移動性分子による経世代的エピジェネティック伝達の制御機構の解明
阐明移动分子跨代表观遗传传递的控制机制
基本信息
- 批准号:22KJ3075
- 负责人:
- 金额:$ 3.08万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2023
- 资助国家:日本
- 起止时间:2023-03-08 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
本研究は、シロイヌナズナへのストレス処理によって誘導されて世代を越えて伝わるエピジェネティックな修飾の確立過程を時系列で捉えることを目的としている。そのためには、少数の細胞もしくは核から、全ゲノム規模のDNAメチル化解析を行う必要がある。しかし、RNAと違ってDNAは1細胞あたりの量が非常に少なく、これまでは技術的に困難であった。本年度は、シロイヌナズナ卵細胞をモデルケースとして、少数細胞からのDNAメチル化解析技術の改良と、卵細胞におけるDNAメチル化プロファイルの詳細な解析を行った。研究代表者は、これまでもバイサルファイト法を用いて卵細胞の全ゲノムメチル化解析を実施していたが、得られたリードのマップ率やゲノムに対するカバー率は低く、改良が必要であった。そこで、本年度は、近年開発された酵素変換法による全ゲノムメチル化解析を試みた。酵素変換法は、TET2およびAPOBECと呼ばれる2つの酵素を使い、非メチル化シトシンをウラシルに変換することでシトシンにおけるメチル化の有無を判定する方法である。バイサルファイト法に比べて穏やかな条件で反応を行うことができるので、DNAの分解が少ないとされている。その結果、バイサルファイト法に比べて高いマップ率が得られ、シーケンスデータあたりのゲノムカバー率も高かった。また、卵細胞で発現しているメチル基転移酵素の変異体からも卵細胞を回収し、シーケンスを実施した。
This study focuses on the process of generation induction and modification. It is necessary to carry out DNA analysis on a full scale, such as, a small number of cells, and nuclear cells. The amount of RNA in a cell is very small, and the technology is difficult. This year, we will improve the DNA analysis technology of egg cells and conduct detailed analysis of egg cells. The research representative pointed out that it is necessary to improve the efficiency of egg cell analysis by using the method of egg cell analysis. This year, the enzyme conversion method was developed in recent years. The enzyme conversion method is a method for determining the presence or absence of an enzyme in a TET2 or APOBEC cell. The method of DNA decomposition is based on the following conditions: The results are higher than those of the previous study. The development of egg cells and the development of allogeneic enzymes in the development of egg cells
项目成果
期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
筒井 大貴其他文献
異科接木のトランスクリプトーム解析
异质嫁接的转录组分析
- DOI:
- 发表时间:
2018 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
岡安 浩次;澤井 優;筒井 大貴;岡田 龍;鈴木 孝征;丹羽 優喜;野田口 理孝 - 通讯作者:
野田口 理孝
基質の硬さに惹起される癌細胞の転写因子NF-kBの発現と活性
基质硬度诱导癌细胞中转录因子NF-kB的表达及活性
- DOI:
- 发表时间:
2011 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
須崎 大地;武内 秀憲;筒井 大貴;椎名 恵子;新田 英之;東山哲也;有松唯;Seiichiro ISHIHARA - 通讯作者:
Seiichiro ISHIHARA
シロイヌナスズナ野生系統がもつ極限低窒素環境適応力を高める移動性シグナル
增强拟南芥野生株对极低氮环境适应性的迁移信号
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
馬渕 敦士;門田 慧奈;野田口 理孝;筒井 大貴;櫻庭 康仁;祢冝 淳太郎;阿部 光知;柳澤 修一;射場 厚 - 通讯作者:
射場 厚
再生生物学と再生医療を考える
关于再生生物学和再生医学的思考
- DOI:
- 发表时间:
2018 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
川勝 弥一;筒井 大貴;柳沢 直樹;澤井 優;池松 朱夏;新田 英之;東山 哲也;野田口 理孝;阿形清和 - 通讯作者:
阿形清和
雌しべの中の道標を辿る花粉管の旅:被子植物が獲得したPRKファミリー受容体の機能
花粉管沿着雌蕊中的路标行进:被子植物获得的 PRK 家族受体的功能
- DOI:
- 发表时间:
2022 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
馬渕 敦士;門田 慧奈;野田口 理孝;筒井 大貴;櫻庭 康仁;祢冝 淳太郎;阿部 光知;柳澤 修一;射場 厚;武内秀憲,別所-上原奏子,長江拓也,井本美紀,内木希美,永原史織,水多陽子,東山哲也 - 通讯作者:
武内秀憲,別所-上原奏子,長江拓也,井本美紀,内木希美,永原史織,水多陽子,東山哲也
筒井 大貴的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('筒井 大貴', 18)}}的其他基金
局所ストレスが茎頂で誘導するDNAメチル化とそれを司る移動性シグナル分子の解析
茎尖局部应激诱导的 DNA 甲基化及其控制的移动信号分子分析
- 批准号:
24K18145 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
RNA可視化技術と接ぎ木デバイスを基盤とした植物の長距離移動性mRNAの動態解析
基于RNA可视化技术和嫁接装置的植物中长距离迁移mRNA动态分析
- 批准号:
17H06744 - 财政年份:2017
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
レーザーインジェクション技術を基盤とした配偶体間相互作用を支える助細胞機能の解明
基于激光注射技术阐明支持配子体间相互作用的协同细胞功能
- 批准号:
11J06264 - 财政年份:2011
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
相似海外基金
Dissection of plant growth and environmental response mechanisms through peptide signaling
通过肽信号传导剖析植物生长和环境响应机制
- 批准号:
23H05477 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
植物環境応答におけるNAD(P)(H)代謝ネットワーク制御の分子基盤
植物环境反应中NAD(P)(H)代谢网络调节的分子基础
- 批准号:
22H02298 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Analysis of plant environmental response through plasmamembrane microdomain
通过质膜微域分析植物环境响应
- 批准号:
26292190 - 财政年份:2014
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
植物19Sプロテアソームによるヒストン修飾を介した環境応答制御機構の解析
植物19S蛋白酶体组蛋白修饰介导的环境响应控制机制分析
- 批准号:
12J07285 - 财政年份:2012
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
植物の環境応答に必須な植物固有の新規ドメイン「MIZ」が統御するオルガネラ動態
由植物环境反应所必需的新型植物特异性结构域“MIZ”调节的细胞器动力学
- 批准号:
19039005 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
リン酸リレー情報伝達系を介した植物の環境応答とオルガネラ分化統御
磷中继信号转导系统介导的植物环境响应和细胞器分化控制
- 批准号:
19039013 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
環境応答に伴う植物カタラーゼのペルオキシゾームヘの輸送調節機構の解明
阐明植物过氧化氢酶响应环境响应转运至过氧化物酶体的调节机制
- 批准号:
19039026 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
液胞と細胞骨格による植物の環境応答および細胞・オルガネラ分化の解析
通过液泡和细胞骨架分析植物环境反应和细胞/细胞器分化
- 批准号:
19039008 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
リン酸リレー情報伝達系を介した植物の環境応答とオルガネラ分化統御
磷中继信号转导系统介导的植物环境响应和细胞器分化控制
- 批准号:
17051015 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
シロイヌナズナのHis-Aspリン酸リレー型シグナル伝達が支配する環境応答機構
拟南芥His-Asp磷酸中继信号主导的环境响应机制
- 批准号:
12142205 - 财政年份:2000
- 资助金额:
$ 3.08万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas