G x E Genome-wide association studies for Nitrogen use efficiency in rice
G x E Genome-wide association studies for Nitrogen use efficiency in rice
批准号:
19F19103
负责人:
松岡 信
金额:
$1.47万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2019
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2019-04-25 至 2021-03-31
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窒素(N)は作物に取って必須な元素であり、作物収量を向上させるために肥料として膨大量が毎年土壌中に投入され続けている。しかし近年、環境保持の観点から、N低投与でも収量が維持出来る新品種開発が希求されている。本研究はこの課題に答えるために、N肥料の投与に呼応して収量増減を制御する遺伝子についてゲノムワイド相関解析(GWAS)により単離及び解析し、機能について研究を行い、N量変動がどのような機構で収量に影響を与えるかについて分子生物学的、分子遺伝学的レベルでの解明を目指す。2020年シーズンおよびそれ以前の穂形質に関わる様々なデータを改めて纏めなおした結果、「一穂当たりの二次枝梗数」について、多肥料区と低肥料区において有意に反応性を変化させる座を染色体4番長腕に見出した。このピークに着目して候補領域を詳細に解析した結果、葉幅を制御するQTLとして報告されていたNAL1遺伝子の関与が期待された。N多肥区では収量は全体的に増加する一方、小肥区は減少する。ここでNAL1が窒素施肥に応答して「一穂当たりの二次枝梗数」を変化させたと言うことは、施肥効果が「二次枝梗数の増加」を介して着粒数に影響を与えることを示唆する。一方、これまでの作物学的知見から、N施肥は穂数増加に大きく貢献することが知られている。実際、我々の異なるパネルを使ったGWAS結果は、NAL1が「草型(穂重型か穂数型か)」や「一株穂数」を制御することが確認された。以上の結果はNAL1が窒素応答の鍵となる遺伝子であること、さらにはその効果は「一穂当たりの二次枝梗数」を介して「着粒数」増加をもたらすことを示唆したが、一方で「一株穂数」にも同遺伝子が関与することを示唆するデータも得られた。今後は、NAL1が両方の形質に直接的に関与するのか、何らかの機構を介してどちらかの形質については二次的に制御しているかを検討する必要がある。
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GWAS with principal component analysis (PCA) reveals a novel gene comprehensively controlling rice architecture.
GWAS 与主成分分析(PCA)揭示了一种全面控制水稻结构的新基因。
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Matsuoka, M.]
通讯作者:
M.
DOI:
10.1073/pnas.1904964116
发表时间:
2019-10-15
期刊:
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
影响因子:
11.1
作者:
[Yano, Kenji, Morinaka, Yoichi, Matsuoka, Makoto]
通讯作者:
Matsuoka, Makoto
Genome‐wide expression quantitative trait loci studies facilitate isolation of causal genes controlling panicle structure
全基因组表达数量性状位点研究有助于分离控制穗结构的因果基因
DOI:
10.1111/tpj.14726
发表时间:
2020
期刊:
The Plant Journal
影响因子:
--
作者:
[Wang Fanmiao, Yano Kenji, Nagamatsu Shiro, Inari‐Ikeda Mayuko, Koketsu Eriko, Hirano Ko, Aya Koichiro, Matsuoka Makoto]
通讯作者:
Matsuoka Makoto
Genome-wide association study using whole-genome sequencing rapidly identifies new genes regulating agronomic traits in rice.
使用全基因组测序的全基因组关联研究可快速识别调节水稻农艺性状的新基因。
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Matsuoka, M.]
通讯作者:
M.
GWAS with PCA for isolating novel genes comprehensively controlling rice architecture.
GWAS 与 PCA 用于分离全面控制水稻结构的新基因。
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Matsuoka, M.]
通讯作者:
M.
次世代GWASによる環境変動応答遺伝子の探索
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批准号:23K23560
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$4.83万
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财政年份:2024
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负责人:松岡 信
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依托单位:
Searching for genes responsible for adapting to environmental change using next-generation GWAS
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批准号:22H02294
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.07万
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财政年份:2022
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负责人:松岡 信
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依托单位:
タバコの形態形成に関与する遺伝子の単離と機能解析
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批准号:07270209
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.05万
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财政年份:1995
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负责人:松岡 信
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依托单位:
高温下での超微粒子の生成と制御
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批准号:62306019
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项目类别:Grant-in-Aid for Co-operative Research (B)
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1987
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负责人:松岡 信
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依托单位:
噴霧燃焼系から排出される炭素状微粒子の性状と変異原性に関する研究
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批准号:57460094
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)
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资助金额:$4.74万
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财政年份:1982
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负责人:松岡 信
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依托单位:
噴霧燃焼における微粒子の生成・消滅過程の体系的研究
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批准号:X00070----442022
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (A)
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资助金额:$16.77万
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财政年份:1979
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负责人:松岡 信
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依托单位:
火花点火機関の排気特性に関する研究
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批准号:X00040----310309
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项目类别:Grant-in-Aid for Special Project Research
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资助金额:$5.18万
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财政年份:1978
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负责人:松岡 信
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依托单位:
火花点火機関の排気特性に関する研究
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批准号:X00040----211007
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项目类别:Grant-in-Aid for Special Project Research
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资助金额:$5.12万
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财政年份:1977
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负责人:松岡 信
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依托单位:
火花点火機関の排気特性に関する研究
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批准号:X00040----111806
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项目类别:Grant-in-Aid for Special Project Research
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资助金额:$3.2万
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财政年份:1976
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负责人:松岡 信
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依托单位:
火花点火機関の燃焼過程に関する研究
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批准号:X44090-----85042
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1969
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负责人:松岡 信
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依托单位:
火花点火機関の燃焼過程に関する研究
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批准号:X43090-----85031
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.32万
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财政年份:1968
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负责人:松岡 信
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依托单位:
国内基金
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天麻高密度遗传图谱的构建及巴利森苷QTL定位
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批准号:JCZRLH202600717
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项目类别:省市级项目
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批准年份:2026
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负责人:
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依托单位:
基于QTL定位和多组学分析挖掘调控莲藕粉脆质地关键基因
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批准号:JCZRQN202501129
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:
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依托单位:
地被菊花期性状QTL精细定位与候选基因挖掘
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批准号:2025JJ60184
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:杨宇杰
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依托单位:
水稻耐寒QTL基因OsCTS11的克隆与分子机制解析
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批准号:QN25C130017
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:李志涛
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依托单位:
低镉QTL-qCd2.2的遗传解析及其互斥连锁簇改造
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批准号:2025JJ60174
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:李兰英
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依托单位:
玉米籽粒蛋白质含量主效QTL-qTPC1的克隆、功能分析及其育种价值研究
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批准号:2025JJ50165
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:黄成
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依托单位:
水稻幼苗期耐盐主效 QTL qSR12 的功能分析
与耐盐机理研究
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批准号:Q24C060008
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2024
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负责人:段敏
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依托单位:
控制甘蓝型油菜叶原基间隔的主效QTL qPlastochron.A02图位克隆及功能验证
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批准号:
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:30万元
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批准年份:2024
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负责人:秦梦凡
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依托单位:
猪12号染色体影响初生重主效QTL的分子遗传机理解析
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:15.0万元
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批准年份:2024
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负责人:郑恩琴
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依托单位:
棉花陆海渐渗系纤维长度稳定QTL qGbFL-A09-1的精细定位及候选
基因鉴定
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2024
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负责人:
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依托单位: