Characterization of basic structure and function of a new ribozyme linking groups of subviral RNA pathogen

亚病毒RNA病原体的新型核酶连接基团的基本结构和功能的表征

基本信息

  • 批准号:
    24658036
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.58万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
  • 财政年份:
    2012
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2012-04-01 至 2014-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Subviral RNA pathogen is a group of small RNA consisting of viroid which replicates autonomously depending on host transcription machinery and virus satellite RNA which replicates depending on host virus. Among them, viroid and viroid-like small circular satellite RNA are thought to be a same origin because they share similar molecular size, structure, and functions such as ribozyme activity.Here in this research, we have analyzed a new viroid-like small circular RNA isolated from mulberry (Morus alba) cultivated in China on the molecular structures, genetic diversity and new ribozyme activity found in the minus strand, and detected a couple of mutations which could change the potential of ribozyme activity. Taking the lacking of ability to replicate autonomously and the structural similarity of new ribozyme to hairpin-ribozyme in considerations, Mulberry small circular RNA can be placed in small circular viral satellite RNA group.
亚病毒RNA病原体是一类由依赖宿主转录机制自主复制的类病毒和依赖宿主病毒复制的病毒卫星RNA组成的小分子RNA。其中类病毒和类病毒小环卫星RNA由于具有相似的分子大小、结构和功能(如核酶活性)而被认为是同源的,本研究对从桑葚中分离的一种新的类病毒小环卫星RNA进行了分析(Morus alba)的分子结构、遗传多样性和新发现的负链核酶活性,并检测到几个可能改变核酶活性潜力的突变。考虑到新型核酶缺乏自主复制能力以及与发夹状核酶结构相似,桑葚小分子环状RNA可归入小分子环状病毒卫星RNA组。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Molecular ecology of viroids and viroid diseases of crop plants
类病毒和作物类病毒病害的分子生态学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Tsuda S;Sano T;高橋英樹・荒川竜行・西村光由・安藤杉尋・吉田重信・對馬誠也・百町満朗;安藤杉尋・對馬誠也・吉田重信・小林隆・伊藤豊彰・長谷修・生井恒雄・高橋英樹;Teruo Sano
  • 通讯作者:
    Teruo Sano
Current status of viroid disease epidemics in the world
世界类病毒病流行现状
  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Tsuda S;Sano T;高橋英樹・荒川竜行・西村光由・安藤杉尋・吉田重信・對馬誠也・百町満朗;安藤杉尋・對馬誠也・吉田重信・小林隆・伊藤豊彰・長谷修・生井恒雄・高橋英樹;Teruo Sano;高橋英樹・安藤杉尋・清水将文・百町満朗・岩本 豊・相野公孝・松浦克成・浅野峻介・平山喜彦・對馬誠也・吉田重信;Teruo Sano
  • 通讯作者:
    Teruo Sano
Threats to Japanese agriculture from newly emerged plant viruses and viroids
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  • 资助金额:
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