胞巣状軟部肉腫発症メカニズムの包括的解析

胞巣状軟部肉腫では、特異的融合遺伝子としてASPL-TFE3が同定されている。本研究では、転写因子として働くASPL-TFE3の下流標的遺伝子群を網羅的に同定することで、本融合遺伝子が腫瘍発生に導く分子メカニズムを包括的に解明することを目指す。前年度までに、ASPL-TFE3安定発現細胞株である293/TR-AT細胞を用いたクロマチン免疫沈降シークエンス（ChIP-Seq）解析により、ASPL-TFE3が結合するゲノム領域を網羅的に同定した。このChIP-Seq解析結果と既存のDNAマイクロアレイ解析ならびに抗体アレイのデータを組み合わせ、ASPL-TFE3により引き起こされる遺伝子発現変化の全体像を明らかにした。本年度はこの結果をもとに、腫瘍の発症・進展への関与が推察される下流遺伝子群の生物学的影響について検討した。まず、下流遺伝子群にシグナル伝達因子が多数含まれていたことから、発がんに関係するシグナル伝達経路の活性を検討したところ、ASPL-TFE3発現により幾つかの発がん関連シグナル経路の活性亢進が認められた。また、腫瘍細胞の動態に重要であると考えられる下流遺伝子群を抽出して、その影響を内因性ASPL-TFE3発現細胞であるFU-UR1細胞を用いて解析した結果、細胞増殖能および浸潤能を促進する下流遺伝子の存在を確認した。以上より、ASPL-TFE3の下流遺伝子群には、発がんシグナルを増強する因子や、腫瘍細胞の増殖・転移を促進する因子が含まれることが示唆された。

胞巣状軟部肉腫では、特異的融合遺伝子としてASPL-TFE3が同定されている。本研究では、転写因子として働くASPL-TFE3の下流標的遺伝子群を網羅的に同定することで、本融合遺伝子が腫瘍発生に導く分子メカニズムを包括的に解明することを目指す。前年度までに、ASPL-TFE3安定発現細胞株である293/TR-AT細胞を用いたクロマチン免疫沈降シークエンス（ChIP-Seq）解析により、ASPL-TFE3が結合するゲノム領域を網羅的に同定した。このChIP-Seq解析結果と既存のDNAマイクロアレイ解析ならびに抗体アレイのデータを組み合わせ、ASPL-TFE3により引き起こされる遺伝子発現変化の全体像を明らかにした。本年度はこの結果をもとに、腫瘍の発症・進展への関与が推察される下流遺伝子群の生物学的影響について検討した。まず、下流遺伝子群にシグナル伝達因子が多数含まれていたことから、発がんに関係するシグナル伝達経路の活性を検討したところ、ASPL-TFE3発現により幾つかの発がん関連シグナル経路の活性亢進が認められた。また、腫瘍細胞の動態に重要であると考えられる下流遺伝子群を抽出して、その影響を内因性ASPL-TFE3発現細胞であるFU-UR1細胞を用いて解析した結果、細胞増殖能および浸潤能を促進する下流遺伝子の存在を確認した。以上より、ASPL-TFE3の下流遺伝子群には、発がんシグナルを増強する因子や、腫瘍細胞の増殖・転移を促進する因子が含まれることが示唆された。