トランスポゾンの抗抑制因子が備える配列特異性創出機構の解明・応用

转座子抗阻遏因子序列特异性产生机制的阐明及应用

• 批准号: 19J10106
• 负责人: 齋藤 絡
• 金额: $ 1.47万
• 依托单位: The Graduate University for Advanced Studies
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-04-25 至 2021-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19J10106/
• 关键词: トランスポゾン; エピジェネティクス

トランスポゾン(Transposable Elements, 以下TE)の転移は宿主にとって潜在的に有害であり、通常はエピジェネティックな機構で抑制されている。一方、ゲノム中のTEの割合は多くの真核生物で数十%におよび、これはTEが宿主による転移抑制に抗い増殖してきたことを示している。しかし、いかにしてTEが宿主による抑制に抗ってきたのかはほとんど明らかでなく、抑制戦略(宿主によるTEの抑制機構)と比較して、抗抑制戦略(TEによる抑制解除機構)の理解は立ち遅れている。本研究ではその理解を目的として、シロイヌナズナのTEの一つVANDAL21属がコードする抗抑制因子VANC21に着目した。VANC21は、VANDAL21を配列特異的に脱抑制する機能を持つことが示されている。興味深いことに、ゲノム中には近縁な他のVANDAL属が存在するものの、VANC21はそれらを脱抑制しない。また、VANDAL6属のVANC6も同様の高い特異性を持ちながら、近縁な21属には作用しない。この「標的に高い配列特異性を持ちながら、その特異性を属ごとに分化させる」というシステムは、宿主を傷つけると自身の増殖も不利になってしまうTEの特性を反映したものと考えれ、抗抑制戦略を理解する上で重要な性質と考えられる。しかしながら、VANC21・6タンパク質は既知のタンパク質と相同性がなく、DNA結合ドメイン、結合様式など多くの点が明らかでない。本研究はこれらを解明することで、属全体に渡って多様な配列特異性を創出するVANCの分子基盤を明らかにし、抗抑制戦略の理解を試みる。今年度はVANC21タンパク質を用いて、配列特異性を決定する残基の同定、結合様式の同定、の2点を試みた。

Transmissible Elements (TE) are the most common and potentially harmful elements of migration. In the first place, the number of cells isolated from the host cells increased by tens of %, while in the second place, the number of cells isolated from the host cells increased by tens of %. To understand the mechanism of host inhibition, to compare the mechanism of host inhibition and to understand the mechanism of host inhibition and to understand the mechanism of host inhibition. The purpose of this study is to understand the role of VANDAL21 in the development of TE. VANC21 and VANDAL21 are configured with specific de-suppression functions to maintain the display. The VANC21 is not inhibited by the presence of VANC21. VANC6, VANDAL6, VANC6, VANC6, VANC6, The characteristics of TE reflect the high alignment specificity of the target, the high specificity of the target, the high differentiation of the target, the host injury, and the high reproduction disadvantage of the target. VANC21·6 This study aims to understand the molecular basis of VANC and its anti-inhibition strategy. This year, VANC21 was used to determine the identity of residues, the identity of binding patterns, and two points.