葉緑体の内膜形成から迫る核様体ダイナミクスの制御機構

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2021年度は，葉緑体の分化過程において核様体の形態や機能を司る分子メカニズムについて膜形成に着目した研究を行った。①チラコイド膜の発達に不可欠な膜脂質ホスファチジルグリセロール（PG）の役割を調べるため，シロイヌナズナのPG欠損変異体におけるマイクロアレイデータを詳細に解析した。PG欠損変異体では，色素体コードのRNAポリメラーゼ（PEP）によって転写される色素体遺伝子の発現が特に強く低下したことから，PGがPEPの機能に深く関わる可能性を提唱した。この成果はJournal of Experimental Botany誌上で発表した。②PEPによる転写パターンをゲノムワイドに明らかにするため，クロマチン免疫沈降とハイスループットシーケンシングの組み合わせ（ChIP-seq）により，PEPのDNA結合特性を解析した。その結果，PEPがtRNA・rRNA領域や転写開始点近傍と強く相互作用する傾向を見出した。また色素体のシグマ転写因子（SIG）のSIG2とSIG6が特異的なtRNA遺伝子の転写を誘導する可能性を提唱した。成果は査読付きの学術誌に投稿中である。色素体シーケンスデータ可視化ツールPlavistoも公表した。③核様体の膜アンカーが核様体の形態と機能に与える影響を明らかにするため，シロイヌナズナを用いて膜アンカータンパク質MFP1の機能を解析した。mfp1変異体では核様体が凝集し，色素体DNAのコピー数も減少することを発見した。強光照射時のPEPによる急速な転写誘導が，mfp1変異体では抑制されることをChIP-seq法により突き止めた。MFP1による核様体の膜アンカーが，核様体の膜上での分配とストレス条件下における効率的な色素体遺伝子の発現に重要であり，植物の柔軟な環境応答に貢献する可能性を示唆している。この成果については，現在論文化の作業を進めている。