Interdisciplinary study for construction of the method examining the rice cultivation history using genetic information remained inside of phytolith

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本研究は、稲作の存否や水田など生産遺構の探査に利用されてきたイネのプラント・オパール中の遺伝情報により「時間と空間を網羅したイネ情報の体系的な蓄積」を可能とする研究手法の構築を目指している。2022年度の取組と実績は以下のとおりである。【取組1：国内遺跡を対象としたイネや栽培に関するデータの収集と分析】板付遺跡など国内遺跡からの試料採取、採集済試料のプラント・オパールについて形状解析、DNA分析を実施した。垂柳遺跡出土イネの解析と石器分析の結果に基づき、同遺跡で弥生時代の諸条件に近づけた復元水田での耕作実験を行い、栽培技術の比較検討や収量の試算を行った。九州の出土イネの形質データおよび対馬などの在来品種の栽培環境に関するデータを収集した。【取組2：プラント・オパールからの遺伝情報の収集と分析確度の検討】弥生時代を含む水田土壌から抽出されたイネプラント・オパールに内包するDNAを分析した。葉緑体ゲノム領域と核ゲノム領域の解析では、連続層序の試料において、生態型や大まかな系譜復元ができることがわかった。【取組3：日本で栽培履歴のある赤米の遺伝的解析】大唐米（インド型）と赤米（日本型）の葉緑体ゲノムの比較データを作成し、中部日本の在来種と中世に渡来した大唐米を識別マーカーから比較検証した。結果、大唐米はインド型であること、一部に葉緑体が日本型に置換した系統が存在することを見出した。【取組4：大唐米ならびに赤米系品種等の作付け状況の調査検討】兵庫県相生市資料館、新潟県立文書館、兵庫県たつの市教育委員会、九州歴史博物館、長野県立歴史館、松本市文書館、大分県立先哲史料館、国文学研究資料館、埼玉県立文書館で、各地域に残された近世の名主家文書から、年貢関係史料と村明細帳、留書類などの調査を実施した。