RNAプロセシングと共役するゲノム転写とその破綻機構の解明
阐明基因组转录与RNA加工及其分解机制
基本信息
- 批准号:19K24692
- 负责人:
- 金额:$ 35.69万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Fund for the Promotion of Joint International Research (Home-Returning Researcher Development Research)
- 财政年份:2021
- 资助国家:日本
- 起止时间:2021-03-12 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
本研究では、細胞核内で起こるRNA polymerase II (Pol II) 転写装置とRNAプロセシング装置のクロストークや非コードゲノム転写制御機構の解明を目標としている。また、RNAプロセシング機構が破綻している腎臓がんなどの疾患細胞モデルを用いて、その異常ゲノム転写-RNAプロセシング制御を解析する。このアプローチにより、基礎的なゲノム転写制御機構とがん細胞増殖や細胞分化の解明に貢献する。昨年度に開発した新生RNA解析法(Polymerase-Intact Nascent Transcript、POINT法)を用いて、転写制御の分子機構を解析した。特に、がん患者で多く変異している遺伝子の機能解析から、特定のクロマチン制御因子が効率の良い転写終結に必要であることがわかった。また、転写スピード制御因子も同様に転写終結に必要であることがわかった。これらの因子は、制御している遺伝子群が異なることから、転写終結の特異性があることがわかった。共同研究の成果として、選択的RNAスプライシング制御因子であるPTBP1が、転写と共役したスプライシング制御を介してDNAメチル化遺伝子DNMT3Bの発現を制御し、神経細胞特異的なエピジェネティクスに重要であることを示した(Iannone et al., Molecular Cell 2023)。また、Pol II CTD リン酸化制御と転写終結の詳細な分子機構も明らかにした(Tellier et al., EMBO Reports 2022)。
This study で は, within the nucleus で こ る RNA polymerase II (Pol II) planning write device と RNA プ ロ セ シ ン グ device の ク ロ ス ト ー ク や non コ ー ド ゲ ノ ム planning system of writing imperial institutions の interpret を target と し て い る. ま た, RNA プ ロ セ シ ン グ institutional flaw が し て い る renal viscera が ん な ど の disease cells モ デ ル を with い て, そ の abnormal ゲ ノ ム planning write - RNA プ ロ セ シ ン グ suppression を parsing す る. The basic なゲノム転 writing control mechanism とがん cell proliferation や cell differentiation <s:1> explanation に contribution する. Last year, に launched the た new RNA analysis method (Polymerase-Intact Nascent Transcript, POINT method) を using て て and 転 to write the molecular structure of the thesis を for the analysis of た. で に, が ん patients more く - different し て い る heritage 伝 son の function analytical か ら, specific の ク ロ マ チ ン suppression factor が sharper rate い の good planning to write an end に necessary で あ る こ と が わ か っ た. ま た, planning to write ス ピ ー ド suppression factor も with others に planning to write an end に necessary で あ る こ と が わ か っ た. こ れ ら の factor は, suppression し て い る heritage 伝 subgroup が different な る こ と か ら, planning to write an end の specificity が あ る こ と が わ か っ た. の joint research と し て, sentaku RNA ス プ ラ イ シ ン グ suppression factor で あ る PTBP1 が, planning to write と existing し た ス プ ラ イ シ ン グ suppression を interface し て DNA メ チ ル change heritage 伝 son DNMT3B の 発 を royal し, now god 経 cell specific な エ ピ ジ ェ ネ テ ィ ク ス に important で あ る こ と を shown し た (Iannone et al., Molecular Cell 2023. Youdaoplaceholder0, Pol II CTD リ, <s:1> acidification control と転 write the detailed な molecular institutions ら に に た た (Tellier et al., EMBO Reports 2022).
项目成果
期刊论文数量(19)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
CDK9 and PPA2 regulate the link between RNA polymerase II transcription termination and RNA maturation
CDK9 和 PPA2 调节 RNA 聚合酶 II 转录终止和 RNA 成熟之间的联系
- DOI:10.1101/2021.06.21.449289
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:1.Tellier M;Zaborowska J;Neve J;Nojima T;Hester S;Furger A;and Murphy S
- 通讯作者:and Murphy S
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