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Building Inventory of Evolution and Luminescent Mechanisms of Bioluminescent Proteins

建立生物发光蛋白的进化和发光机制清单

基本信息

批准号：
19H03200
负责人：
由良敬
金额：
$ 11.07万
依托单位：
Waseda University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

20世紀の前半から、人類は地球の様々な空間の探索を行い、それにともないさまざまな発光生物の存在を報告してきた。大場裕一（中部大学）らは発光生物の情報を徹底的に収集し、その情報を「発光生物リスト・プロジェクト (LLL)」としてウェブ上に公開している。研究代表者はこのリストを出発点にし、その後に同定された発光生物を加え、これらの発光生物がもつ発光分子（タンパク質と低分子）を徹底的な文献検索で見いだし、発光生物と発光部位、発光タンパク質、発光低分子を接続した公開データベースの作成に取りかかった。2022年度においては、データベースBioHiKR (http://www.biohikr.life/)のデータをさらに増強すると共に、昨年度変更したデータ構造にもとづき継続的な運営ができるようになったことを確かめた。2020年に館山で取得したウミホタルのゲノムデータ解析を進めた。ミトコンドリアのゲノム構築は完了し、日本の他の地域に生息するウミホタルおよび館山で過去に取得したウミホタル由来のミトコンドリアゲノム塩基配列と比較したところ、塩基置換が想定よりも多く存在することがわかった。核ゲノムの塩基配列断片から、ルシフェラーゼおよびルシフェリン合成用酵素の配列取得を試みたが、今のところ見出すことができていない。2022年6月には、野外調査において発光中のゲンジボタルをとらえ、発光時のトランスクリプトーム解析を実施した。夕暮れから早朝までの３時間おきにゲンジボタルを確保し、それらの頭部、胸部および尾部で発現しているRNAの配列を決定することができた。これらの発現RNAの中にはルシフェリンをルシフェラーゼに供給することに関与するタンパク質が存在することが期待され、現在バイオンフォマティクス解析をおこなっている。

In the first half of the 20th century, human beings explored the earth and space, and reported the existence of photo-organisms. Yuichi Ohba (Chubu University) has thoroughly collected information on photoroids and made public the information on "Photoroids Risit-Projicot (LLL)". The research representatives have thoroughly searched the literature on the development of photo-emitting organisms, including photo-emitting molecules (molecules and low molecules), and made public the preparation of photo-emitting sites, photo-emitting substances and low molecules. In 2022, BioHiKR (http://www.biohikr.life/) increased its sales volume and increased its sales volume last year. In 2020, the museum will be able to achieve the goal of analyzing the situation. In the past, it has been obtained from other regions of Japan. In the past, it has been obtained from other regions of The sequence of enzymes used in the synthesis of nuclear enzymes was obtained from the sequence of DNA fragments, DNA fragments and DNA fragments. In June 2022, the analysis of light emission in the field survey was carried out. In the evening, the first three days of the morning, the first three days of the evening, the second day of the evening, the first three days of the evening, the third day of the evening, the first three days of the evening, the third day of the evening, the first day of the evening, the evening, the first day of the evening, the third day of the evening, the evening, the first three days of the The expression of RNA in the medium is related to the expression of RNA in the medium.