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ＲＮＡプロセシングと共役するゲノム転写とその破綻機構の解明

阐明基因组转录与RNA加工及其分解机制

基本信息

批准号：
19K24692
负责人：
野島孝之
金额：
$ 35.69万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Fund for the Promotion of Joint International Research (Home-Returning Researcher Development Research)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-03-12 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では、細胞核内で起こるRNA polymerase II (Pol II) 転写装置とRNAプロセシング装置のクロストークや非コードゲノム転写制御機構の解明を目標としている。また、RNAプロセシング機構が破綻している腎臓がんなどの疾患細胞モデルを用いて、その異常ゲノム転写-RNAプロセシング制御を解析する。このアプローチにより、基礎的なゲノム転写制御機構とがん細胞増殖や細胞分化の解明に貢献する。昨年度に開発した新生RNA解析法（Polymerase-Intact Nascent Transcript、POINT法）を用いて、転写制御の分子機構を解析した。特に、がん患者で多く変異している遺伝子の機能解析から、特定のクロマチン制御因子が効率の良い転写終結に必要であることがわかった。また、転写スピード制御因子も同様に転写終結に必要であることがわかった。これらの因子は、制御している遺伝子群が異なることから、転写終結の特異性があることがわかった。共同研究の成果として、選択的RNAスプライシング制御因子であるPTBP1が、転写と共役したスプライシング制御を介してDNAメチル化遺伝子DNMT3Bの発現を制御し、神経細胞特異的なエピジェネティクスに重要であることを示した（Iannone et al., Molecular Cell 2023）。また、Pol II CTD リン酸化制御と転写終結の詳細な分子機構も明らかにした（Tellier et al., EMBO Reports 2022）。

This study では, within the nucleus でこる RNA polymerase II (Pol II) planning write device と RNA プロセシング device のクロストークや non コードゲノム planning system of writing imperial institutions の interpret を target としている. また, RNA プロセシング institutional flaw がしている renal viscera がんなどの disease cells モデルを with いて, その abnormal ゲノム planning write - RNA プロセシング suppression を parsing する. The basic なゲノム転 writing control mechanism とがん cell proliferation や cell differentiation <s:1> explanation に contribution する. Last year, に launched the た new RNA analysis method (Polymerase-Intact Nascent Transcript, POINT method) を using てて and 転 to write the molecular structure of the thesis を for the analysis of た. でに, がん patients more く - different している heritage 伝 son の function analytical から, specific のクロマチン suppression factor が sharper rate いの good planning to write an end に necessary であることがわかった. また, planning to write スピード suppression factor も with others に planning to write an end に necessary であることがわかった. これらの factor は, suppression している heritage 伝 subgroup が different なることから, planning to write an end の specificity があることがわかった. の joint research として, sentaku RNA スプライシング suppression factor である PTBP1 が, planning to write と existing したスプライシング suppression を interface して DNA メチル change heritage 伝 son DNMT3B の発を royal し, now god 経 cell specific なエピジェネティクスに important であることを shown した (Iannone et al., Molecular Cell 2023. Youdaoplaceholder0, Pol II CTD リ, <s:1> acidification control と転 write the detailed な molecular institutions らににたた (Tellier et al., EMBO Reports 2022).