個別化がんワクチン療法に向けた統合プロテオミクスによる新規がん抗原同定法の開発

利用整合蛋白质组学开发新型癌症抗原识别方法，用于个性化癌症疫苗治疗

基本信息

批准号：
20K21556
负责人：
田口歩
金额：
$ 3.99万
依托单位：
Aichi Cancer Center Research Institute
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-07-30 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

がんワクチン療法は、免疫チェックポイント阻害剤との併用など、複合的がん免疫療法の１つとして大きな期待が寄せられている。個別化がんワクチンのターゲットとなるがん抗原は、現在、次世代シーケンサーによるゲノム情報に基づく、変異ペプチド（ネオアンチゲン）として予測同定されているが、免疫応答を誘導するのは、ネオアンチゲンのごくわずかである。本研究では、患者腫瘍組織移植（PDX）モデルにおいて、プロテオゲノミクスを応用した超高感度HLAクラスI分子結合ペプチド（HLAリガンドーム）解析を開発する。また、血漿中の自己抗体に結合している抗原タンパク質の網羅的プロテオーム解析を行う。これらの解析により、実際にがん細胞表面に提示されている抗原ペプチドと、生体で実際に免疫応答を引き起こしている抗原タンパク質を同定し、その統合的な解析から、真に免疫原性の高いがん抗原を同定する。本年度は、通常のデータベースサーチに加えてプロテオゲノミクス解析とde novoアミノ酸シーケンシングの統合による革新的なペプチド同定パイプラインの開発を完了した。患者由来肺がん細胞（PDC）、胃がんPDX腫瘍において高深度HLAリガンドーム解析を行い、抗原ペプチドのHLAアリルへの結合親和性スコアと統合して有望なペプチドの選択を進めている。また、自己抗体結合抗原解析においては、pH勾配液体クロマトグラフィーを応用して抗原を溶出することで、1,000個超の抗原同定が可能なハイスループット自己抗体結合抗原解析法を開発した(特願2022-152089)。現在同一患者由来のHLAリガンドームデータと血漿自己抗原プロファイルの統合解析を行っている。

癌症疫苗疗法高度预期是一种复杂的癌症免疫疗法，例如与免疫检查点抑制剂结合使用。目前，由个性化癌症疫苗靶向的癌症抗原基于下一代测序仪基于基因组信息而被预测并确定为突变肽（新抗原），但只有少数新抗原诱导免疫反应。在这项研究中，我们将使用患者肿瘤组织植入（PDX）模型中的蛋白质组学进行超敏感的HLA I类分子结合肽（HLA Ligandome）分析。此外，对与血浆中自身抗体结合的抗原蛋白的全面蛋白质组学分析进行了。这些分析确定了实际上在癌细胞和抗原蛋白表面上实际上表现出的抗原肽，这些肽实际上会导致活体中的免疫反应，以及对这些真正具有高度免疫原性的癌症抗原的综合分析。今年，我们通过整合蛋白质组学分析和从头开始的氨基酸测序来完成创新肽识别管道的开发，此外还可以进行定期搜索。在患者来源的肺癌细胞（PDC）和胃癌PDX肿瘤中进行了高深度HLA Ligandome分析，并将抗原肽与HLA等位基因的结合亲和力分数整合在一起，以促进选择有希望的肽的选择。此外，在对自身抗体偶联的抗原的分析中，开发了高通量自身抗体偶联的抗原分析方法，可以通过应用pH梯度液体色谱法来鉴定1000多个抗原来洗脱抗原（日本PATENT NOMADE NOMAY PATENT APSPEASS NOME NOME NOME NOME 20222-152089）。目前，我们正在对同一患者的HLA Ligandome数据和等离子体自身抗原轮廓进行综合分析。

项目成果

期刊论文数量（5）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

抗原分子の単離方法

分离抗原分子的方法

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

免疫グロブリン結合タンパク質の高深度プロテオーム解析と、新規がんバイオマーカー探索研究への応用

免疫球蛋白结合蛋白的深度蛋白质组学分析及其在发现新癌症生物标志物研究中的应用

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
阿部雄一;磯村久徳;田口歩
通讯作者：
田口歩

In-depth proteomic analysis of cancer models

癌症模型的深入蛋白质组学分析

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Ayumu Taguchi;Yuichi Abe;Taisuke Kajino;Hisanori Isomura
通讯作者：
Hisanori Isomura

Physician scientistを志して～新しい外科の地平線を切り拓くために～

立志成为医师科学家～开拓外科新视野～

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
森治樹;阿部雄一;梶野泰祐;夏目誠治;木下敬史;大内晶;水野和幸;三宅亨;飯田洋也;細田和貴;小森康司;清水泰博;谷眞至;田口歩
通讯作者：
田口歩

DOI：
{{ item.doi }}
发表时间：
{{ item.publish_year }}
期刊：
{{ item.journal_name }}
影响因子：
{{ item.factor }}
作者：
{{ item.authors }}
通讯作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ monograph.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ sciAawards.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ conferencePapers.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ patent.updateTime }}

田口歩其他文献

子宮内膜症マウスモデルにおける原始卵胞異常活性化に関する検討

子宫内膜异位症小鼠模型原始卵泡异常激活的研究

DOI：
发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
0
作者：
竹内亜利砂;甲賀かをり;佐竹絵里奈;真壁友子;田口歩;泉玄太郎;原田美由紀;平田哲也;廣田泰;平池修;大須賀穣;藤井知行
通讯作者：
藤井知行

本邦喘息患者における日本語版ナイメーヘン質問票の信頼性および妥当性の検討

日本哮喘患者奈梅亨问卷日文版的信度和效度检验

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
阿部雄一;磯村久徳;田口歩;西嶌春生;小寺祥子，丸岡秀一郎，釋　文雄，黒澤雄介，山田志保，福田麻佐美，神津　悠，平沼久人，權　寧博
通讯作者：
小寺祥子，丸岡秀一郎，釋　文雄，黒澤雄介，山田志保，福田麻佐美，神津　悠，平沼久人，權　寧博

高腹膜播種転移マウス大腸癌細胞株のマルチオミクス解析による大腸癌腹膜播種転移機構の解明

通过对高腹膜播散和转移的小鼠结直肠癌细胞系进行多组学分析，阐明结直肠癌腹膜播散和转移的机制

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
磯村久徳;森治樹;梶野泰祐;阿部雄一;三宅亨;谷眞至;田口歩
通讯作者：
田口歩

Dropped Head Syndrome Caused by Thoracolumbar Deformity: A Report of 3 Cases

胸腰椎畸形致低头综合征3例报告

DOI：
10.2106/jbjs.cc.22.00280
发表时间：
2022
期刊：
JBJS case connector
影响因子：
0
作者：
森治樹;阿部雄一;梶野泰祐;夏目誠治;木下敬史;大内晶;水野和幸;三宅亨;飯田洋也;細田和貴;小森康司;清水泰博;谷眞至;田口歩;田中栄;Yoshifumi Kudo
通讯作者：
Yoshifumi Kudo