Molecular mechanisms of replication and pathogenicity of viroid -non-coding RNA pathogen

类病毒非编码RNA病原体复制和致病性的分子机制

• 批准号: 18380028
• 负责人: SANO Teruo
• 金额: $ 10.53万
• 依托单位: Hirosaki University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18380028/
• 关键词: ウイロイド; ノンコーディングRNA; RNAサイレンシング; siRNAシークエンス; RNAサイレンシンダ; siRNA; RNA2次構造予測; 遺伝的アルゴリズム; RNA共通二次構造予測; カルコン合成酵素遺伝子; Cofolgaアルゴリズム; CHS

ノンコーディングRNA病原体"ウイロイド"の自己複製能と病原性をRNAサイレンシングの観点から解析した。ウイロイド感染植物に誘導されるウイロイドを標的とするRNAサイレンシングにより、ウイロイド分子は少なくとも5箇所のホットスポットが標的となり分解され、多様なウイロイド特異的small RNAが宿主細胞内に蓄積することを明らかにした。ウイロイドは想像以上に複雑な機構でRNAサイレンシングの標的になっていると考えられるRNA配列の類似性を基に2次構造を予測する新しいプログラムを開発し、RNAの自己複製と分子構造の関連性を解析するための基盤を構築した。

Analysis of RNA Pathogen Replication and Pathogenic RNA Pathogenesis It infects plants and induces RNA expression in the host cell. The RNA expression in the host cell is characterized by a small number of RNA molecules that are specific to the host cell. It is believed that the RNA replication mechanism can be used to predict the second order structure of RNA replication.

项目成果

An efficient genetic algorithm for structural RNA pairwise alignment and its annlication to non-coding RNA discovery in yeast

一种用于结构 RNA 成对比对的高效遗传算法及其在酵母中非编码 RNA 发现中的应用

• 发表时间: 2008
• 期刊: BMC Bioinformatics 9
• 作者: Taneda;A
• 通讯作者: A

Mawassi, M. and Bar-Joseph, M. : Construction of a multiprobe for the simultaneous detection of viroids infecting citrus trees

Mawassi, M. 和 Bar-Joseph, M.：构建用于同时检测感染柑橘树的类病毒的多探针

• 发表时间: 2006
• 期刊: Virus Genes 33
• 作者: Cohen;O.;Batuman;O.;Stanbekova;G.;Sano;T.
• 通讯作者: T.

日本のキク品種におけるキククロロティックモットルウイロイドの病徴

日本菊花品种菊花褪绿斑驳类病毒的症状

• 发表时间: 2007
• 作者: 崔海東;山本英樹;佐野輝男
• 通讯作者: 佐野輝男

温遺伝子増幅法(ICAN法)を用いたキク矮化ウイロイドの発生圃場調査

温基因扩增法（ICAN法）对菊花矮化类病毒的田间调查

• 发表时间: 2006
• 作者: 磯野清香;佐野輝男;忠英一;上森隆司;向井博之
• 通讯作者: 向井博之

種子の科学とバイオテクノロジー(第4章4-4を担当)

种子科学与生物技术（负责第4章4-4）

• 发表时间: 2009
• 作者: Kawai-Yamada;M.;Hori;Z.;Ogawa;T.;Ihara-Ohori;Y.;Tamura;T.;Nagano;M.;Ishikawa;T.;Uchimiya;H.;千田峰生;千田峰生
• 通讯作者: 千田峰生