フィリピン小児出生コホートにおける急性呼吸器感染症病原体の経時的かつ網羅的解析

急性呼吸器感染症は発展途上国における小児死亡の主原因であり、急性呼吸器感染症に関与する病原体の解明は、小児急性呼吸器感染症の診断や治療、予防に重要である。当初は、フィリピン共和国の小児出生コホートにおける定期的な呼吸器検体採取と分子生物学的検出手法の併用により、小児急性呼吸器感染症に関与する病原体の経時的かつ網羅的解析を目的として本研究を計画していた。しかしながら、新型コロナウイルス感染症(COVID-19)パンデミックのため、渡航や新規研究活動の開始が困難となった。その間に、当研究室で以前にフィリピン共和国で収集した検体を用いて解析を行なった。急性の重症肺炎の診断でフィリピン共和国の病院に入院した小児から収集した上気道検体から、急性呼吸器感染症の病原ウイルスおよび細菌をreal-time PCRで検出し、検出病原体の組合せ(co-detection)や患者の臨床症状と検出病原体との関連を解析した。その結果、特定のウイルスと細菌との検出(co-detection)の頻度が高いことが明らかになった。今後、解析検体数を増やした解析の実施と、無症状者における検出病原体との内訳比較とを実施する予定である。また、COVID-19パンデミックによる負荷の軽減に伴い、フィリピン共和国での小児出生コホート研究を開始した。共同研究機関や当該地域の保健行政機関と協議を行なった上で、上気道検体の採取を開始した。

急性呼吸器感染症は発展途上国における小児死亡の主原因であり、急性呼吸器感染症に関与する病原体の解明は、小児急性呼吸器感染症の診断や治療、予防に重要である。当初は、フィリピン共和国の小児出生コホートにおける定期的な呼吸器検体採取と分子生物学的検出手法の併用により、小児急性呼吸器感染症に関与する病原体の経時的かつ網羅的解析を目的として本研究を計画していた。しかしながら、新型コロナウイルス感染症(COVID-19)パンデミックのため、渡航や新規研究活動の開始が困難となった。その間に、当研究室で以前にフィリピン共和国で収集した検体を用いて解析を行なった。急性の重症肺炎の診断でフィリピン共和国の病院に入院した小児から収集した上気道検体から、急性呼吸器感染症の病原ウイルスおよび細菌をreal-time PCRで検出し、検出病原体の組合せ(co-detection)や患者の臨床症状と検出病原体との関連を解析した。その結果、特定のウイルスと細菌との検出(co-detection)の頻度が高いことが明らかになった。今後、解析検体数を増やした解析の実施と、無症状者における検出病原体との内訳比較とを実施する予定である。また、COVID-19パンデミックによる負荷の軽減に伴い、フィリピン共和国での小児出生コホート研究を開始した。共同研究機関や当該地域の保健行政機関と協議を行なった上で、上気道検体の採取を開始した。