RNAの酸化損傷ダイナミズムが制御するゼブラフィッシュ初期発生メカニズムの解明

阐明RNA氧化损伤动态控制的早期斑马鱼发育机制

基本信息

  • 批准号:
    22K15042
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.91万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
  • 财政年份:
    2022
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2022-04-01 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

ゼブラフィッシュの初期発生過程において、活性酸素の一種である過酸化水素の細胞ないレベルと分布は発生段階や細胞群ごとにダイナミックに変化しており、これによって生じるRNAの酸化とトランスクリプトームの変化が密接にリンクしていると考えられる。まずは酸化損傷の生じたRNAを網羅的に同定するために、ゼブラフィッシュ胚からRNAを抽出したのち抗8-oxoG抗体を用いたRNA免疫沈降によって酸化損傷RNAを精製した。ポジティブコントロールとして、過酸化水素処理をしたゼブラフィッシュ胚からもRNAを抽出し同様の精製をおこなった。次世代シークエンスに供する前にRNAのクオリティコントロールをノザンブロッティングやRT-qPCRで行なったところ、酸化損傷に非特異的なRNAも大量に精製されていることが判明した。後の検討で、抽出したトータルRNAをそのまま免疫沈降に用いたことによるリボソームRNAのコンタミが問題であり、リボソームRNAの除去とRNAの断片化ののちに免疫沈降による精製をおこなう必要があると判明した。現在は改良したプロトコルによるRNAの精製と次世代シークエンスのライブラリ調整をおこなっている。次世代シークエンスが遅れており内在のmRNAを用いた評価はおこなえていないが、蛍光タンパク質をコードするレポーターmRNAに酸化損傷を施し、ゼブラフィッシュ胚へのインジェクション実験をおこなった。その結果、翻訳開始因子eIF2alphaのリン酸化に端を発する統合ストレス応答や、MAPキナーゼp38のリン酸化によるストレス応答が惹起されることがわかった。各々のタンパク質のリン酸化の程度は、mRNAの酸化損傷の程度に応じて大きくなることも見出した。
During the initial development of the cell, the distribution of one kind of active acid in the cell is divided into the development stage and the cell population is divided into two stages: the first stage and the second stage. In order to capture RNA from acidified lesions, anti-8-oxoG antibodies were used to extract RNA from embryos and to precipitate RNA immunologically to refine acidified damaged RNA. The process of RNA extraction and purification is carried out by acidification. The next generation of RNA was identified as a non-specific RNA gene. After the investigation, the extraction of RNA and the purification of RNA by immunosedimentation were identified. Now we have improved the RNA refinement and the next generation RNA refinement. The next generation of gene expression in the gene expression system was evaluated. The gene expression system was characterized by the presence of acid damage in the gene expression system. The gene expression system was characterized by the presence of acid damage. The results show that the inversion initiation factor eIF2alpha is the initial factor for the development of the MAPs, and the MAP is the initial factor for the development of the MAPs. The degree of acidification of each protein and the degree of acidification damage of mRNA are also discussed.

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

石橋 幸大其他文献

石橋 幸大的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

相似海外基金

初期発生制御分子群の相互作用マップの創出~発育不全病態の包括的理解~
创建早期发育调节分子​​相互作用图谱~全面了解发育失败的病理学~
  • 批准号:
    24K11046
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.91万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
ヒト副腎皮質のリモデリング機構と腫瘍病変の初期発生機構の解明
阐明人肾上腺皮质重塑机制及肿瘤病变早期发生机制
  • 批准号:
    24K19292
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.91万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
初期発生に重要なmRNAの翻訳が相転移により制御される仕組みの解明
阐明对早期发育很重要的 mRNA 翻译受相变控制的机制
  • 批准号:
    23KJ0019
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.91万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
コケ植物の生殖器官の初期発生プログラムの解析
苔藓植物生殖器官早期发育程序分析
  • 批准号:
    23K05811
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.91万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
ヒト幹細胞とゲノム・エピゲノム編集による初期発生原理の統合的理解
使用人类干细胞和基因组/表观基因组编辑对早期发育原理的综合理解
  • 批准号:
    23H00436
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.91万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
オミクス手法を用いたT細胞の初期発生を誘導するNotchシグナルの解明
使用组学方法阐明诱导早期 T 细胞发育的 Notch 信号
  • 批准号:
    22K16331
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 2.91万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
哺乳類初期発生の時空間的ゆらぎと自己組織化機構の解明
阐明早期哺乳动物发育过程中的时空波动和自组织机制
  • 批准号:
    21H04776
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 2.91万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
脊椎動物の初期発生における機械的ストレス分布とその情報伝達的役割の解明
阐明脊椎动物早期发育过程中的机械应力分布及其信息传递作用
  • 批准号:
    19J22652
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 2.91万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
クルマエビの初期発生段階・雌雄別発現解析による性決定機構の解明
通过早期发育阶段和性别特异性表达分析阐明车虾的性别决定机制
  • 批准号:
    19K06243
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 2.91万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
脊索動物ワカレオタマボヤを用いた母性因子の大規模な機能解析による初期発生の研究
使用脊索动物 Wakareotamaboya 通过母体因素的大规模功能分析研究早期发育
  • 批准号:
    18J10929
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 2.91万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了