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植物の長鎖非コードRNAが関わる感染防御機構：RNA結合因子からのアプローチ

植物中涉及长链非编码RNA的感染防御机制：RNA结合因子的方法

基本信息

批准号：
19K06711
负责人：
湯川泰
金额：
$ 2.75万
依托单位：
Nagoya City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

ゲノムからは多様な非コードRNA (ncRNA)が転写される。中でも200 塩基を超える長鎖非コード RNA (long ncRNA, lncRNA) の中には細胞の機能と関わった興味深いものがある。申請者は、植物のRNAポリメラーゼ IIIの転写プロモーターに着目して、アブラナ科植物のシロイヌナズナから260塩基長の新規RNAであるAtR8 lncRNAを発見した。RNAポリメラーゼ IIIはtRNAのような細胞機能の根幹をなすRNAを転写するが、環境ストレスに応答した発現制御をしないと思われていた。しかし、AtR8 lncRNAは興味深いことに低酸素ストレスに応答する特徴があった。さらにAtR8 lncRNA遺伝子変異体を用いたマイクロアレイ解析では、このRNAの機能が感染防御およびストレス応答に強く関与することが示された。そこで、3つの目的を設定した。【目的1】AtR8 lncRNA結合タンパク質の同定、【目的2】AtR8 lncRNAの種子形成に関わる機能解析、【目的3】AtR8 lncRNA遺伝子のサリチル酸応答メカニズムの解明、である。【目的1】に関しては、AtR8 lncRNAとタンパク質の複合体を、シロイヌナズナ培養細胞(MM2d株)から単離精製した。AtR8 lncRNAの結合タンパク質の一つとしてHSP70タンパク質が同定され、RNAと果たす整理機能について解析を進めた。【目的2】に関して、AtR8 lncRNAが未熟種子にも多量に蓄積することを見出し、in situ ハイブリダイゼーション法により未熟種子における局在を明らかしにした。【目的3】に関しては、感染防御に関わりの深いWRKY転写因子遺伝子の発現に対してAtR8 lncRNA遺伝子発現が明白な逆相関を示したため、その制御機構について研究を進めた。In vitro転写系を用いた解析の結果、サリチリ酸応答シス配列であるas-1を解した制御が行われていることを示唆する結果を得た。

A variety of non-RNA (ncRNA) are used in the production of DNA. In the middle of the cell, there are 200 pairs of long lock non-female RNA (long ncRNA, lncRNA). The applicant has discovered a new RNA of 260 bp in length for plants of the family Atriaceae. RNA RNA is the root of cell function, and the environment is the root of cell function. AtR8 lncRNA is highly reactive and has a low acid content. AtR8 lncRNA gene is used to detect and analyze the infection, and its RNA function is related to infection prevention.そこで、3つの目的を设定した。[Objective 1] Identification of AtR8 lncRNA binding protein,[Objective 2] Functional analysis of AtR8 lncRNA related to seed formation,[Objective 3] Explanation of AtR8 lncRNA gene binding protein. [Objective 1] To isolate and purify AtR8 lncRNA from cultured cells (MM2d strain). AtR8 lncRNA binding protein quality and HSP70 protein quality and stability, RNA and fruit sorting function [Objective 2] AtR8 lncRNA is accumulated in immature seeds in large quantities. [Objective 3] To further research on the development of AtR8 lncRNA gene and its correlation with infection defense. In vitro, the system is analyzed and the results are obtained.

项目成果

期刊论文数量（16）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

植物の感染防御に働く長鎖非コードRNAの結合タンパク質同定

鉴定在植物感染防御中发挥作用的长非编码RNA结合蛋白

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
賈慧源;呉娟;李爽;湯川泰
通讯作者：
湯川泰

湯川教授の論文が国際学術誌 Plant and Cell Physiology に掲載されました

汤川教授论文发表于国际学术期刊Plant and Cell Physiology

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

University of Delhi South Campus(インド)

德里大学南校区（印度）

DOI：
发表时间：
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

RNA Polymerase III?Dependent BoNR8 and AtR8 lncRNAs Contribute to Hypocotyl Elongation in Response to Light and Abscisic Acid

RNA 聚合酶 III？依赖 BoNR8 和 AtR8 lncRNA 响应光和脱落酸促进下胚轴伸长

DOI：
10.1093/pcp/pcad025
发表时间：
2023
期刊：
Plant And Cell Physiology
影响因子：
4.9
作者：
Zhang Nan;Xu Kai;Liu Shengyi;Yan Rong;Liu Ziguang;Wu Ying;Peng Yifang;Zhang Xiaoxu;Yukawa Yasushi;Wu Juan
通讯作者：
Wu Juan

The Arabidopsis Hypoxia Inducible AtR8 Long Non-Coding RNA also Contributes to Plant Defense and Root Elongation Coordinating with WRKY Genes under Low Levels of Salicylic Acid