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ポリネシア人はなぜ背が高いのか。－ポリネシア人における正の自然選択の検出－

波利尼西亚人为什么很高？

基本信息

批准号：
19J12435
负责人：
一色真理子
金额：
$ 1.34万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-25 至 2021-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19J12435/
关键词：
ポリネシアオセアニア自然選択ゲノム混血

项目摘要

ポリネシア人の祖先はアジア起源の集団であり、彼らはポリネシアへの移住の過程でニアーオセアニアにおいてパプア系の集団と混血したと考えられる。しかし、ポリネシア人は遺伝的に近いとされる他のアジア集団やオセアニア集団と比べ、約１０cm高い平均身長をもっており、混血後何らかの要因で高身長化が起こったと考えられた。本研究では、『ポリネシア人の高身長化は、身長を高くする効果のあるパプア人由来の多型、あるいはポリネシア人特異的突然変異が、正の自然選択によって集団中に広まったために起きた』という仮説を立て、検証を行った。前年度までに、ポリネシア集団トンガ、パプア集団ギデラに対し全ゲノムシークエンスを行い、取得済みのDNAチップによる全ゲノムSNPデータとともに解析を行い、ポリネシア人ゲノム中の自然選択がはたらいた領域を検出した。本年度は、前年度に検出した領域に存在し、身長に影響をあたえているオセアニア特異的な候補多型を、integrated Haplotype Score(iHS),Fst,非同義置換かどうか、などの指標から選出、関連解析を行ったが、本研究の仮説を満たすような遺伝的多型は見つからなかった。そこで、少数の多型ではなく複数の多型に自然選択がかかっていた（Polygenic selection）可能性を検証することとした。これまでにゲノムワイド関連解析( UK BioBank、 BioBank Japan)によって報告されている身長関連多型のポリネシア集団におけるFstの値を調べたところ、ゲノム全体からランダムにサンプリングした場合に比べて、身長関連多型の平均Fst（対CHB）の値は有意に大きくなっており、ポリネシア集団において身長への Polygenic selectionが起きていた可能性が示唆された。

The origin of the ancestral family, the family and the family. The average body length of a woman who is tall, tall In this study, people tend to grow up, grow up, grow tall, tall, In the previous year, in the previous year, the In the current year and the previous year, there are polymorphisms, integrated Haplotype Score (iHS), Fst, which are not synonymous with each other in the current and previous years. In this year and the previous year, there are significant differences in the number of candidates in the field. Some polymorphisms, a few polymorphisms, multiplicates, natural selections, genetic errors (Polygenic selection), the possibility of polymorphisms.

项目成果

期刊论文数量（7）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

日本人の身長の遺伝的背景

日本人身高遗传背景

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
一色真理子;渡部　裕介;大橋　順
通讯作者：
大橋　順

HLA class II領域に作用したオセアニア地域特異的な自然選択

大洋洲地区特定的自然选择作用于 HLA II 类区域

DOI：
发表时间：
2019
期刊：
影响因子：
0
作者：
一色真理子;中伊津美;渡部裕介;木村亮介;古澤拓郎;夏原和美;山内太郎;中澤港;石田貴文;稲岡司; 松村康弘; Ricky Eddie; 大塚柳太郎; 大橋順
通讯作者：
大橋順

Admixture and natural selection shaped genomes of an Austronesian-speaking population in the Solomon Islands

DOI：
10.1038/s41598-020-62866-3
发表时间：
2020-04-23
期刊：
SCIENTIFIC REPORTS
影响因子：
4.6
作者：
Isshiki, Mariko;Naka, Izumi;Ohashi, Jun
通讯作者：
Ohashi, Jun

HLA class II 領域に作用したパプア集団特異的な自然選択

作用于 HLA II 类区域的巴布亚人群特异性自然选择

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
Major Histocompatibility Complex
影响因子：
0
作者：
工藤耕司;初貝安弘;一色真理子，大橋順
通讯作者：
一色真理子，大橋順

Genomic regions showing evidence for adaptive introgression in an admixed population have undergone natural selection in the ancestral population.

显示混合群体中适应性基因渗入证据的基因组区域在祖先群体中经历了自然选择。

DOI：
发表时间：
2019
期刊：
影响因子：
0
作者：
Mariko Isshiki;Izumi Naka;Ryosuke Kimura;Nao Nishida;Minato Nakazawa;Tsukasa Inaoka;Yasuhiro Matsumura,Ryutaro Ohtsuka;Jun Ohashi
通讯作者：
Jun Ohashi