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多機能因子として哺乳類胚発生を制御するGARP complexの役割

GARP复合物作为多功能因子在控制哺乳动物胚胎发育中的作用

基本信息

批准号：
20K06453
负责人：
杉本道彦
金额：
$ 2.83万
依托单位：
Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2023-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究は、細胞内小胞輸送を制御するタンパク質複合体GARP complexを構成する各因子の哺乳類発生過程における役割の違いを、single-cell RNA sequencing（scRNA-seq）により解明することを目的とする。本研究の成果により、これまでに知られていなかった細胞内小胞輸送経路による哺乳類胚発生制御メカニズム解明につながる成果が得られると期待される。2020年度は解析のための基盤技術の整備と解析を進めるための変異マウスの整備を中心に進める計画であったが、研究期間開始直後に新型コロナウイルス感染症対策のため在宅勤務措置と実験動物維持施設の利用制限措置が取られたため、変異マウスの整備と実験の実施に大きな制限がかかったが、scRNA-seqの効率化・低コスト化に大きく貢献する「Cell labeling technique for multiplex scRNA-seq」を新規に開発した。細胞表面を非特異的に標識する本技術は、これまでに市販されているmultiplex化手法と比べても、汎用性が高くコストも大幅に低減できることから、本研究の推進のみならず、広く多方面での適用が想定される。また、multiplex scRNA-seqのデータ解析パイプラインの立ち上げに成功した。これにより、multiplex scRNA-seqのより高度な解析を高精度にかつ効率的にすすめることが可能となった。合わせて、変異マウス由来多能性幹細胞細胞の樹立・整備も進めた。変異マウスの整備は当初計画よりも遅れているものの2020年度後半より再開し、次年度からの研究推進に間に合わせることができた。

The aim of this study is to elucidate the role of single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) in mammalian development by controlling intracellular transport and the composition of the GARP complex. The results of this study are expected to be useful in understanding the intracellular vesicle transport pathway in mammalian embryo development. In 2020, the analysis of the substrate technology and the analysis of the progress of the development of the research period began immediately after the start of the new type of infection control policy, in the home service management of animal maintenance facilities utilization control measures, the development of different equipment and the implementation of large control limits A new regulation,"Cell labeling technique for multiplex scRNA-seq," has been developed for efficiency and low cost of scRNA-seq. This technique is based on non-specific labeling of cell surfaces, and is intended to be applied in a variety of ways. The resolution of multiplex scRNA-seq was successful. The high resolution of the multiplex scRNA-seq allows for high accuracy and efficiency. Stem cells are pluripotent stem cells, and they can be used to control the growth of stem cells. In the second half of 2020, we will start the research again.