato わ る immune masato even サ ブ タ イ プ (tiny environment inside the swollen sores) And び に breast cancer の に and host immune environment え る influence を Ming ら か に し, そ の molecular machine sequence を mark と す る innovative が ん treatment 薬 open 発 の opportunity を る. Now, when the set の MiSeq シ ス テ ム を with い た plural サ ン プ ル parsing using の Index が give さ れ た ラ イ ブ ラ リ ー の cropping し, bacterial flora analytic を imposed し て い る. Feces よ り, い く つ か の キ ッ ト を use し, ボ ル テ ッ ク ス を の spare conditions, such as time - え pump, DNA を て し た. DNA strand quantity と quality に basis づ <s:1> extraction conditions を determine <s:1> た. Preliminary の be 験 に よ り, 16 s rRNA を PCR に よ っ て raised し picture, ら れ た サ ン プ ル を using し, シ ー ケ ン ス を imposed し た. Now, in the additional cases <s:1> リ and <s:1> て ト ト ト ト, the で in the study collaboratively set up the case <s:1> analysis する and the と て て る る る are determined.