石綿関連悪性中皮腫の次世代シークエンスで同定した融合遺伝子の発癌・治療標的性解析
通过新一代测序鉴定的石棉相关恶性间皮瘤融合基因的致癌和治疗靶点分析
基本信息
- 批准号:18K10046
- 负责人:
- 金额:$ 2.83万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:2018
- 资助国家:日本
- 起止时间:2018-04-01 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
近年、悪性中皮腫症例において発癌のドライバー遺伝子と考えられる融合遺伝子が続々と同定されてきた。これらの融合遺伝子は、ALK融合遺伝子群(ALK-EML4、ALK-TPM1、ALK-STRN、ALK-ATG16L1、ALK-NBEA)とEWSR1・ATF1融合遺伝子群(EWSR1-YY1、EWSR1-ATF1、ATF1-FUS)とに主に分けられる。このなかでALK-EML4融合遺伝子は肺癌の原因遺伝子としても知られている。ALK融合遺伝子陽性肺癌に対しては、ALKチロシンキナーゼ阻害薬が高い治療効果を示すことが確認されており、既に5種類の阻害薬が承認されている。これらの阻害薬は、上述のALK融合遺伝子陽性悪性中皮腫においても奏功する可能性が期待される。また、最近では、稀な多嚢胞性腹膜中皮腫の症例において、TNS3-MAP3K3、ZFPM2-ELF5融合遺伝子も同定されている。これらの融合遺伝子を形成するパートナー遺伝子の片方と別の遺伝子との間の融合遺伝子も悪性中皮腫において発癌に関与している可能性があり、我々は悪性中皮腫細胞株をRNA-seq解析で改めて網羅的に探索した結果、先に見出されていたALK融合遺伝子2種類(ALK-SDC1、ALK-RAB3B)以外にFUS融合遺伝子が2種類(FUS-FTH1P8、FUS-RP5-857K21.4)、TPM1融合遺伝子が4種類(TPM1-PCBD2、TPM1-TPM2、TPM1-RP5-857K21.4、TPM1-CTD-2165H16.1)、EML4融合遺伝子が1種類(EML4-SNX7)、TNS3融合遺伝子が1種類(TNS3-RP11-93K22.13)、それぞれ見い出された。特にFUSは様々な腫瘍において発癌に関与していると考えられる融合遺伝子を形成していることが知られており、注目される。
Cases in recent years, 悪 swollen in a に お い て 発 carcinoma の ド ラ イ バ ー posthumous son 伝 と exam え ら れ る fusion heritage 伝 son が 続 々 と with fixed さ れ て き た. Youdaoplaceholder5 れら the owner of the 伝 subgroup <e:1> of the <s:1> fusion heritage, the 伝 subgroup of the ALK fusion heritage (alK-EMl4, alK-tPM1, alK-strn, alK-ATg16L1, alK-nbea) と the 伝 subgroup of the EWSR1 · ATF1 fusion heritage (ewsr1-YY1, ewsr1-ATf1, atf1-fus) とに Youdaoplaceholder0 points けられる. <s:1> な で でALK-EML4 fusion remnant 伝 offspring る lung cancer <s:1> cause remnant 伝 offspring と て て knowledge られて る る る. Traces of ALK fusion 伝 child positive lung cancer に し seaborne て は, ALK チ ロ シ ン キ ナ ー ゼ resistance against 薬 が high い treatment services fruit を shown す こ と が confirm さ れ て お り, both に 5 kinds の resistance against 薬 が admitted さ れ て い る. The possibility of <s:1> inhibition of harmful drugs れら and the positive 悪 mesomatoma of the above-mentioned <s:1> ALK fusion 伝 offspring にお て て する performance する が is expected to be される. Youdaoplaceholder0, recently で で, rare な polycystic peritoneal mesoderma cases にお にお て て, TNS3-MAP3K3, ZFPM2-ELF5 fusion progeny 伝 されて る る る. こ れ ら の fusion heritage 伝 son を form す る パ ー ト ナ ー posthumous son 伝 の piece side と don't の posthumous son 伝 と の の fusion between heritage 伝 son も 悪 sex of swollen に お い て 発 carcinoma に masato and し て い る possibility が あ り, I 々 は 悪 swollen cell lines を RNA in sex - seq parsing で change め て snare に explore し た out results, first に さ れ て い た ALK fusion 伝 2 son In addition to the species (ALK-SDC1, ALK-RAB3B), there are にFUS fusion progeny 伝 が2 species (fus-fth1p8, fus-RP5-857K21.4) and TPM1 fusion progeny 伝 4 species (tPM1-pcbD2, tPM1-TPM2, tPM1-RP5-857k21.4). TPM1-CTD-2165H16.1), EML4 fusion remnant 伝 subtype が1 (emL4-snx7), TNS3 fusion remnant 伝 subtype が1 (tnS3-RP11-93k22.13), それぞれ are found in された. Special に FUS は others 々 な swollen sores に お い て 発 carcinoma に masato and し て い る と exam え ら れ る fusion heritage 伝 son を form し て い る こ と が know ら れ て お り, striking さ れ る.
项目成果
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