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Elucidation of differences between human and great apes revealed by structures of chromosome ends

染色体末端结构揭示人类和类人猿之间的差异

基本信息

批准号：
20J20222
负责人：
大泉祐介
金额：
$ 1.98万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-24 至 2023-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

ヒトとチンパンジーは進化的に最も近いとされているが、さまざまな性質の違いがある。興味深いことに、大型類人猿に属するチンパンジー、ボノボ、ゴリラは、Subterminal Satellite (StSat) と呼ばれる32 bp単位の大規模な繰り返し配列をもつが、ヒトには全く存在しない。このことから、StSat配列の有無がヒトと大型類人猿の性質を分けた原因のひとつになっている可能性が考えられる。そこで本研究では、StSat領域の分子機能やStSat周辺の染色体領域のDNA配列を探ることにより、ヒトとチンパンジーの進化の一端を明らかにすることを目的とした。まず、StSat領域における染色体構造を明らかにするため、in vivoにおいてStSat領域特異的に存在するタンパク質を網羅的に同定できるPICh法を行った。得られたサンプルの質量分析や予備実験の結果、従来のPICh法ではStSat領域に存在するタンパク質の同定は困難であることが示された。次に、StSat領域がもたらす周辺の染色体領域への影響について調べるため、チンパンジーのStSat領域に隣接するDNA配列の同定を行った。チンパンジーのゲノムDNAの解読は完了していないため、StSatやテロメアに隣接する配列はほとんどわかっていない。そこで、NGSデータを用いてStSatおよびテロメアに隣接する配列を新規に取得することにした。はじめに、ヒトの完全なゲノムアセンブリが構築されているCHM13について、元となったシークエンスデータからテロメアに隣接するDNA配列のみを特異的に構築できるか試みた。その結果、ヒトのテロメア配列のほとんどはTAR1と呼ばれる繰り返し配列と隣接しており、この割合はゲノムアセンブリの解析データと一致したことから、全ゲノムDNAを構築することなくテロメアの隣接配列を取得できたことを確認した。

Please tell me that the latest progress has been made in the near future. The flavor is deep, the big ape belongs to the big ape, the Subterminal Satellite (StSat) calls the 32 bp bit, the large-scale module returns to the queue, and the whole system exists. The reason for this is the possibility that there is a possibility that there is a possibility that there is an ape sex score, which is the reason for the reason. In this study, the molecular mechanism in the field of StSat, the molecular mechanism in the StSat, the chromosome field, the DNA in the chromosome field, the array of probes, and the information in the field of development, the purpose of this study is to clarify the purpose of the study. The chromosomes in the StSat domain and the in vivo domain are created in the same way as the PICh method in the Internet. Based on the results of the quantitative analysis, it is concluded that there are significant differences in the results of the PICh method in the field of StSat. In the second, StSat field, the chromosome field, the DNA field, the chromosome field, the DNA field, the DNA field, the same line, the same line. This is the end of the DNA solution. When you are done, you will be able to pick up the queue, and the StSat will be connected. The new specification can be obtained by using the new specification, which can be obtained by using the new specification, which can be obtained by using the new StSat specification. Please do not know what to do. You will not be able to do this. You will not be able to do so. You will need to assign DNA to your CHM13. In the results, you need to know the results of the configuration, and then you can get the confirmation from the TAR1. You can get the confirmation from the column after the configuration is completed.