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Molecular mechanisms of replication and pathogenicity of viroid -non-coding RNA pathogen

Molecular mechanisms of replication and pathogenicity of viroid -non-coding RNA pathogen
类病毒非编码RNA病原体复制和致病性的分子机制
批准号：
18380028
负责人：
SANO Teruo
金额：
$10.53万
依托单位：
Hirosaki University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2006
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2006 至 2008
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18380028/
关键词：
ウイロイドノンコーディングRNARNAサイレンシングsiRNAシークエンスRNAサイレンシンダsiRNARNA2次構造予測遺伝的アルゴリズムRNA共通二次構造予測カルコン合成酵素遺伝子CofolgaアルゴリズムCHS

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ノンコーディングRNA病原体"ウイロイド"の自己複製能と病原性をRNAサイレンシングの観点から解析した。ウイロイド感染植物に誘導されるウイロイドを標的とするRNAサイレンシングにより、ウイロイド分子は少なくとも5箇所のホットスポットが標的となり分解され、多様なウイロイド特異的small RNAが宿主細胞内に蓄積することを明らかにした。ウイロイドは想像以上に複雑な機構でRNAサイレンシングの標的になっていると考えられるRNA配列の類似性を基に2次構造を予測する新しいプログラムを開発し、RNAの自己複製と分子構造の関連性を解析するための基盤を構築した。
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会议论文
An efficient genetic algorithm for structural RNA pairwise alignment and its annlication to non-coding RNA discovery in yeast
一种用于结构 RNA 成对比对的高效遗传算法及其在酵母中非编码 RNA 发现中的应用
DOI： --
发表时间： 2008
期刊： BMC Bioinformatics 9
影响因子： --
作者： [Taneda, A]
通讯作者： A
Mawassi, M. and Bar-Joseph, M. : Construction of a multiprobe for the simultaneous detection of viroids infecting citrus trees
Mawassi, M. 和 Bar-Joseph, M.：构建用于同时检测感染柑橘树的类病毒的多探针
DOI： --
发表时间： 2006
期刊： Virus Genes 33
影响因子： --
作者： [Cohen, O., Batuman, O., Stanbekova, G., Sano, T.]
通讯作者： T.
日本のキク品種におけるキククロロティックモットルウイロイドの病徴
日本菊花品种菊花褪绿斑驳类病毒的症状
DOI： --
发表时间： 2007
期刊：
影响因子： --
作者： [崔海東, 山本英樹, 佐野輝男]
通讯作者： 佐野輝男
温遺伝子増幅法(ICAN法)を用いたキク矮化ウイロイドの発生圃場調査
温基因扩增法（ICAN法）对菊花矮化类病毒的田间调查
DOI： --
发表时间： 2006
期刊：
影响因子： --
作者： [磯野清香, 佐野輝男, 忠英一, 上森隆司, 向井博之]
通讯作者： 向井博之
共 44 条
    Pathogenicity of viroid - circular RNA pathogen; Analysis of destructive effects of viroid infection on a host miRNA/gene expression network
    • 批准号：
      15H04455
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $10.82万
    • 财政年份：
      2015
    • 负责人：
      SANO Teruo
    • 依托单位：
      Hirosaki University
    Analysis of cultivar- and tissue-specific biogenesis of viroid-specific small RNA in relation to viroid pathogenicity
    • 批准号：
      24380026
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $12.23万
    • 财政年份：
      2012
    • 负责人：
      SANO Teruo
    • 依托单位：
      Hirosaki University
    Characterization of basic structure and function of a new ribozyme linking groups of subviral RNA pathogen
    • 批准号：
      24658036
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.58万
    • 财政年份：
      2012
    • 负责人：
      SANO Teruo
    • 依托单位：
      Hirosaki University
    Large scale sequencing analysis of microbial diversity in phyllo-and rhizo-sphares of apple trees for investigation of the mechanism to acquire natural immunity under natural farming practices
    • 批准号：
      22658012
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.27万
    • 财政年份：
      2010
    • 负责人：
      SANO Teruo
    • 依托单位：
      Hirosaki University
    海外基金