個別化がんワクチン療法に向けた統合プロテオミクスによる新規がん抗原同定法の開発

利用整合蛋白质组学开发新型癌症抗原识别方法，用于个性化癌症疫苗治疗

• 批准号: 20K21556
• 负责人: 田口 歩
• 金额: $ 3.99万
• 依托单位: Aichi Cancer Center Research Institute
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-07-30 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K21556/
• 关键词: 難治がん; がん抗原; 個別化がんワクチン; プロテオミクス; HLAクラスI結合ペプチド; 免疫グロブリン結合タンパク質; PDXモデル; PDC; がんワクチン; HL Aリガンドーム; 自己抗体結合タンパク

がんワクチン療法は、免疫チェックポイント阻害剤との併用など、複合的がん免疫療法の１つとして大きな期待が寄せられている。個別化がんワクチンのターゲットとなるがん抗原は、現在、次世代シーケンサーによるゲノム情報に基づく、変異ペプチド（ネオアンチゲン）として予測同定されているが、免疫応答を誘導するのは、ネオアンチゲンのごくわずかである。本研究では、患者腫瘍組織移植（PDX）モデルにおいて、プロテオゲノミクスを応用した超高感度HLAクラスI分子結合ペプチド（HLAリガンドーム）解析を開発する。また、血漿中の自己抗体に結合している抗原タンパク質の網羅的プロテオーム解析を行う。これらの解析により、実際にがん細胞表面に提示されている抗原ペプチドと、生体で実際に免疫応答を引き起こしている抗原タンパク質を同定し、その統合的な解析から、真に免疫原性の高いがん抗原を同定する。本年度は、通常のデータベースサーチに加えてプロテオゲノミクス解析とde novoアミノ酸シーケンシングの統合による革新的なペプチド同定パイプラインの開発を完了した。患者由来肺がん細胞（PDC）、胃がんPDX腫瘍において高深度HLAリガンドーム解析を行い、抗原ペプチドのHLAアリルへの結合親和性スコアと統合して有望なペプチドの選択を進めている。また、自己抗体結合抗原解析においては、pH勾配液体クロマトグラフィーを応用して抗原を溶出することで、1,000個超の抗原同定が可能なハイスループット自己抗体結合抗原解析法を開発した(特願2022-152089)。現在同一患者由来のHLAリガンドームデータと血漿自己抗原プロファイルの統合解析を行っている。

が ん ワ ク チ は ン therapy, immune チ ェ ッ ク ポ イ ン ト resistance against tonic と の and な ど, composite が ん immunotherapy の 1 つ と し て big き な expect が send せ ら れ て い る. Individualized が ん ワ ク チ ン の タ ー ゲ ッ ト と な る が ん antigen は, now, next generation シ ー ケ ン サ ー に よ る ゲ ノ ム intelligence に base づ く, - different ペ プ チ ド (ネ オ ア ン チ ゲ ン) と し て to test with fixed さ れ て い る が, induced immune 応 answer を す る の は, ネ オ ア ン チ ゲ ン の ご く わ ず か で あ る. This study で は, swollen sores in patients with tissue transplantation (symbol) モ デ ル に お い て, プ ロ テ オ ゲ ノ ミ ク ス を 応 with し た ultrahigh sensitivity HLA ク ラ ス I molecules ペ プ チ ド (HLA リ ガ ン ド ー ム) parsing を open 発 す る. ま た に の himself, plasma antibody combining し て い る antigen タ ン パ ク qualitative の snare プ ロ テ オ ー ム parsing う を line. こ れ ら の parsing に よ り, be interstate に が に prompt さ ん cell surface れ て い る antigen ペ プ チ ド と, living body で be interstate に immune 応 answer を lead き up こ し て い る antigen タ ン パ ク qualitative を with し, そ の integrative な parsing か ら, high true に immunogenicity の い が ん antigen を with fixed す る. This year は, usually の デ ー タ ベ ー ス サ ー チ に plus え て プ ロ テ オ ゲ ノ ミ ク ス parsing と DE novo ア ミ ノ acid シ ー ケ ン シ ン グ の integration に よ る innovative な ペ プ チ ド with fixed パ イ プ ラ イ ン の open 発 を finished し た. Origin in patients with pulmonary が ん cells (PDC), stomach が ん symbol swollen sores に お い て high depth of HLA リ ガ ン ド ー ム parsing を い, antigen ペ プ チ ド の HLA ア リ ル へ の combined with affinity ス コ ア と integration し て could な ペ プ チ ド の sentaku を into め て い る. ま た, their antibody antigen analytic に お い て は, pH hook with liquid ク ロ マ ト グ ラ フ ィ ー を 応 with し て antigen を dissolution す る こ と で, 1000 super の antigen with が may な ハ イ ス ル ー プ ッ ト their antigen of antibody combining analytic method を open 発 し た (2022-152089, may). Now, for the same patient, the homologous HLAリガ ド <s:1> ムデ タと タと タと plasma self-antigen プロファ <s:1> <s:1> <s:1> is combined and analyzed を lines って る る る.

项目成果

抗原分子の単離方法

分离抗原分子的方法

• 发表时间: 2022

免疫グロブリン結合タンパク質の高深度プロテオーム解析と、新規がんバイオマーカー探索研究への応用

免疫球蛋白结合蛋白的深度蛋白质组学分析及其在发现新癌症生物标志物研究中的应用

• 发表时间: 2022
• 作者: 阿部 雄一;磯村 久徳;田口 歩
• 通讯作者: 田口 歩

In-depth proteomic analysis of cancer models

癌症模型的深入蛋白质组学分析

• 发表时间: 2022
• 作者: Ayumu Taguchi;Yuichi Abe;Taisuke Kajino;Hisanori Isomura
• 通讯作者: Hisanori Isomura

Physician scientistを志して ～新しい外科の地平線を切り拓くために～

立志成为医师科学家～开拓外科新视野～

• 发表时间: 2022
• 作者: 森 治樹;阿部雄一;梶野泰祐;夏目誠治;木下敬史;大内 晶;水野和幸;三宅 亨;飯田洋也;細田和貴;小森康司;清水泰博;谷 眞至;田口 歩
• 通讯作者: 田口 歩