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Regulation of secondary structure by RNA loop-loop interaction inducedsmall molecular binding

Regulation of secondary structure by RNA loop-loop interaction inducedsmall molecular binding
RNA环-环相互作用诱导小分子结合调节二级结构
批准号：
24655154
负责人：
NAKATANI Kazuhiko
金额：
$2.58万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
财政年份：
2012
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2012 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-24655154/
关键词：
生体認識機能化学RNA小分子ループヘアピン

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In this study, we have challenged to modulate the secondary structure of RNA possessing two hairpin loops by small molecular binding. The molecule naphthyridine tetramer (NCT6) was found to bind two hairpin RNA possessing (CGG)3 sequence and make two RNA interacted. By using two hairpin RNA in one RNA construct, we have succeeded to induce secondary structural change by the binding of NCT6. The structural change was evidenced by observing FRET upon treating with NCT6.
期刊论文(11)
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会议论文
High-throughput Screening of Chemical Libraries for the Discovery of RNA-binding Compounds, RNA 2012
用于发现 RNA 结合化合物的化学文库高通量筛选，RNA 2012
DOI： --
发表时间： 2012
期刊：
影响因子： --
作者： [村田亜沙子, 福澄岳雄, 原田恭枝, 梅本詩織, 中谷和彦]
通讯作者： 中谷和彦
Synthesis of Small Molecule Library for pre-miRNA Secondary Structures, RNA 2012
pre-miRNA 二级结构小分子文库的合成，RNA 2012
DOI： --
发表时间： 2012
期刊：
影响因子： --
作者： [福澄岳雄, 村田亜沙子, 原田恭枝, 中谷和彦]
通讯作者： 中谷和彦
Small Organic Molecules Regulating RNA Structure and Function "
调节RNA结构和功能的有机小分子》
DOI： --
发表时间： 2013
期刊：
影响因子： --
作者： [Tanaka, K., Kitadani, M., Tsutsui, A., Pradipta, AR., Imamaki, R., Kitazume, S., Taniguchi, N., Fukase K., Kazuhiko Nakatani]
通讯作者： Kazuhiko Nakatani
A dimeric form of N-methoxycarbonyl-2-amino-1,8-naphthyridine bound to the A-A mismatch in the CAG/CAG base triad in dsRNA
N-甲氧基羰基-2-氨基-1,8-萘啶的二聚体形式与 dsRNA 中 CAG/CAG 碱基三联体中的 A-A 错配结合
DOI： --
发表时间： 2013
期刊： Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters
影响因子： --
作者： [Nakatani, Kazuhiko, Toda, Mariko, He, Hanping]
通讯作者： He, Hanping
共 7 条
    Chemical Biology Studies on Trinucleotide Repeat Disease using Repeat-Binding Molecules
    • 批准号：
      26000007
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Specially Promoted Research
    • 资助金额：
      $252.43万
    • 财政年份：
      2014
    • 负责人：
      NAKATANI Kazuhiko
    • 依托单位：
      Osaka University
    Determination of molecular mechanism of loop-specific structural change and inhibitory effect for Dicer mediated reaction
    • 批准号：
      25620134
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.58万
    • 财政年份：
      2013
    • 负责人：
      NAKATANI Kazuhiko
    • 依托单位：
      Osaka University
    Synthesis of 8-substituted purine chemical library and riboswitch-reengineering
    • 批准号：
      23241073
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
    • 资助金额：
      $31.53万
    • 财政年份：
      2011
    • 负责人：
      NAKATANI Kazuhiko
    • 依托单位：
      Osaka University
    Functional Control by Modulating the Nucleic Acid Structure Based on Mismatch Base Pair Stabilization
    • 批准号：
      18105006
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
    • 资助金额：
      $72.38万
    • 财政年份：
      2006
    • 负责人：
      NAKATANI Kazuhiko
    • 依托单位：
      Osaka University
    海外基金