Development of the next-generation high-speed AFM and detailed dynamic behavior analysis of biomolecules

下一代高速原子力显微镜的开发和生物分子的详细动态行为分析

基本信息

  • 批准号:
    20H00327
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 28.54万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
  • 财政年份:
    2020
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2020-04-01 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本年は、昨年度までに開発に成功していた高速振幅計測器を実用化するために、広帯域の電子回路の製作得意とする企業とともに更なる広帯域化と操作性を向上させた電子回路を共同開発した。自作したものの帯域の数倍の高速化が見込まれている。また、昨年度までに開発していた超小型高速カンチレバーの変位をより精密に計測するために、変位計測のためのレーザースポットの微小化に取り組んだ。レーザースポット径を精密に計測する手法を開発し、レーザーダイオード、コリメーションレンズ、対物レンズを検討することで、従来のスポット径の21%程度にまでスポット径を微小化することができた。さらに、昨年度までに考案していた逆伝達関数法とアクティブダンピング法を組み合わせた電子回路(共振コントローラー)では、Zスキャナーの共振周波数とQ値を一緒にコントロールできることが実証できたため特許出願を行った(特願2022-141581)。また、開発途中の次世代型高速AFMを用いて、バイオ応用研究を進めた。たとえば、慢性腎臓病や骨粗鬆症などに関与するビタミン D 代謝酵素の過剰発現を抑えるために、ビタミン D 代謝酵素とDNAアプタマーの複合体の観察に成功した(ACS applied materials & interfaces誌)。また、新規のゲノム編集タンパク質CRISPR-Cas3が、狙ったDNA配列周辺のDNAを大規模に切断する様子の直接観察に成功した(Nat. Commun.誌)。その他にも、微小管結合タンパク質であるEB1とSka1の複合体(J. Biol. Chem.誌)、アクチン結合タンパク質であるRng2がミオシンIIの運動の下げること(Life Science Alliance誌)などを明らかにした。これにより開発した顕微鏡装置の性能を示すとともに、生物学的に意義深い新知見を得ることができた。
This year, the development of high-speed amplitude measurement, the production of electronic circuits, the development of electronic circuits Several times the speed of the self-operating band is increased. The development of ultra-small high-speed vehicles in the past year has led to the miniaturization of high-speed vehicles. The diameter of the material is measured accurately. The number of resonance cycles in the electronic circuit (resonance frequency) is determined by the number of resonance cycles in the electronic circuit (resonance frequency).(Patent Application No. 2022-141581) The next generation of high-speed AFM in the process of development has been developed. Successful detection of complex of metabolic enzymes and DNA in chronic kidney disease and osteoporosis (ACS applied materials & interfaces). The new regulations were successfully used to compile CRISPR-Cas3 and detect DNA sequences in large-scale direct detection (Nat. Commun.) The complex of EB1 and Ska 1 (J. Biol. Chem.), the complex of EB 2 and Ska1 (J. Biol. Chem.), the complex of EB 1 and Ska 2 (J. Biol. Chem.), the complex of EB 1 and Ska 1 (J. Biol. Chem.), the The performance of the micro-mirror device is shown in the following way:

项目成果

期刊论文数量(84)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
相分離生物学の全貌(現代化学増刊46)、「66 高速原子間力顕微鏡」を古寺哲幸、今井大達で執筆
相分离生物学的完整概述(现代化学特别版46),“66高速原子力显微镜”作者:Tetsuyuki Furudera和Daitatsu Imai
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    白木 賢太郎
  • 通讯作者:
    白木 賢太郎
高速AFMによる100-nmサイズの分子集団の直接観察
使用高速 AFM 直接观察 100 nm 大小的分子群
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    M. S. Alam;T. Shirokawa;T. Ichikawa;K. Miyazawa;C. M. Franz and T. Fukuma;古寺哲幸
  • 通讯作者:
    古寺哲幸
High-speed AFM visualizes translational GTPase factor pool formed around the ribosomal P-stalk
高速 AFM 可视化核糖体 P 柄周围形成的翻译 GTP 酶因子池
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    今井 大達;内海 利男;古寺 哲幸
  • 通讯作者:
    古寺 哲幸
Self- and Cross-Seeding on α-Synuclein Fibril Growth Kinetics and Structure Observed by High-Speed Atomic Force Microscopy
通过高速原子力显微镜观察α-突触核蛋白原纤维生长动力学和结构的自播种和交叉播种
  • DOI:
    10.1021/acsnano.0c03074
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    17.1
  • 作者:
    Takahiro Watanabe-Nakayama;Maika Nawa;Hiroki Konno;Noriyuki Kodera;Toshio Ando;David B Teplow;Kenjiro Ono
  • 通讯作者:
    Kenjiro Ono
Colorado State University/Univ. Colorado Sch. Med./University of Iowa College of Medicine(米国)
科罗拉多州立大学/科罗拉多大学医学院/爱荷华大学医学院(美国)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
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  • 通讯作者:
    鈴木基寛
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  • DOI:
  • 发表时间:
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
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  • 通讯作者:
    古寺 哲幸
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HS-AFM 可视化核糖体 P 柄周围形成的翻译 GTP 酶因子池
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    今井 大達;内海 利男;古寺 哲幸
  • 通讯作者:
    古寺 哲幸
Interpretation of HS-AFM images using coarse-grained molecular dynamics simulation
使用粗粒度分子动力学模拟解释 HS-AFM 图像
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    髙野 純;執行 航希;開発 秀星;田嶋 将;渡辺 信嗣;安藤 敏夫;古寺 哲幸;Noriyuki Kodera;Noriyuki Kodera
  • 通讯作者:
    Noriyuki Kodera
Gliding machinery of Mycoplasma mobile visualized by high-speed AFM
高速 AFM 可视化支原体移动的滑动机械
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    小林 昂平;古寺 哲幸;田原 悠平;豊永 拓真;笠井 大司;安藤 敏夫;宮田 真人
  • 通讯作者:
    宮田 真人

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    2024
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通过 HS-AFM 和计算模型了解胆固醇转运机制
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    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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    10628233
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 28.54万
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  • 批准号:
    2242779
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 28.54万
  • 项目类别:
    Standard Grant
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  • 批准号:
    10061100
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 28.54万
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    EU-Funded
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为德克萨斯南方大学生物物理学领域代表性不足的学生建立研究和教育伙伴关系
  • 批准号:
    2217057
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 28.54万
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    Continuing Grant
Canada 150 Research Chair in Biophysics
加拿大 150 生物物理学研究主席
  • 批准号:
    C150-2017-00015
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    2022
  • 资助金额:
    $ 28.54万
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  • 批准号:
    2121044
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 28.54万
  • 项目类别:
    Cooperative Agreement
Canada 150 Research Chair in Biophysics
加拿大 150 生物物理学研究主席
  • 批准号:
    C150-2017-00015
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 28.54万
  • 项目类别:
    Canada 150 Research Chairs
Canada 150 Research Chair in Biophysics
加拿大 150 生物物理学研究主席
  • 批准号:
    C150-2017-00015
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 28.54万
  • 项目类别:
    Canada 150 Research Chairs
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知道了