核膜孔複合体構成因子ELYSによるヌクレオソームの認識機構解析
核膜孔複合体構成因子ELYSによるヌクレオソームの認識機構解析
批准号:
18K14626
负责人:
小林 航
金额:
$2.66万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份:
2018
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2018-04-01 至 2019-03-31
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染色体分配において、細胞核を構成する核膜と核膜孔は一度崩壊した後、それらが再形成される。その過程において、核膜孔複合体構成因子であるELYSタンパク質はヌクレオソームに結合し、核膜孔複合体構成因子をリクルートすることで、核膜孔再形成の起点を形成する。しかし、ELYSがどのようにヌクレオソームを認識し結合するのか、その様式は明らかでない。そこで本研究は、ELYS-ヌクレオソーム複合体を試験管内で再構成し、核膜孔複合体構成因子ELYSによるヌクレオソームの認識機構を構造生物学的解析により明らかにすることを目的とした。ELYSは巨大分子であるため、全長での精製は困難であることが予想された。そこで、ヌクレオソームとの結合領域であるELYSのC末端領域(以下ELYSC)をリコンビナントタンパク質として精製した。ELYSCをヌクレオソームと混合し、ELYSC-ヌクレオソーム複合体をスクロース密度勾配遠心法と架橋剤による化学架橋を組み合わせたGrafix法により精製した。精製したELYSC-ヌクレオソーム複合体をクライオ電子顕微鏡により撮影し、得られた画像の単粒子解析を行った。その結果、ELYSC-ヌクレオソーム複合体の立体構造を4.3 オングストロームの分解能で決定することに成功した。解析の結果、ELYSはヌクレオソームの表面に存在する酸性領域に結合することが明らかになった。クロスリンキング質量分析による解析を行った結果、ELYSはヌクレオソームの酸性領域を構成するヒストンH2AおよびH2Bの残基と相互作用することがわかった。以上の結果より、ELYSはヌクレオソームの酸性領域を足場として結合し、核膜孔複合体構成因子をクロマチン上にリクルートするというモデルが考えられた。本研究成果をまとめ、Communications Biology誌に筆頭著者として発表した。
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Biochemical analyses of human and plant RAD51 proteins on nucleosome
核小体上人类和植物 RAD51 蛋白的生化分析
DOI:
--
发表时间:
2018
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kobayashi, W., Ishii, H., Takizawa, Y., and Kurumizaka, H.]
通讯作者:
H.
RAD51-単鎖DNA-ヌクレオソーム複合体の構造生物学的解析
RAD51-单链DNA-核小体复合物的结构生物学分析
DOI:
--
发表时间:
2018
期刊:
影响因子:
--
作者:
[小林航, 石井初芽, 滝沢由政, 胡桃坂仁志]
通讯作者:
胡桃坂仁志
胡桃坂研究室ホームページ
车见坂研究所主页
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Structural and biochemical analyses of the nuclear pore complex component ELYS identify residues responsible for nucleosome binding
核孔复合体成分 ELYS 的结构和生化分析确定了负责核小体结合的残基
DOI:
10.1038/s42003-019-0385-7
发表时间:
2019
期刊:
Communications Biology
影响因子:
5.9
作者:
[Kobayashi Wataru, Takizawa Yoshimasa, Aihara Maya, Negishi Lumi, Ishii Hajime, Kurumizaka Hitoshi]
通讯作者:
Kurumizaka Hitoshi
Development of iPS cell-derived normal mitochondria transplantation method for optic nerve diseases.
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批准号:23K09002
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2023
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负责人:小林 航
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依托单位:
iPS細胞由来立体網膜組織を用いた常染色体優性視神経萎縮症の病態解明
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批准号:18H06259
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项目类别:Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
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资助金额:$1.91万
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财政年份:2018
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负责人:小林 航
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依托单位:
クロマチン構造上における減数分裂期組換えの分子機構
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批准号:13J03652
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$2.05万
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财政年份:2013
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负责人:小林 航
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依托单位:
スピンエントロピー逆流機構によるN型酸化物熱電変換材料の設計と合成
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批准号:03J01196
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.73万
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财政年份:2003
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负责人:小林 航
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依托单位:
海外基金