How do influenza virus vRNAs rolling the nucleoprotein interact with other vRNA segments for vRNA packaging?

滚动核蛋白的流感病毒 vRNA 如何与其他 vRNA 片段相互作用以进行 vRNA 包装？

• 批准号: 18K05980
• 负责人: 鈴木 由紀
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: Nihon University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2018
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2018-04-01 至 2021-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18K05980/
• 关键词: インフルエンザウイルス; ゲノムパッケージング; RNA二次構造; 相互作用; RNA-RNA相互作用; GC-richモチーフ

A型インフルエンザウイルス(IAV)は、異なる遺伝子をコードする8本の分節型vRNAが1つのウイルス粒子に取り込まれることにより、感染性のウイルス粒子が産生される。このvRNAの取り込み機構(ゲノムパッケージング)はヌクレオプロテイン(NP)に巻きついた1本鎖のvRNAが異なるvRNA分節と相互作用することによって起こると推測されている。本研究はNPを巻くvRNAがRNA-RNA相互作用を起こすゲノムパッケージング機構を明らかにすることを目的に、今年度はHAセグメントに注目をしたHAセグメントのパッケージングシグナル領域の配列解析ならびに二次構造予測、およびRNA-RNA相互作用を解析するためのRNA合成などを行なった。H1-16亜型をそれぞれ解析した結果、亜型間で共通してHAの5'末端領域は保存されていたが、亜型内で保存されている塩基配列やそのゲノムポジションは亜型間で異なっていた。例えば、5'末端領域は連続したGCリッチなモチーフ配列が保存される傾向にあったが、GCの配列パターンや長さは亜型間で異なっていた。HAセグメントのパッケージング嗜好性は亜型間で異なることが報告されていることから、このような配列パターンの違いがパッケージングの思考性に関与している可能性が示唆された。また、HAセグメントの二次構造予測を行なったが、どのHA亜型においても5'末端領域で二次構造は予測されなかった。従って、HAセグメントは二次構造を形成しない状態でその他のvRNA分節と相互作用している可能性が示唆された。今後は、予測されたGCリッチモチーフがHAのゲノムパッケージングに関わることを実験的に証明する。また、その他のセグメントにおけるRNA二次構造の解析、ならびにB、C、D型インフルエンザウイルスのパッケージングシグナルを解析し、IAVとの比較解析を行う予定である。

Type A イ ン フ ル エ ン ザ ウ イ ル ス (IAV) は, different な る posthumous son 伝 を コ ー ド す る 8 this の segmental type vRNA が 1 つ の ウ イ ル ス particle に take り 込 ま れ る こ と に よ り, infectious の ウ イ ル が ス particles to produce さ れ る. こ の vRNA の take り 込 み institutions (ゲ ノ ム パ ッ ケ ー ジ ン グ) は ヌ ク レ オ プ ロ テ イ ン (NP) に 巻 き つ い た this lock の vRNA が different な る vRNA segmental と interaction す る こ と に よ っ て up こ る と speculation さ れ て い る. This study は NP を 巻 く vRNA が RNA - RNA interaction を up こ す ゲ ノ ム パ ッ ケ ー ジ ン グ institutions を Ming ら か に す る こ と に を purpose, our は HA セ グ メ ン ト に attention を し た HA セ グ メ ン ト の パ ッ ケ ー ジ ン グ シ グ ナ の ル field match column analysis な ら び に secondary structure can be, お よ び RNA - RNA phase Interaction を analysis するため RNA synthesis な <s:1> を line なった. H1-16 亜 を そ れ ぞ れ parsing し た results, 亜 で overlap among し て HA の 5 'terminal areas は save さ れ て い た が, 亜 で stored in さ れ て い る salt base with column や そ の ゲ ノ ム ポ ジ シ ョ ン は 亜 type で between different な っ て い た. Example え ば, 5 'end field は even 続 し た GC リ ッ チ な モ チ ー フ match column が save さ れ る tendency に あ っ た が, GC の match column パ タ ー ン や long さ は 亜 type で between different な っ て い た. HA セ グ メ ン ト の パ ッ ケ ー ジ ン は グ preference type 亜 で between different な る こ と が report さ れ て い る こ と か ら, こ の よ う な match column パ タ ー ン の violations い が パ ッ ケ ー ジ ン グ の (に masato and し て い が る possibility in stopping さ れ た. ま た, HA セ グ メ ン ト の secondary tectonic line to measure を な っ た が, ど の HA type 亜 に お い て も 5 'terminal areas で secondary tectonic は be さ れ な か っ た. 従 っ て, HA セ グ メ ン ト は formation し secondary tectonic を な い state で そ の he の vRNA segmental と interaction し て い が る possibility in stopping さ れ た. Future は, be さ れ た GC リ ッ チ モ チ ー フ が HA の ゲ ノ ム パ ッ ケ ー ジ ン グ に masato わ る こ と を be 験 に prove す る. ま た, そ の he の セ グ メ ン ト に お け る RNA secondary structure の parsing, な ら び に type B, C, D イ ン フ ル エ ン ザ ウ イ ル ス の パ ッ ケ ー ジ ン グ シ グ ナ ル を analytical し, IAV と の comparative analytical line を う designated で あ る.

项目成果

An endogenous adeno-associated virus element in elephants

大象内源性腺相关病毒元件

• DOI: 10.1016/j.virusres.2018.04.015
• 发表时间: 2019
• 期刊: Virus Research
• 影响因子: 5
• 作者: Kobayashi Yuki;Shimazu Tsukika;Murata Koichi;Itou Takuya;Suzuki Yoshiyuki
• 通讯作者: Suzuki Yoshiyuki

分子進化解析から見えてくるインフルエンザウイルスの感染戦略

分子进化分析揭示流感病毒感染策略

• 发表时间: 2018
• 作者: Kano Rui;Kobayashi Yuki;Nishikawa Akitoyo;Murata Ryo;Itou Takuya;Ito Takaaki;Suzuki Kazuyuki;Kamata Hiroshi;小林由紀
• 通讯作者: 小林由紀

ユビナガコウモリに内在するボルナウイルス由来遺伝子は潜在的に機能性RNA結合タンパク質をコードする

蝙蝠中博尔纳病毒衍生的基因可能编码功能性RNA结合蛋白

• 发表时间: 2018
• 作者: 向井八尋;堀江真行;小林由紀;小嶋将平;前田健;朝長啓造.
• 通讯作者: 朝長啓造.

アフリカ獣上目動物におけるボルナウイルス由来エレメントの蛋白質機能.

非洲兽类中博纳病毒衍生元件的蛋白质功能。

• 发表时间: 2018
• 作者: Kano Rui;Kobayashi Yuki;Nishikawa Akitoyo;Murata Ryo;Itou Takuya;Ito Takaaki;Suzuki Kazuyuki;Kamata Hiroshi;小林由紀;小林由紀
• 通讯作者: 小林由紀

MiR-200b attenuates IL-6 production through IKKβ and ZEB1 in human gingival fibroblasts.

• DOI: 10.1007/s00011-018-1192-1
• 发表时间: 2018-12
• 期刊: Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
• 作者: Matsui S;Zhou L;Nakayama Y;Mezawa M;Kato A;Suzuki N;Tanabe N;Nakayama T;Suzuki Y;Kamio N;Takai H;Ogata Y
• 通讯作者: Ogata Y