课题基金 / 基金详情

Building Inventory of Evolution and Luminescent Mechanisms of Bioluminescent Proteins

Building Inventory of Evolution and Luminescent Mechanisms of Bioluminescent Proteins
建立生物发光蛋白的进化和发光机制清单
批准号:
19H03200
负责人:
由良 敬
金额:
$11.07万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2019
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2019-04-01 至 2024-03-31

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项目成果

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20世紀の前半から、人類は地球の様々な空間の探索を行い、それにともないさまざまな発光生物の存在を報告してきた。大場裕一(中部大学)らは発光生物の情報を徹底的に収集し、その情報を「発光生物リスト・プロジェクト (LLL)」としてウェブ上に公開している。研究代表者はこのリストを出発点にし、その後に同定された発光生物を加え、これらの発光生物がもつ発光分子(タンパク質と低分子)を徹底的な文献検索で見いだし、発光生物と発光部位、発光タンパク質、発光低分子を接続した公開データベースの作成に取りかかった。2022年度においては、データベースBioHiKR (http://www.biohikr.life/)のデータをさらに増強すると共に、昨年度変更したデータ構造にもとづき継続的な運営ができるようになったことを確かめた。2020年に館山で取得したウミホタルのゲノムデータ解析を進めた。ミトコンドリアのゲノム構築は完了し、日本の他の地域に生息するウミホタルおよび館山で過去に取得したウミホタル由来のミトコンドリアゲノム塩基配列と比較したところ、塩基置換が想定よりも多く存在することがわかった。核ゲノムの塩基配列断片から、ルシフェラーゼおよびルシフェリン合成用酵素の配列取得を試みたが、今のところ見出すことができていない。2022年6月には、野外調査において発光中のゲンジボタルをとらえ、発光時のトランスクリプトーム解析を実施した。夕暮れから早朝までの3時間おきにゲンジボタルを確保し、それらの頭部、胸部および尾部で発現しているRNAの配列を決定することができた。これらの発現RNAの中にはルシフェリンをルシフェラーゼに供給することに関与するタンパク質が存在することが期待され、現在バイオンフォマティクス解析をおこなっている。
期刊论文(4)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
BioHiKR: DB of bioluminescent proteins
BioHiKR:生物发光蛋白数据库
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Evolutionary Analysis of Luciferase, Photoprotein and Luciferin
荧光素酶、发光蛋白和荧光素的进化分析
DOI: --
发表时间: 2019
期刊:
影响因子: --
作者: [舟橋 実里, 鈴木 博文, 由良 敬]
通讯作者: 由良 敬
BioHiKR
生物HiKR
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
遺伝子同時転写単位同定にもとづく新規DNA修復関連タンパク質の予測
  • 批准号:
    16014227
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $1.6万
  • 财政年份:
    2004
  • 负责人:
    由良 敬
  • 依托单位:
進化情報を用いたDNA修復酵素複合体の相互作用部位予測
  • 批准号:
    15014233
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $2.37万
  • 财政年份:
    2003
  • 负责人:
    由良 敬
  • 依托单位:
全ゲノム配列比較にもとづくDNA修復酵素の比較と分類
  • 批准号:
    14015213
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $2.5万
  • 财政年份:
    2002
  • 负责人:
    由良 敬
  • 依托单位:
モジュール3Dキーノートを用いたゲノム機能予測法の開発
海外基金