Introgression from archaic hominins into Oceania populations
Introgression from archaic hominins into Oceania populations
批准号:
21H02570
负责人:
大橋 順
金额:
$11.23万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
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英文摘要
現生人類の中で、旧人(ネアンデルタール人、デニソワ人)に由来するゲノムを最も多く保有しているのは、パプア人やメラネシア島嶼民などのオセアニア地域の人々である。ヒトはオセアニアへ二度進出しているが、旧人からの移入変異、特にエネルギー倹約型の移入変異がオセアニア地域への進出過程で適応的に作用した可能性がある。本研究では、オセアニアの代表的な集団(パプア集団、メラネシア集団、ポリネシア集団、ミクロネシア集団)を対象にゲノム解析を行い、(i)旧人からオセアニア人への移入変異、(ii)エネルギー代謝と関連する移入変異、(iii)適応的移入変異を調べ、ヒト進化遺伝学的視点から、オセアニアへの進出に寄与した旧人からの遺伝子移入の実態を明らかにすることを目的とする。オセアニア集団を対象に旧人からの遺伝子移入領域を調べたところ、2番染色体のGCG遺伝子コード領域において、先行研究(Vernot et al., 2016)と同様に遺伝子移入の痕跡が観察された。特に、トンガではGCG遺伝子上のネアンデルタール人由来変異の頻度が当該領域で最も高かった。そこで、関連解析を行ったところ、GCG遺伝子領域中のネアンデルタール人由来変異rs34211565-Gは、トンガ人において中性脂肪値の減少と有意に関連していた(P-value=0.037)。現在、他の遺伝子移入領域中に存在するSNPについて、パプア人約700名、メラネシア人約300名、ポリネシア人約150名、ミクロネシア人約100名を対象に、肥満・脂質代謝・糖代謝との関連を検討している。
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会议论文
疾患関連変異探索のための遺伝統計学的解析法の開発とデング出血熱関連解析への応用
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批准号:20018004
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.74万
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财政年份:2008
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负责人:大橋 順
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依托单位:
疾患関連変異探索のための遺伝統計学的解析法の開発とデング出血熱関連解析への応用
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批准号:18018006
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.54万
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财政年份:2006
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负责人:大橋 順
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依托单位:
自然選択がヒトゲノム多様性および連鎖不平衡構造に与える影響の解析
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批准号:18710160
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2006
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负责人:大橋 順
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依托单位:
SNPの数理解析とSNP利用研究のための新規統計解析手法の開発
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批准号:16012212
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.84万
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财政年份:2004
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负责人:大橋 順
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依托单位:
ヒトゲノム多様性と連鎖不平衡ブロックの解析
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批准号:16710138
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2004
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负责人:大橋 順
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依托单位:
SNPの数理解析とSNPを用いた疾患感受性遺伝子探索法の開発
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批准号:15012214
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.01万
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财政年份:2003
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负责人:大橋 順
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依托单位:
SNPの数理解析とSNP利用研究のための新規統計解析手法の開発
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批准号:14013016
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.61万
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财政年份:2002
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负责人:大橋 順
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依托单位:
SNPの数理解析とSNP利用研究のための統計解析手法の開発
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批准号:12204040
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2000
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负责人:大橋 順
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依托单位:
HLA遺伝子多型の数理解析に基づく渡来系弥生人の移住時期と規模の推定
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批准号:11740477
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1999
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负责人:大橋 順
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依托单位:
海外基金