GH30 β-1,6-グルコシダーゼの構造機能解析と有用糖質合成への応用
GH30 β-1,6-グルコシダーゼの構造機能解析と有用糖質合成への応用
批准号:
19K05826
负责人:
磯野 直人
金额:
$2.75万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2019
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2019-04-01 至 2024-03-31
中文摘要
Caldicellulosiruptor bescii由来β-1,6-グルコシダーゼ(CbGH30_1)の結晶化条件の最適化を行った。また、同条件において、本酵素の生成物であるグルコースとの複合体の結晶化も行った。X線回折装置を用いて各結晶からの回折強度データを測定した。すでに明らかにされているSalmonella typhimurium由来GH30タンパク質SrfJの構造をモデルとした分子置換法により位相決定を行い、分解能約2オングストロームで構造を決定した。CbGH30_1は他のGH30酵素と同様にTIMバレル構造を持つことが明らかとなった。酵素-生成物複合体において、グルコースはサブサイト-1の位置に結合していると予想された。ラミナリビオース、α-グルコシルフルオリド、α-グルコース 1-リン酸を基質として、HhGH30Aのグライコシンターゼと、Ochromonas danica由来β-1,3-グルカンホスホリラーゼ(β-1,3-グルカン伸長酵素)の反応を同時に行った。その結果、直鎖β-1,3-グルカンの沈殿(α-グルコース 1-リン酸を基質としたβ-1,3-グルカンホスホリラーゼのみの反応で生じる)は生じず、水溶性の多糖が合成された。生成した多糖をエタノール沈澱で回収し、メチル化分析により構造を解析した。その結果、水溶性多糖はβ-1,6-グルコシド結合による分岐を有するβ-1,3-グルカン(β-1,3-1,6-グルカン)であることが明らかとなった。また、この水溶性多糖のグルコース重合度をサイズ排除HPLCで分析したところ、数平均重合度が35、重量平均重合度が56と計算された。
英文摘要
Caldicellulosiruptor bescii由来β-1,6-グルコシダーゼ(CbGH30_1)の結晶化条件の最適化を行った。また、同条件において、本酵素の生成物であるグルコースとの複合体の結晶化も行った。X線回折装置を用いて各結晶からの回折強度データを測定した。すでに明らかにされているSalmonella typhimurium由来GH30タンパク質SrfJの構造をモデルとした分子置換法により位相決定を行い、分解能約2オングストロームで構造を決定した。CbGH30_1は他のGH30酵素と同様にTIMバレル構造を持つことが明らかとなった。酵素-生成物複合体において、グルコースはサブサイト-1の位置に結合していると予想された。ラミナリビオース、α-グルコシルフルオリド、α-グルコース 1-リン酸を基質として、HhGH30Aのグライコシンターゼと、Ochromonas danica由来β-1,3-グルカンホスホリラーゼ(β-1,3-グルカン伸長酵素)の反応を同時に行った。その結果、直鎖β-1,3-グルカンの沈殿(α-グルコース 1-リン酸を基質としたβ-1,3-グルカンホスホリラーゼのみの反応で生じる)は生じず、水溶性の多糖が合成された。生成した多糖をエタノール沈澱で回収し、メチル化分析により構造を解析した。その結果、水溶性多糖はβ-1,6-グルコシド結合による分岐を有するβ-1,3-グルカン(β-1,3-1,6-グルカン)であることが明らかとなった。また、この水溶性多糖のグルコース重合度をサイズ排除HPLCで分析したところ、数平均重合度が35、重量平均重合度が56と計算された。
期刊论文(6)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
登录
查看更多内容
ゲノム情報を活用した有用糖質の合成
利用基因组信息合成有用的碳水化合物
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Komatsu Nao, Ishino Yuko, Shirai Rina, Sakata Ken-taro, Tani Motohiro, Maeda Tatsuya, Tanaka Naotaka, Tabuchi Mitsuaki, 磯野直人]
通讯作者:
磯野直人
Halobacillus halophilus由来GH30_1酵素のグライコシンターゼ化
嗜盐芽孢杆菌 GH30_1 酶的糖合酶转化
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[谷柚希, 増村 威宏, 森田 重人, 安田愛梨,三宅英雄,勝崎裕隆,梅川碧里,磯野直人]
通讯作者:
安田愛梨,三宅英雄,勝崎裕隆,梅川碧里,磯野直人
好熱菌由来β-グルコシダーゼ/キシロシダーゼの機能解析
嗜热菌β-葡萄糖苷酶/木糖苷酶的功能分析
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[中井夏穂, 小川恵莉, 石川涼一, 柳原和典, 高木宏基, 磯野直人]
通讯作者:
磯野直人
Caldicellulosiruptor bescii由来 GH30酵素の機能解析
贝斯热纤维素酶 GH30 的功能分析
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[中井夏穂, 小川恵莉, 石川涼一, 柳原和典, 高木宏基, 磯野直人]
通讯作者:
磯野直人
低温度でも低塩濃度でも失活する酵素:変性メカニズムの解明と生理的意義の探求
-
批准号:24K08713
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
-
资助金额:$3.0万
-
财政年份:2024
-
负责人:磯野 直人
-
依托单位:
海外基金