In-depth surfaceome analysis of PDX models to develop innovative personalized therapies in pancreatic cancer

对 PDX 模型进行深入的表面组分析，以开发胰腺癌的创新个性化疗法

• 批准号: 20H03669
• 负责人: 田口 歩
• 金额: $ 11.48万
• 依托单位: Aichi Cancer Center Research Institute
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2023-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20H03669/
• 关键词: 膵癌; EUS-FNA; PDXモデル; プロテオミクス; 統合オミクスデータベース; 細胞表面タンパク質

膵癌の5年生存率はわずか10％未満であり、極めて予後が悪い。膵癌のゲノム情報は集積しつつあるが、有効な分子標的治療の開発には至っておらず、革新的なアプローチによって膵癌の克服に取り組む必要がある。細胞表面タンパク質は、癌において機能的に重要な役割を果たしているだけでなく、その局在から、直接的な治療標的としても非常に有望である。細胞表面タンパク質は細胞内タンパク質に比べて極めて微量であることから、本研究では膵癌患者から採取された臨床検体を用いて患者腫瘍組織移植（patient-derived xenograft; PDX）モデルを作成し、PDX腫瘍を用いて細胞表面タンパク質（サーフェスオーム）解析を行う。現在までに、膵癌43例においてPDXモデルを作成した。このうち15症例においては、さらに患者腫瘍由来細胞株（PDC）を樹立した。高度免疫不全モデルであるRag-2/Jak3二重欠損マウスを用いたPDXモデルの作成効率は、55.1％と良好であった。膵癌PDX腫瘍について、サーフェスオーム解析、リン酸化プロテオーム解析、RNAシーケンス解析が完了し、現在データ解析を行っている。また、並行して進めていた、膵癌公開データを用いたバイオインフォマティクス解析から、膵癌で過剰発現をしているlncRNAが膵癌細胞においてアポトーシスを抑制していることを見出しており、現在詳細な分子メカニズムの解析を行っている。今後は、PDXのエクソーム解析に加えて、PDCについてもエクソーム解析、RNAシーケンス解析、プロテオーム解析を行う。

The 5-year survival rate of cancer is. Cancer information is collected, molecular target therapy is developed, and innovative approaches are needed to overcome cancer. The cell surface is very important for the function of cancer, and the treatment target is very promising. In this study, patient-derived xenograft (PDX) tissue was prepared and analyzed from clinical samples taken from cancer patients. Now, 43 cases of PDX are produced. In 15 cases, PDCs were established. Highly immune deficiency rag-2/jak 3 double loss Rag-2/Jak3/Jak3 double loss rag-2/Jak3 double loss rag-2/jak 3/jak 3 double loss rag-2/jak 3/jak 3 double loss rag-2/jak 3 double loss rag-2/ Cancer PDX tumor detection, profile analysis, acidification profile analysis, RNA profile analysis completed, profile analysis performed In addition, in the case of cancer, the expression of lncRNA in cancer cells is inhibited by the expression of lncRNA in cancer cells. In the future, PDX analysis, PDC analysis, RNA analysis, and PDX analysis will be added.