A novel mechanism of spermatogenesis regulated by long noncoding RNA and multi-functional genome element
A novel mechanism of spermatogenesis regulated by long noncoding RNA and multi-functional genome element
批准号:
20H03285
负责人:
木村 敦
金额:
$11.32万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-01 至 2024-03-31
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英文摘要
本研究は、精子形成の全容を理解することを目指して、一次精母細胞において長鎖非コードRNAと多機能性ゲノム(dual promoter-enhancer)が協働的に機能するという新しいメカニズムを、マウスを用いて検証するものである。計画3年目までで、精巣特異的長鎖非コードRNAであるlncRNA-HSVIIIノックアウトマウスの中に精子数が減少している個体が観察され、血中テストステロンレベルが減少していることも見出した。本年度は、このlncRNA-HSVIIIノックアウトマウスの精巣を用いたRNA-seq解析を行った。その結果、複数個体のノックアウト精巣で共通して発現低下している遺伝子が226個あることが判明した。その中には、一次精母細胞の遺伝子群やテストステロン合成に関わる遺伝子群も含まれており、それらの一部は定量的RT-PCRでも確認した。一方、DPEによって制御を受ける遺伝子群について、ここ数年でマウス一次精母細胞のChIP-seqデータが公共データベースに蓄積されていることから、それらを再解析して我々のデータと照合することとした。公共の精原細胞と一次精母細胞におけるH3K4me1のChIP-seqデータを解析し、各遺伝子の発現データも参照して、精原細胞で3784個、一次精母細胞で8799個のDPE候補配列を得た。現在、これらのDPE候補配列を、我々が独自に同定していたDPE候補配列と照合して、信頼度の高いDPE配列をリスト化している。さらにCRISPR-a法によるlncRNA-HSVIII過剰発現細胞の樹立を試みたところ、発現レベルが高くないものの、一定程度のlncRNA-HSVIII活性化が見られた。
期刊论文(5)
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会议论文
マウス精子形成における長鎖非コードRNAの機能と作用機構
长链非编码RNA在小鼠精子发生中的功能及机制
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Sakamoto Yuki, Kawamura Ayako, Suzuki Takamasa, Segami Shoji, Maeshima Masayoshi, Polyn Stefanie, De Veylder Lieven, Sugimoto Keiko, 木村敦]
通讯作者:
木村敦
DOI:
10.1016/j.bbrc.2020.10.049
发表时间:
2021-01-01
期刊:
BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS
影响因子:
3.1
作者:
[Bandara, Thusitha A. M. K., Otsuka, Kai, Kimura, Atsushi P.]
通讯作者:
Kimura, Atsushi P.
マウス精巣長鎖非コードRNAの意義を求めて
寻找小鼠睾丸长非编码RNA的意义
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Suzuki Toshitaka N., Matsumoto Yui K., 木村敦]
通讯作者:
木村敦
滑膜線維芽細胞におけるDKK1に着目した、治療抵抗性関節リウマチの病態解明
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批准号:24K19640
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2024
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负责人:木村 敦
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依托单位:
楽観バイアスを低減させる特殊詐欺防犯広報キャラクタデザイン指針の提案と評価
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批准号:24K15624
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2024
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负责人:木村 敦
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依托单位:
後縦靭帯骨化症バイオマーカーとしてのGla-rich proteinの有用性に関する検討
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批准号:23K08616
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.58万
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财政年份:2023
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负责人:木村 敦
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依托单位:
がんへの薬剤送達と徐放を同時に実現する量子ビーム架橋ペプチドナノ粒子の創製
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批准号:23K11713
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2023
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负责人:木村 敦
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依托单位:
体型プライミングが認知症高齢者の食物摂取に及ぼす効果の実験的解明
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批准号:21K02115
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2021
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负责人:木村 敦
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依托单位:
発生・生殖におけるプロリルエンドペプチダーゼの生理機能の解析
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批准号:98J02718
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.73万
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财政年份:1998
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负责人:木村 敦
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依托单位:
海外基金